More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0548 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1411  glycosyl transferase family protein  87.83 
 
 		 419 aa  765    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0548  glycosyl transferase family 9  100 
 
 		 419 aa  865    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0259889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1745  glycosyl transferase family protein  53.9 
 
 		 406 aa  436  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0465  glycosyl transferase family protein  33.57 
 
 		 415 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.19634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0319  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 		 413 aa  191  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0489134 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 		 406 aa  138  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0585  glycosyl transferase family protein  26.08 
 
 		 406 aa  134  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2239  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 		 431 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  26.23 
 
 		 361 aa  106  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  27.81 
 
 		 360 aa  92  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.37 
 
 		 368 aa  87.4  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  25.54 
 
 		 367 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.58 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  23.72 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.88 
 
 		 360 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.98 
 
 		 516 aa  82  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  25.35 
 
 		 364 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1805  glycosyl transferase family 9  28.89 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  23.94 
 
 		 779 aa  76.3  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  22.88 
 
 		 379 aa  76.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1968  putative heptosyltransferase (O-antigen related)  24.64 
 
 		 388 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.78963  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0577  heptosyltransferase family protein  24.17 
 
 		 365 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.902815  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0112  heptosyltransferase  24.08 
 
 		 335 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0372  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0149  glycosyl transferase family 9  25.75 
 
 		 352 aa  74.3  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3391  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0157  glycosyl transferase family protein  30.41 
 
 		 382 aa  73.2  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  22.85 
 
 		 354 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.02 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0670  ADP-heptoselps heptosyltransferase  23.92 
 
 		 365 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.374437  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.55 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3090  glycosyl transferase family 9  24.16 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1977  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase, putative  22.96 
 
 		 365 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0582  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.24 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000000638797  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  31.58 
 
 		 334 aa  69.3  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  29.48 
 
 		 343 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.17 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1870  heptosyltransferase family protein  29.14 
 
 		 352 aa  68.6  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.65 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0899  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27 
 
 		 354 aa  68.2  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2461  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  29.82 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0669  heptosyltransferase  21.47 
 
 		 418 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.822838  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0576  heptosyltransferase  21.47 
 
 		 418 aa  67  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0684  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferaseii  24.64 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0229  glycosyl transferase family 9  20.27 
 
 		 348 aa  66.2  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1967  putative heptosyltransferase (O-antigen related)  21.29 
 
 		 418 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1535  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.15 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4886  glycosyl transferase family 9  27.43 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0547939 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3809  glycosyl transferase family 9  27.43 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.843814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0479  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.34 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2637  family 9 glycosyl transferase  28.11 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0454  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.64 
 
 		 341 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.788826  normal  0.709845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  21.93 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  25.85 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  29.21 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2230  glycosyl transferase family protein  24.11 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0828  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.81 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3282  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.28 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0510  glycosyl transferase family 9  21.35 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1629  heptosyltransferase family protein  23.04 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1283  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.95 
 
 		 316 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0326362  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0580  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.95 
 
 		 316 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.604166  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1824  glycosyl transferase family 9  24.39 
 
 		 390 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0907  glycosyl transferase family 9  22.03 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25 
 
 		 343 aa  62  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  26.51 
 
 		 350 aa  62  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1567  glycosyl transferase family 9  32.74 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.029243 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1978  lipopolysaccharide heptosyltransferase II rfaC2  21.29 
 
 		 402 aa  62  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2334  glycosyl transferase family protein  24.46 
 
 		 392 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0453286 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0205  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.47 
 
 		 331 aa  62  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1699  glycosyl transferase family protein  24.3 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2311  glycosyl transferase family protein  24.3 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  20.38 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.29 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0658  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.81 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0491  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.3 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2350  glycosyl transferase family protein  24.11 
 
 		 475 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0291  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  23.81 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0032  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  23.81 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2419  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  23.81 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0586  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  23.81 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0990  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.81 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0832  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.81 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.14 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  21.88 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1212  glycosyl transferase family protein  24.28 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0462  glycosyl transferase family 9  33.63 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00459  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  26.06 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  26.86 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1164  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.27 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1756  glycosyl transferase family 9  20.49 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0677074  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  27.75 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2713  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  22.7 
 
 		 349 aa  59.7  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1989  heptosyltransferase family protein  29.66 
 
 		 625 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3170  heptosyltransferase family protein  29.66 
 
 		 622 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1388  heptosyltransferase family protein  29.66 
 
 		 643 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356236  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1300  heptosyltransferase family protein  29.66 
 
 		 625 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3041  heptosyltransferase family protein  29.66 
 
 		 622 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1012  heptosyltransferase family protein  29.66 
 
 		 628 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2276  heptosyltransferase family protein  29.66 
 
 		 622 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>