More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1547 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1547  glycosyl transferase family 9  100 
 
 
585 aa  1163    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.796165 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2523  glycosyl transferase family protein  53.26 
 
 
549 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0027494  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0565  heptosyltransferase family protein  50.17 
 
 
543 aa  486  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.432833  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0690  glycosyl transferase family 9  41 
 
 
511 aa  370  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.379313  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0312  glycosyl transferase family 9  42.38 
 
 
574 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3025  heptosyltransferase family protein  28.17 
 
 
517 aa  124  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  36.72 
 
 
343 aa  97.4  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1747  glycosyl transferase family 9  29.82 
 
 
420 aa  95.1  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0149  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  38.71 
 
 
341 aa  89.4  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.88 
 
 
516 aa  85.1  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0205  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.37 
 
 
331 aa  83.2  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0962  heptosyltransferase family protein  27.3 
 
 
429 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.858852  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  27.49 
 
 
348 aa  81.6  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.53 
 
 
352 aa  75.1  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4830  glycosyl transferase family protein  38.06 
 
 
363 aa  73.6  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.244067  hitchhiker  0.0000484932 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2022  heptosyltransferase family protein  27.12 
 
 
432 aa  73.6  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259554  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0157  glycosyl transferase family protein  33.86 
 
 
382 aa  72.8  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3149  glycosyl transferase family protein  34.85 
 
 
366 aa  71.6  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0249  glycosyl transferase family 9  27.78 
 
 
521 aa  70.5  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0328352 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3296  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.96 
 
 
337 aa  70.1  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0149  glycosyl transferase family 9  34.33 
 
 
352 aa  70.1  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  36.92 
 
 
354 aa  69.7  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0508  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  34.34 
 
 
317 aa  69.7  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.104736  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  34.3 
 
 
361 aa  69.7  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0299  glycosyl transferase family 9  46.99 
 
 
463 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.155014 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 
364 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  24.47 
 
 
348 aa  69.7  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1714  heptosyltransferase family protein  31.85 
 
 
473 aa  68.6  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0016  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 
357 aa  68.2  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  26.13 
 
 
347 aa  67.8  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  30.56 
 
 
354 aa  66.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  25.66 
 
 
350 aa  67  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  33.14 
 
 
344 aa  66.6  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0950  glycosyl transferase family 9  32.89 
 
 
340 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.74322  normal  0.160962 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2105  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase  23.19 
 
 
351 aa  66.6  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  33.68 
 
 
356 aa  66.2  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3136  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  34.1 
 
 
344 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  18.69 
 
 
330 aa  65.9  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0081  heptosyltransferase family protein  23.19 
 
 
351 aa  65.9  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0197496  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0491  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.91 
 
 
354 aa  65.1  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0145  glycosyl transferase family 9  28.72 
 
 
334 aa  65.5  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0787699  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0479  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.88 
 
 
317 aa  64.7  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30 
 
 
359 aa  65.1  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.05 
 
 
368 aa  65.1  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1629  heptosyltransferase family protein  40.43 
 
 
341 aa  64.3  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5245  glycosyl transferase family protein  34.24 
 
 
379 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0245525 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.29 
 
 
360 aa  64.3  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  28.57 
 
 
361 aa  63.9  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  32.5 
 
 
362 aa  63.5  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0366  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30 
 
 
349 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1258  glycosyl transferase family 9  34.87 
 
 
471 aa  63.5  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0341  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30 
 
 
349 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.455159  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4383  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 
390 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.764481  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3090  glycosyl transferase family 9  26.24 
 
 
344 aa  62.8  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1633  glycosyl transferase family protein  32.79 
 
 
467 aa  62.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0828  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.34 
 
 
346 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0369  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30 
 
 
349 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.489126 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0172  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  35.51 
 
 
350 aa  61.6  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.063279  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4386  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30 
 
 
415 aa  62  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  23.03 
 
 
330 aa  62  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4862  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.38 
 
 
349 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.470567 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0684  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferaseii  31.33 
 
 
341 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1212  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
351 aa  61.2  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0565  ADP-heptose--lipopolysaccharide heptosyltransferase II protein  30.37 
 
 
341 aa  60.8  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.995222  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0486  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.87 
 
 
341 aa  60.8  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0473  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.87 
 
 
341 aa  60.8  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0100  glycosyl transferase family 9  26.07 
 
 
462 aa  60.5  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1654  glycosyl transferase family 9  31.53 
 
 
383 aa  60.5  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.22 
 
 
299 aa  60.5  0.00000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3947  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  32.71 
 
 
350 aa  59.7  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1237  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.94 
 
 
314 aa  60.1  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0545  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  34.59 
 
 
340 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0086605  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1385  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  32.97 
 
 
371 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6413  glycosyl transferase family 9  22.54 
 
 
329 aa  59.7  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.17 
 
 
343 aa  60.1  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0156  glycosyl transferase family 9  29.79 
 
 
334 aa  60.1  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0639777  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0160  glycosyl transferase family 9  29.82 
 
 
345 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.081148  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1615  glycosyl transferase family protein  42.17 
 
 
411 aa  60.1  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.395155  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3282  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.72 
 
 
341 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1986  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  33.33 
 
 
338 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1695  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 
336 aa  59.3  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0465  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.19 
 
 
344 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0977  glycosyl transferase family 9  26.4 
 
 
336 aa  59.3  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.412214  hitchhiker  0.000380468 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3977  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 
376 aa  59.3  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.67849  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3038  putative heptosyltransferase  32.97 
 
 
371 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148139  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5444  glycosyl transferase family protein  33.89 
 
 
358 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00929201 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2273  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  32.97 
 
 
371 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0964194  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1297  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  32.97 
 
 
371 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.161852  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3167  putative heptosyltransferase  32.97 
 
 
371 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5003  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  30.63 
 
 
344 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II- LPS biosynthesis, waaF  33.12 
 
 
349 aa  58.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.57864  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4826  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  32.71 
 
 
348 aa  58.9  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.290967  hitchhiker  0.000199841 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6396  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 
358 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210814  normal  0.0991035 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4147  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  33.64 
 
 
354 aa  58.9  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5648  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 
358 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186064  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0069  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  33.64 
 
 
354 aa  58.9  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.270694  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0063  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  32.71 
 
 
354 aa  58.5  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.877737  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2642  family 9 glycosyl transferase  34.01 
 
 
343 aa  58.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3991  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  34.58 
 
 
348 aa  58.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0738  putative LPS biosynthesis related glycosyltransferase  28.13 
 
 
347 aa  58.2  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>