133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2022 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2022  heptosyltransferase family protein  100 
 
 
432 aa  878    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259554  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0299  glycosyl transferase family 9  50.99 
 
 
463 aa  431  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.155014 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1615  glycosyl transferase family protein  53.54 
 
 
411 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.395155  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0962  heptosyltransferase family protein  44.52 
 
 
429 aa  317  3e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.858852  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1747  glycosyl transferase family 9  46.8 
 
 
420 aa  299  5e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0690  glycosyl transferase family 9  30.3 
 
 
511 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.379313  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3025  heptosyltransferase family protein  26.67 
 
 
517 aa  89  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0565  heptosyltransferase family protein  28.61 
 
 
543 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.432833  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0312  glycosyl transferase family 9  35.57 
 
 
574 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2523  glycosyl transferase family protein  26.74 
 
 
549 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0027494  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1547  glycosyl transferase family 9  26.72 
 
 
585 aa  70.1  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.796165 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1571  glycosyl transferase family 9  37.25 
 
 
338 aa  68.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.33 
 
 
362 aa  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4830  glycosyl transferase family protein  31.29 
 
 
363 aa  62.4  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.244067  hitchhiker  0.0000484932 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0100  glycosyl transferase family 9  28.16 
 
 
462 aa  62  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1714  heptosyltransferase family protein  33.09 
 
 
473 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0145  glycosyl transferase family 9  30.99 
 
 
334 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0787699  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  38.74 
 
 
339 aa  58.9  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1258  glycosyl transferase family 9  31.43 
 
 
471 aa  57.4  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  32.26 
 
 
353 aa  57.4  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0585  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 
406 aa  57  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  32.58 
 
 
347 aa  56.6  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  39.56 
 
 
779 aa  55.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0149  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.63 
 
 
341 aa  56.2  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  35.35 
 
 
516 aa  55.8  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 
344 aa  55.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  33.05 
 
 
361 aa  54.7  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1633  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
467 aa  54.7  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1796  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.38 
 
 
314 aa  53.1  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0153252 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0249  glycosyl transferase family 9  32.65 
 
 
521 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0328352 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 
406 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0070  glycosyl transferase family protein  33.9 
 
 
347 aa  52.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  31.82 
 
 
348 aa  51.6  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0508  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.77 
 
 
317 aa  51.2  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.104736  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  32.97 
 
 
354 aa  51.2  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0320  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.46 
 
 
356 aa  50.8  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2616  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.58 
 
 
346 aa  50.8  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3149  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 
366 aa  51.2  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1805  glycosyl transferase family 9  30.28 
 
 
308 aa  50.8  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0009  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.73 
 
 
349 aa  50.4  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  29.19 
 
 
354 aa  50.1  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
361 aa  50.1  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1212  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 
351 aa  50.1  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0828  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.05 
 
 
346 aa  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0160  glycosyl transferase family 9  30.69 
 
 
345 aa  50.1  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.081148  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  28.45 
 
 
343 aa  49.7  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0582  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.32 
 
 
325 aa  49.7  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000000638797  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3934  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 
343 aa  49.3  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.157476  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0372  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 
369 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2105  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase  30 
 
 
351 aa  49.3  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0520  glycosyl transferase family protein  27.52 
 
 
344 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1384  glycosyl transferase family protein  33.91 
 
 
401 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3214  glycosyl transferase family 9  24.85 
 
 
367 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360505  normal  0.269759 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6445  glycosyl transferase family protein  33.91 
 
 
401 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0047484  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.55 
 
 
352 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.65 
 
 
299 aa  48.5  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.83 
 
 
343 aa  48.5  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3478  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.76 
 
 
334 aa  48.9  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5444  glycosyl transferase family protein  33.91 
 
 
358 aa  48.9  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00929201 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0081  heptosyltransferase family protein  30 
 
 
351 aa  48.9  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0197496  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.45 
 
 
359 aa  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II- LPS biosynthesis, waaF  26.67 
 
 
349 aa  47.8  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.57864  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0977  glycosyl transferase family 9  30.61 
 
 
336 aa  47.8  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.412214  hitchhiker  0.000380468 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0156  glycosyl transferase family 9  26.62 
 
 
334 aa  47.8  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0639777  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1226  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.86 
 
 
304 aa  47.4  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.56987e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1939  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 
344 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.21219 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0149  glycosyl transferase family 9  29.17 
 
 
352 aa  47.4  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2642  family 9 glycosyl transferase  28.57 
 
 
343 aa  47.4  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5003  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  27.52 
 
 
344 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5589  glycosyl transferase family 9  32.98 
 
 
334 aa  46.6  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1791  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
408 aa  46.6  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306314  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1197  glycosyl transferase family protein  24.53 
 
 
323 aa  46.6  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4862  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.24 
 
 
349 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.470567 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6036  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 
401 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.424999 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4678  heptosyl transferase glycosyltransferase family 9 protein  32.2 
 
 
347 aa  46.6  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  32.22 
 
 
356 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0341  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.21 
 
 
349 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.455159  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0159  glycosyl transferase family protein  25.56 
 
 
381 aa  46.2  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0684  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferaseii  28.38 
 
 
341 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0491  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.14 
 
 
354 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0080  glycosyl transferase family protein  20 
 
 
324 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.49427  normal  0.135541 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  32.94 
 
 
371 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1535  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.06 
 
 
346 aa  46.2  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1514  heptosyltransferase family protein  30.43 
 
 
363 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458019  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0545  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.78 
 
 
340 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0086605  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0990  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.48 
 
 
346 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0465  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.71 
 
 
344 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  30.09 
 
 
344 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0658  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.48 
 
 
346 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3611  glycosyl transferase family protein  36.17 
 
 
348 aa  45.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3988  glycosyl transferase family protein  33.9 
 
 
340 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2792  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.04 
 
 
362 aa  45.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0445733  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5651  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 
400 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.252333 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0106  glycosyl transferase family 9  20.86 
 
 
332 aa  45.8  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00331411  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0832  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.48 
 
 
346 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0032  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  29.05 
 
 
376 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0366  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.21 
 
 
349 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0369  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.21 
 
 
349 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.489126 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6399  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
400 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.0454867 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3282  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.7 
 
 
341 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>