More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00662 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00662  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase III  100 
 
 
351 aa  726    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001811  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  84.41 
 
 
340 aa  609  1e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  65.61 
 
 
357 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0329  glycosyl transferase family protein  52.16 
 
 
348 aa  380  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  48.25 
 
 
356 aa  350  2e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  48.25 
 
 
373 aa  350  3e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3896  glycosyl transferase family protein  46.04 
 
 
340 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4100  glycosyl transferase family protein  46.33 
 
 
340 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.240394 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3897  glycosyl transferase family protein  46.47 
 
 
347 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0102  glycosyl transferase family protein  45.1 
 
 
350 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.0000136303 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4678  heptosyl transferase glycosyltransferase family 9 protein  46.04 
 
 
347 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3988  glycosyl transferase family protein  45.75 
 
 
340 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0785  glycosyl transferase family protein  42.57 
 
 
347 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0111  glycosyl transferase family protein  45.45 
 
 
359 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3611  glycosyl transferase family protein  44.71 
 
 
348 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0070  glycosyl transferase family protein  45 
 
 
347 aa  301  8.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4336  glycosyl transferase family protein  45.27 
 
 
347 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4281  glycosyl transferase family 9  45.27 
 
 
347 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000734262 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0062  glycosyl transferase family protein  45.13 
 
 
354 aa  299  5e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.982764  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4476  glycosyl transferase family protein  44.97 
 
 
347 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3934  glycosyl transferase family protein  44.87 
 
 
343 aa  296  3e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.157476  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3702  glycosyl transferase family protein  44.81 
 
 
359 aa  293  3e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00062  putative ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  43.11 
 
 
334 aa  286  4e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0109  glycosyl transferase family protein  43.92 
 
 
342 aa  286  5e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0307  glycosyl transferase family 9  38.11 
 
 
374 aa  280  2e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2806  glycosyl transferase family protein  40.11 
 
 
362 aa  275  9e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.629835 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1695  glycosyl transferase family protein  42.39 
 
 
336 aa  268  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0016  glycosyl transferase family protein  38.3 
 
 
357 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1358  saccharide biosynthesis regulatory protein  34.8 
 
 
350 aa  251  1e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1293  glycosyl transferase family protein  34.8 
 
 
350 aa  251  1e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2260  glycosyl transferase family protein  37.72 
 
 
364 aa  239  4e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02452  heptosyl transferase, glycosyltransferase family 9 protein  35.8 
 
 
340 aa  231  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0849  glycosyl transferase family 9  36.14 
 
 
348 aa  231  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0081  heptosyltransferase family protein  35.09 
 
 
351 aa  224  2e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0197496  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2105  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase  34.8 
 
 
351 aa  222  7e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2749  hypothetical protein  35.24 
 
 
349 aa  213  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2622  hypothetical protein  34.67 
 
 
349 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  27.48 
 
 
779 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.79 
 
 
343 aa  105  9e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2729  glycosyl transferase family protein  25.26 
 
 
321 aa  102  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637215  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1363  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  25.65 
 
 
394 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.824879  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1203  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.65 
 
 
390 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1212  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.65 
 
 
390 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1907  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  25.65 
 
 
390 aa  99.8  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0333  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  25.65 
 
 
390 aa  99.8  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1050  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  25.65 
 
 
390 aa  99.8  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702156  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  24.41 
 
 
354 aa  99.8  7e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0818  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  25.65 
 
 
390 aa  99.8  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0990  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  27 
 
 
458 aa  97.8  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  28.11 
 
 
330 aa  97.4  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  26.14 
 
 
347 aa  96.7  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5653  glycosyl transferase family protein  26.45 
 
 
404 aa  96.3  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.680336  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2252  heptosyltransferase family protein  24.32 
 
 
370 aa  94.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.548459  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2334  glycosyl transferase family protein  26.05 
 
 
392 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0453286 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.17 
 
 
359 aa  93.2  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25 
 
 
361 aa  92.4  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1699  glycosyl transferase family protein  25.72 
 
 
392 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2311  glycosyl transferase family protein  25.72 
 
 
392 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2728  glycosyl transferase family protein  28.08 
 
 
316 aa  92  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.802398  normal  0.174728 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.62 
 
 
367 aa  91.3  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0852  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  23 
 
 
387 aa  90.5  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3647  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  23.29 
 
 
397 aa  90.1  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  20.73 
 
 
360 aa  90.1  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0965  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.92 
 
 
392 aa  90.1  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199318  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25 
 
 
361 aa  89.4  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2230  glycosyl transferase family protein  24.84 
 
 
402 aa  89.4  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408101  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2713  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  22.71 
 
 
349 aa  89  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  21.2 
 
 
364 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3516  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  23 
 
 
387 aa  89  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3108  glycosyl transferase family 9  30.51 
 
 
358 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  25.14 
 
 
356 aa  88.6  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2350  glycosyl transferase family protein  24.84 
 
 
475 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4375  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.18 
 
 
356 aa  86.7  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.05 
 
 
359 aa  86.7  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4091  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.21 
 
 
361 aa  86.3  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  21.33 
 
 
352 aa  85.1  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  22.12 
 
 
362 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4003  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.73 
 
 
356 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.043966  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.13 
 
 
352 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0069  glycosyl transferase family 9  26.27 
 
 
345 aa  84.3  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.960845  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.12 
 
 
332 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0742  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  27.61 
 
 
393 aa  84  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.010597  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3922  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.38 
 
 
356 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0304832  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  25.99 
 
 
406 aa  84  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3940  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.38 
 
 
356 aa  83.2  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.465225  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4048  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.38 
 
 
356 aa  83.2  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4110  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.38 
 
 
356 aa  83.2  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0371925  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03489  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.94 
 
 
352 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339394  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3967  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.94 
 
 
352 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  23.75 
 
 
361 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.12 
 
 
332 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.12 
 
 
332 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.94 
 
 
352 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026899  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3841  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.94 
 
 
352 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196072  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4133  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.51 
 
 
340 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000187228  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0079  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.51 
 
 
340 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.0000104869 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03441  hypothetical protein  22.51 
 
 
340 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.331205  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1248  glycosyl transferase family 9  23.96 
 
 
385 aa  80.5  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.9727 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.22 
 
 
339 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4057  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.49 
 
 
352 aa  80.5  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>