More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0312 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0312  glycosyl transferase family 9  100 
 
 
574 aa  1157    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2523  glycosyl transferase family protein  44.13 
 
 
549 aa  398  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0027494  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0565  heptosyltransferase family protein  42.7 
 
 
543 aa  386  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.432833  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1547  glycosyl transferase family 9  41.2 
 
 
585 aa  356  6.999999999999999e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.796165 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0690  glycosyl transferase family 9  40.04 
 
 
511 aa  344  2.9999999999999997e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.379313  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3025  heptosyltransferase family protein  33.24 
 
 
517 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  27.45 
 
 
343 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  40.51 
 
 
347 aa  93.2  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  35.48 
 
 
352 aa  91.7  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1714  heptosyltransferase family protein  34.1 
 
 
473 aa  91.3  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.85 
 
 
516 aa  88.2  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1747  glycosyl transferase family 9  39.19 
 
 
420 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5444  glycosyl transferase family protein  37.13 
 
 
358 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00929201 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.98 
 
 
359 aa  84  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0149  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  40.12 
 
 
341 aa  83.6  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  34.48 
 
 
348 aa  82.8  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3296  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  37.58 
 
 
337 aa  82  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2022  heptosyltransferase family protein  35.57 
 
 
432 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259554  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0372  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  25.95 
 
 
330 aa  81.3  0.00000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0950  glycosyl transferase family 9  43.81 
 
 
340 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.74322  normal  0.160962 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0249  glycosyl transferase family 9  37.01 
 
 
521 aa  80.1  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0328352 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3149  glycosyl transferase family protein  36.29 
 
 
366 aa  79.7  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.75 
 
 
339 aa  79  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1197  glycosyl transferase family protein  39.33 
 
 
323 aa  79  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  32.58 
 
 
361 aa  78.6  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0205  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  36.84 
 
 
331 aa  78.2  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  34.38 
 
 
362 aa  77.4  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.85 
 
 
343 aa  76.3  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1258  glycosyl transferase family 9  32.66 
 
 
471 aa  76.6  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1212  glycosyl transferase family protein  34.16 
 
 
351 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0299  glycosyl transferase family 9  37.41 
 
 
463 aa  75.5  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.155014 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2514  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
333 aa  75.1  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.566705  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1385  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  36.02 
 
 
371 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2273  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  36.02 
 
 
371 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0964194  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3167  putative heptosyltransferase  36.02 
 
 
371 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1297  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  36.02 
 
 
371 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.161852  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3038  putative heptosyltransferase  36.02 
 
 
371 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148139  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  31.91 
 
 
356 aa  74.7  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5648  glycosyl transferase family protein  37.27 
 
 
358 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186064  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1633  glycosyl transferase family protein  28.68 
 
 
467 aa  74.7  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6040  glycosyl transferase family protein  37.74 
 
 
362 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.511032  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1986  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  36.02 
 
 
338 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  43.14 
 
 
334 aa  73.9  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  21.67 
 
 
348 aa  73.6  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  25.43 
 
 
364 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0009  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  34.31 
 
 
349 aa  73.2  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3977  glycosyl transferase family protein  40.18 
 
 
376 aa  73.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.67849  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4830  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
363 aa  72  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.244067  hitchhiker  0.0000484932 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0320  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.33 
 
 
356 aa  72.8  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1381  glycosyl transferase family protein  37.74 
 
 
362 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6448  glycosyl transferase family protein  37.74 
 
 
362 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776899  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 
361 aa  72  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1629  heptosyltransferase family protein  25.68 
 
 
341 aa  71.6  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6396  glycosyl transferase family protein  35.5 
 
 
358 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210814  normal  0.0991035 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4386  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.55 
 
 
415 aa  71.2  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  35.43 
 
 
344 aa  70.9  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0742  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  34.52 
 
 
393 aa  70.9  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.010597  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  25.68 
 
 
350 aa  70.9  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1009  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  35.4 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.334861  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2105  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase  30.14 
 
 
351 aa  70.5  0.00000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.48 
 
 
360 aa  70.5  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0081  heptosyltransferase family protein  30.14 
 
 
351 aa  70.5  0.00000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0197496  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0491  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.73 
 
 
354 aa  70.1  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4362  glycosyl transferase family protein  35.1 
 
 
368 aa  69.7  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0768  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.7 
 
 
346 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0059313 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1615  glycosyl transferase family protein  41.07 
 
 
411 aa  69.7  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.395155  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0615  glycosyl transferase family 9  26.65 
 
 
388 aa  69.7  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0149  glycosyl transferase family 9  33.93 
 
 
352 aa  68.6  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5245  glycosyl transferase family protein  34.16 
 
 
379 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0245525 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1796  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.56 
 
 
314 aa  68.6  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0153252 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0508  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  34.21 
 
 
317 aa  68.6  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.104736  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0106  glycosyl transferase family 9  30.11 
 
 
332 aa  68.6  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00331411  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0962  heptosyltransferase family protein  25.85 
 
 
429 aa  68.9  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.858852  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.52 
 
 
359 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0486  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.8 
 
 
341 aa  67.8  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2214  glycosyl transferase family 9  34.97 
 
 
362 aa  67.8  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.47 
 
 
368 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0738  putative LPS biosynthesis related glycosyltransferase  44.76 
 
 
347 aa  67.8  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00062  putative ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  27.96 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0473  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.8 
 
 
341 aa  67.8  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0479  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.94 
 
 
317 aa  67.8  0.0000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4886  glycosyl transferase family 9  32.52 
 
 
381 aa  67.4  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0547939 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3809  glycosyl transferase family 9  32.52 
 
 
381 aa  67.4  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.843814  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1783  glycosyl transferase family protein  38.26 
 
 
335 aa  67  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1695  glycosyl transferase family protein  32.76 
 
 
336 aa  66.6  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0160  glycosyl transferase family 9  28.25 
 
 
345 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.081148  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2792  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  36.17 
 
 
362 aa  66.6  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0445733  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0899  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.76 
 
 
354 aa  67  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0145  glycosyl transferase family 9  30 
 
 
334 aa  66.6  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0787699  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3391  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 
409 aa  66.6  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0565  ADP-heptose--lipopolysaccharide heptosyltransferase II protein  33.8 
 
 
341 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.995222  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0070  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 
347 aa  66.2  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2616  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  29.86 
 
 
346 aa  65.9  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0100  glycosyl transferase family 9  36.43 
 
 
462 aa  65.9  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0359  glycosyl transferase family protein  36 
 
 
402 aa  66.2  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3214  glycosyl transferase family 9  29.87 
 
 
367 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360505  normal  0.269759 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1514  heptosyltransferase family protein  34.36 
 
 
363 aa  65.1  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458019  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4383  glycosyl transferase family protein  29.68 
 
 
390 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.764481  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II- LPS biosynthesis, waaF  30.47 
 
 
349 aa  65.5  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.57864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>