231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2012 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2012  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  100 
 
 		 357 aa  746    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2578  glycosyl transferase family 9  44.01 
 
 		 344 aa  290  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1507  heptosyltransferase family protein, putative  41.34 
 
 		 320 aa  220  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  26.23 
 
 		 779 aa  78.6  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.61 
 
 		 353 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0069  glycosyl transferase family 9  25.24 
 
 		 345 aa  72.4  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.960845  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  24.84 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2334  glycosyl transferase family protein  24.84 
 
 		 392 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0453286 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1100  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  24.74 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000330109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0578  glycosyl transferase family protein  25.39 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0661  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.68 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.796134 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  25.87 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1688  glycosyl transferase family protein  27.14 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0593754 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3033  glycosyl transferase family protein  22.56 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0965  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.01 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.55 
 
 		 360 aa  67  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1699  glycosyl transferase family protein  24.29 
 
 		 392 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2311  glycosyl transferase family protein  24.29 
 
 		 392 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  20.93 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5653  glycosyl transferase family protein  22.6 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.680336  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2713  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  23.46 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1363  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  22.9 
 
 		 394 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.824879  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  23.87 
 
 		 364 aa  62.8  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  23.87 
 
 		 360 aa  62.8  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2230  glycosyl transferase family protein  23.23 
 
 		 402 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00459  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  23.19 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1212  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  22.61 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1907  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  22.61 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0149  glycosyl transferase family 9  23.18 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0333  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  22.61 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1050  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  22.61 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702156  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0818  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  22.61 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  22.38 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2350  glycosyl transferase family protein  22.71 
 
 		 475 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1200  heptosyltransferase  25.52 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1231  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  22.9 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1910  heptosyltransferase family protein  25.52 
 
 		 381 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1360  heptosyltransferase family protein  25.52 
 
 		 381 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0112  heptosyltransferase  22.38 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1047  heptosyltransferase family protein  25.52 
 
 		 359 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0821  heptosyltransferase family protein  25.52 
 
 		 359 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0330  heptosyltransferase family protein  25.52 
 
 		 359 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.638826  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1209  heptosyltransferase  25.52 
 
 		 381 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0093  heptosyltransferase  22.68 
 
 		 335 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.283951  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3288  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase protein  25.57 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2764  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  24.08 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1203  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  23.19 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1257  glycosyl transferase family 9  27.01 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.492606  normal  0.595723 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0990  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  21.79 
 
 		 458 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1247  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.81 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.313368  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  21 
 
 		 330 aa  57  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1275  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  22.45 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.336205  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5248  glycosyl transferase family protein  22.22 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0108577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3111  glycosyl transferase family 9  25.78 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1248  glycosyl transferase family 9  28.57 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9727 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5648  glycosyl transferase family protein  24.04 
 
 		 358 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186064  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0160  glycosyl transferase family 9  21.21 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.081148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2715  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  22.68 
 
 		 363 aa  55.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.902664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.82 
 
 		 352 aa  55.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6396  glycosyl transferase family protein  23.79 
 
 		 358 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210814  normal  0.0991035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6413  glycosyl transferase family 9  22.61 
 
 		 329 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4359  glycosyl transferase family protein  23.43 
 
 		 381 aa  54.7  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3391  glycosyl transferase family protein  20.6 
 
 		 409 aa  54.7  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  24.65 
 
 		 367 aa  53.9  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0156  glycosyl transferase family 9  21.05 
 
 		 334 aa  53.9  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0639777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  23.13 
 
 		 361 aa  53.9  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0106  glycosyl transferase family 9  21.31 
 
 		 332 aa  53.5  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00331411  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1294  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  22.82 
 
 		 314 aa  53.5  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1150  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  22.11 
 
 		 342 aa  53.5  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.16673  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4091  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  22.02 
 
 		 361 aa  53.1  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1870  heptosyltransferase family protein  23.45 
 
 		 352 aa  53.5  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5206  glycosyl transferase family 9  28.38 
 
 		 401 aa  53.5  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0588  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  22.33 
 
 		 342 aa  53.5  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0470  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  32.56 
 
 		 324 aa  53.5  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0284268  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0565  ADP-heptose--lipopolysaccharide heptosyltransferase II protein  23.45 
 
 		 341 aa  53.1  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.995222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0607  glycosyl transferase family protein  21.51 
 
 		 386 aa  52.8  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0307  glycosyl transferase family 9  22.71 
 
 		 374 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0486  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.39 
 
 		 341 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0521  glycosyl transferase family protein  22.32 
 
 		 354 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.17 
 
 		 516 aa  52  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1989  heptosyltransferase family protein  31.62 
 
 		 625 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2276  heptosyltransferase family protein  31.62 
 
 		 622 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1388  heptosyltransferase family protein  31.62 
 
 		 643 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356236  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0987  heptosyltransferase family protein  26.67 
 
 		 358 aa  51.2  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1610  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.71 
 
 		 314 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.812323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2415  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  29.01 
 
 		 350 aa  51.2  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275437 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3041  heptosyltransferase family protein  31.62 
 
 		 622 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1012  heptosyltransferase family protein  31.62 
 
 		 628 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1300  heptosyltransferase family protein  31.62 
 
 		 625 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0473  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.05 
 
 		 341 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3170  heptosyltransferase family protein  31.62 
 
 		 622 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1571  glycosyl transferase family 9  22.6 
 
 		 338 aa  50.8  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3702  glycosyl transferase family protein  21.58 
 
 		 359 aa  50.4  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.81 
 
 		 339 aa  50.4  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2105  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase  21.53 
 
 		 351 aa  50.8  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1228  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  32.1 
 
 		 324 aa  50.4  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0081  heptosyltransferase family protein  21.53 
 
 		 351 aa  50.4  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0197496  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0080  glycosyl transferase family protein  21.18 
 
 		 324 aa  50.4  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.49427  normal  0.135541 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  23.53 
 
 		 381 aa  50.1  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2230  glycosyl transferase family protein  27.72 
 
 		 330 aa  50.1  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0384133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>