More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2728 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2728  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 316 aa  630  1e-179  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.802398  normal  0.174728 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2729  glycosyl transferase family protein  41.01 
 
 		 321 aa  228  9e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637215  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.79 
 
 		 362 aa  125  9e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  30.82 
 
 		 354 aa  122  6e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0062  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 		 354 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.982764  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4281  glycosyl transferase family 9  29.83 
 
 		 347 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000734262 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3897  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 		 347 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  27.48 
 
 		 779 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4100  glycosyl transferase family protein  30.27 
 
 		 340 aa  117  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240394 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3702  glycosyl transferase family protein  30.93 
 
 		 359 aa  117  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4678  heptosyl transferase glycosyltransferase family 9 protein  30.17 
 
 		 347 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4336  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4476  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0329  glycosyl transferase family protein  26.02 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3988  glycosyl transferase family protein  29.93 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3896  glycosyl transferase family protein  29.93 
 
 		 340 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3611  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 		 348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.71 
 
 		 357 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0102  glycosyl transferase family protein  29.01 
 
 		 350 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000136303 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0111  glycosyl transferase family protein  30.95 
 
 		 359 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  28.76 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0070  glycosyl transferase family protein  27.89 
 
 		 347 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  28.62 
 
 		 356 aa  104  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  28.62 
 
 		 373 aa  103  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00662  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase III  28.08 
 
 		 351 aa  102  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3934  glycosyl transferase family protein  26.44 
 
 		 343 aa  99.8  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.157476  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0109  glycosyl transferase family protein  26.91 
 
 		 342 aa  99.4  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001811  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  29.27 
 
 		 340 aa  99  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0785  glycosyl transferase family protein  25.77 
 
 		 347 aa  97.4  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  30.74 
 
 		 350 aa  97.1  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1275  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.81 
 
 		 342 aa  95.9  9e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.336205  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1688  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 		 318 aa  93.2  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0593754 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  28.42 
 
 		 337 aa  92.4  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1150  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.13 
 
 		 342 aa  90.9  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.16673  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0851  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.07 
 
 		 346 aa  90.9  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0588  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  22.71 
 
 		 342 aa  90.1  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0601  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  30.12 
 
 		 332 aa  89.4  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5746  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  32.31 
 
 		 355 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.887327  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0307  glycosyl transferase family 9  27.99 
 
 		 374 aa  89.4  8e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  24.84 
 
 		 348 aa  88.6  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2260  glycosyl transferase family protein  26.49 
 
 		 364 aa  87.8  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1247  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.94 
 
 		 339 aa  88.2  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.313368  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4861  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.42 
 
 		 352 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.36371 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0753  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  30.36 
 
 		 324 aa  87.8  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.345805  normal  0.171103 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3404  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.89 
 
 		 351 aa  88.2  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.72 
 
 		 339 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1060  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  28.03 
 
 		 334 aa  87  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.845943 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66240  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.86 
 
 		 354 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0342  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.1 
 
 		 352 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0367  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.1 
 
 		 352 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3421  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase-1  27.39 
 
 		 334 aa  86.7  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1808  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.15 
 
 		 327 aa  86.3  6e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1293  glycosyl transferase family protein  27.67 
 
 		 350 aa  86.3  6e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  30.77 
 
 		 352 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381359 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4090  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  28.4 
 
 		 320 aa  85.9  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0642  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  29.5 
 
 		 332 aa  86.3  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.111821 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1358  saccharide biosynthesis regulatory protein  27.67 
 
 		 350 aa  85.9  8e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0692  lipopolysaccharide heptosyltransferase protein  30.1 
 
 		 332 aa  85.9  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00185807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2806  glycosyl transferase family protein  28.47 
 
 		 362 aa  85.9  9e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629835 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0580  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.33 
 
 		 334 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0447499 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0589  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  22.09 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253987  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0801  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.04 
 
 		 335 aa  84  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1611  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  27.11 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2242  heptosyltransferase family protein  25.71 
 
 		 355 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3771  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  30.52 
 
 		 335 aa  83.2  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145484  normal  0.554528 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1695  glycosyl transferase family protein  24.18 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0062  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  27.93 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0223597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4148  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  27.93 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0068  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  27.93 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0575052  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4124  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  28.7 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815004  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1228  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.16 
 
 		 324 aa  82.8  0.000000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2105  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase  24.07 
 
 		 351 aa  82  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5002  lipopolysaccharide heptosyltransferase  30.82 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0521  glycosyl transferase family protein  30.5 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0466  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  30.16 
 
 		 353 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4827  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  30.9 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155818  hitchhiker  0.000206401 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1428  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  29.53 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0081  heptosyltransferase family protein  24.07 
 
 		 351 aa  81.6  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0197496  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44850  lipopolysaccharide heptosyltransferase I, waaC  31.44 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.721697  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  26.21 
 
 		 364 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4371  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  29.43 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2749  hypothetical protein  24.41 
 
 		 349 aa  80.1  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2622  hypothetical protein  24.41 
 
 		 349 aa  79.7  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0115  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  28.53 
 
 		 328 aa  79  0.00000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03478  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  28.1 
 
 		 326 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00734996  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0088  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  28.4 
 
 		 323 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0341266  normal  0.158006 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3832  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  28.4 
 
 		 323 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000019224  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1294  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.39 
 
 		 314 aa  79  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.75 
 
 		 352 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1399  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  22.37 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.348076  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4048  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  27.66 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000904915  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3958  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  28.1 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0259947  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3948  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  28.66 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0084  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  28.61 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00990907  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4994  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  28.48 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.041745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2661  glycosyl transferase family 9  22.36 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141025 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0949  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.3 
 
 		 332 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1870  heptosyltransferase family protein  27.52 
 
 		 352 aa  77  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4092  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.45 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0171  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  29.28 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.425143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>