151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0962 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0962  heptosyltransferase family protein  100 
 
 
429 aa  862    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.858852  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0299  glycosyl transferase family 9  45.06 
 
 
463 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.155014 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2022  heptosyltransferase family protein  44.52 
 
 
432 aa  317  3e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259554  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1615  glycosyl transferase family protein  48.71 
 
 
411 aa  316  4e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.395155  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1747  glycosyl transferase family 9  46.67 
 
 
420 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0690  glycosyl transferase family 9  30.82 
 
 
511 aa  105  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.379313  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2523  glycosyl transferase family protein  29.77 
 
 
549 aa  96.7  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0027494  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1547  glycosyl transferase family 9  27.02 
 
 
585 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.796165 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3025  heptosyltransferase family protein  26.06 
 
 
517 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0565  heptosyltransferase family protein  28.86 
 
 
543 aa  77  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.432833  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0312  glycosyl transferase family 9  25.85 
 
 
574 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1714  heptosyltransferase family protein  26.38 
 
 
473 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1258  glycosyl transferase family 9  30.33 
 
 
471 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0100  glycosyl transferase family 9  30.3 
 
 
462 aa  67.8  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1796  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  35.25 
 
 
314 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0153252 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0145  glycosyl transferase family 9  33.09 
 
 
334 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0787699  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0112  heptosyltransferase  30.43 
 
 
335 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.11 
 
 
299 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  32.06 
 
 
362 aa  58.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1633  glycosyl transferase family protein  35.16 
 
 
467 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.41 
 
 
359 aa  58.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4735  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 
404 aa  58.2  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.96684 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II- LPS biosynthesis, waaF  30.15 
 
 
349 aa  57  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.57864  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1805  glycosyl transferase family 9  28.45 
 
 
308 aa  57  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0149  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.36 
 
 
341 aa  57  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0357  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.07 
 
 
324 aa  57  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0363758  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4830  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 
363 aa  56.6  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.244067  hitchhiker  0.0000484932 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0851  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  29.32 
 
 
346 aa  56.6  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001794  ADP-heptose--lipooligosaccharide heptosyltransferase II  25.93 
 
 
352 aa  56.2  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.578647  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00680  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  24.43 
 
 
352 aa  55.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  28.7 
 
 
354 aa  55.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0159  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 
381 aa  54.7  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1226  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.63 
 
 
304 aa  54.3  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.56987e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2616  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  24.03 
 
 
346 aa  54.3  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  36.54 
 
 
339 aa  54.3  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  28.1 
 
 
361 aa  53.9  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0479  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.82 
 
 
317 aa  53.9  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0249  glycosyl transferase family 9  28.4 
 
 
521 aa  53.1  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0328352 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  29.41 
 
 
353 aa  53.1  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0579  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.47 
 
 
347 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0417722 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0768  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.38 
 
 
346 aa  53.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0059313 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  31.58 
 
 
779 aa  52.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  30.85 
 
 
356 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2514  glycosyl transferase family protein  26.39 
 
 
333 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.566705  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0320  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.97 
 
 
356 aa  52.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.75 
 
 
343 aa  51.6  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0580  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.36 
 
 
316 aa  52  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.604166  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0508  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.95 
 
 
317 aa  51.6  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.104736  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0520  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 
344 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0093  heptosyltransferase  24.65 
 
 
335 aa  50.8  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.283951  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3214  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  36.49 
 
 
346 aa  50.8  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3149  glycosyl transferase family protein  27.12 
 
 
366 aa  50.8  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5003  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.36 
 
 
344 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  29.6 
 
 
343 aa  50.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  32.71 
 
 
344 aa  50.4  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  28.87 
 
 
348 aa  50.4  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 
347 aa  50.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 
406 aa  50.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4678  heptosyl transferase glycosyltransferase family 9 protein  35.71 
 
 
347 aa  49.7  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03477  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  33.33 
 
 
348 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000025219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0085  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.33 
 
 
348 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000038978  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1283  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  24.81 
 
 
316 aa  49.3  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0326362  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4036  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  33.33 
 
 
348 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4993  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  33.33 
 
 
348 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000211589  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4097  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  33.33 
 
 
348 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2331  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.65 
 
 
366 aa  49.3  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000713254  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1612  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  32.18 
 
 
346 aa  49.7  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2792  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.57 
 
 
362 aa  49.3  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0445733  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3929  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  33.33 
 
 
348 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03428  hypothetical protein  33.33 
 
 
348 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000123646  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0156  glycosyl transferase family 9  31.37 
 
 
334 aa  49.3  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0639777  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3991  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  33.33 
 
 
348 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3910  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  33.33 
 
 
348 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0446452 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3831  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  33.33 
 
 
348 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000276456  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4123  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  33.33 
 
 
348 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0437858  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0089  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  33.33 
 
 
348 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000834595  normal  0.156713 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3957  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  33.33 
 
 
348 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000313085  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1535  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.19 
 
 
346 aa  49.7  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4047  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  33.33 
 
 
348 aa  49.3  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000910947  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  29.91 
 
 
350 aa  48.5  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
361 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0106  glycosyl transferase family 9  24.03 
 
 
332 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00331411  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0116  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  33.33 
 
 
348 aa  48.9  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2822  glycosyl transferase family 9  23.63 
 
 
357 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31 
 
 
516 aa  48.9  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0172  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  33.33 
 
 
350 aa  48.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.063279  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  28.57 
 
 
352 aa  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3897  glycosyl transferase family protein  34.74 
 
 
347 aa  48.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1237  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.82 
 
 
314 aa  47.8  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0337  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.5 
 
 
343 aa  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1852  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.5 
 
 
343 aa  48.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2242  heptosyltransferase family protein  27.84 
 
 
355 aa  47.8  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3011  glycosyl transferase family protein  35.63 
 
 
381 aa  47.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169965  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
367 aa  47.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1783  glycosyl transferase family protein  37.18 
 
 
335 aa  47.8  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1164  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  28.18 
 
 
317 aa  47.8  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4370  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  33.33 
 
 
355 aa  47.8  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.7 
 
 
352 aa  47.4  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0062  glycosyl transferase family protein  33.68 
 
 
354 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.982764  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3214  glycosyl transferase family 9  27.27 
 
 
367 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360505  normal  0.269759 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>