203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2578 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2578  glycosyl transferase family 9  100 
 
 		 344 aa  716    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2012  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  44.12 
 
 		 357 aa  296  4e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1507  heptosyltransferase family protein, putative  41.75 
 
 		 320 aa  231  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  27.7 
 
 		 360 aa  84.3  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.02 
 
 		 353 aa  82  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  26.23 
 
 		 779 aa  78.2  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.1 
 
 		 352 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1688  glycosyl transferase family protein  25.49 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0593754 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0661  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  21.68 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.796134 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  23.51 
 
 		 361 aa  62.4  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2514  glycosyl transferase family protein  22.5 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.566705  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1978  lipopolysaccharide heptosyltransferase II rfaC2  24.09 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2728  glycosyl transferase family protein  24.66 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.802398  normal  0.174728 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3702  glycosyl transferase family protein  22.01 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0965  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  23.02 
 
 		 392 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1967  putative heptosyltransferase (O-antigen related)  23.26 
 
 		 418 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0080  glycosyl transferase family protein  20.98 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.49427  normal  0.135541 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0160  glycosyl transferase family 9  22.4 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.081148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2260  glycosyl transferase family protein  22.88 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0669  heptosyltransferase  23.26 
 
 		 418 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.822838  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0576  heptosyltransferase  23.26 
 
 		 418 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  21.84 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1363  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  22.81 
 
 		 394 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.824879  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1212  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  22.81 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1907  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  22.81 
 
 		 390 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4091  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.17 
 
 		 361 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0990  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  22.46 
 
 		 458 aa  55.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0167  glycosyl transferase family 9  23.81 
 
 		 369 aa  55.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0106  glycosyl transferase family 9  23.13 
 
 		 332 aa  55.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00331411  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3391  glycosyl transferase family protein  25.44 
 
 		 409 aa  55.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1050  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  22.81 
 
 		 390 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702156  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0818  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  22.81 
 
 		 390 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0626  glycosyl transferase family protein  21.13 
 
 		 340 aa  55.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0429094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1203  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  22.81 
 
 		 390 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0333  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  22.81 
 
 		 390 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  30.41 
 
 		 373 aa  54.7  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1197  glycosyl transferase family protein  23.84 
 
 		 323 aa  55.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  30.41 
 
 		 356 aa  55.1  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1695  glycosyl transferase family protein  22.59 
 
 		 336 aa  54.3  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  22.89 
 
 		 348 aa  54.7  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0145  glycosyl transferase family 9  22.68 
 
 		 334 aa  54.3  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0787699  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  20.22 
 
 		 330 aa  53.9  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.96 
 
 		 361 aa  53.9  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0093  heptosyltransferase  20.47 
 
 		 335 aa  53.5  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.283951  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3375  glycosyl transferase family protein  29.85 
 
 		 317 aa  53.5  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1699  glycosyl transferase family protein  21.09 
 
 		 392 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2311  glycosyl transferase family protein  21.09 
 
 		 392 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2334  glycosyl transferase family protein  21.09 
 
 		 392 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0453286 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2230  glycosyl transferase family protein  22.15 
 
 		 402 aa  53.5  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3149  glycosyl transferase family protein  22.54 
 
 		 366 aa  53.1  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2350  glycosyl transferase family protein  21.28 
 
 		 475 aa  53.1  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0746  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  20.64 
 
 		 357 aa  52.8  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5653  glycosyl transferase family protein  21.28 
 
 		 404 aa  52.8  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.680336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1490  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  21.54 
 
 		 355 aa  52.8  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863183  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0565  ADP-heptose--lipopolysaccharide heptosyltransferase II protein  22.26 
 
 		 341 aa  52.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.995222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3011  glycosyl transferase family protein  34.02 
 
 		 381 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169965  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3141  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  21.53 
 
 		 355 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0149  glycosyl transferase family 9  24.32 
 
 		 352 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0773  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  22.02 
 
 		 331 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263429  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  25.37 
 
 		 361 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3082  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  21.53 
 
 		 331 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0069  glycosyl transferase family 9  20.79 
 
 		 345 aa  52.4  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.960845  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3118  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  21.53 
 
 		 355 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.145361  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  24.24 
 
 		 367 aa  52  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0784  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  22.02 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0949  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  21.69 
 
 		 332 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0156  glycosyl transferase family 9  21.77 
 
 		 334 aa  51.6  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0639777  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2190  heptosyltransferase I  21.53 
 
 		 331 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.362399  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2148  glycosyl transferase family 9  24.81 
 
 		 300 aa  50.8  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.445366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1248  glycosyl transferase family 9  27.89 
 
 		 385 aa  51.2  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9727 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  22.26 
 
 		 347 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1775  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  24.04 
 
 		 389 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0175609  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0861  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  22.34 
 
 		 332 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.288239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  22.38 
 
 		 379 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2063  heptosyltransferase I  21.53 
 
 		 331 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0184643  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0112  heptosyltransferase  21.63 
 
 		 335 aa  50.8  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2415  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  22.19 
 
 		 350 aa  50.4  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275437 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0102  glycosyl transferase family protein  21.35 
 
 		 350 aa  50.4  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000136303 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0717  heptosyltransferase I  21.53 
 
 		 355 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2551  heptosyltransferase I  21.53 
 
 		 355 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2622  glycosyl transferase family 9  21.71 
 
 		 327 aa  50.1  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.980475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0415  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  41.51 
 
 		 357 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0315  glycosyl transferase family 9  26.95 
 
 		 343 aa  50.1  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0894  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  41.51 
 
 		 357 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133252  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0820  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like  25 
 
 		 376 aa  49.7  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0392613  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2496  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  20.49 
 
 		 357 aa  49.7  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1745  glycosyl transferase family protein  25.97 
 
 		 406 aa  49.7  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3647  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  27.15 
 
 		 397 aa  49.3  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0068  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  21.58 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0575052  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2713  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  29.59 
 
 		 349 aa  48.9  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0062  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  21.58 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0223597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4148  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  21.58 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  20.41 
 
 		 344 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1629  heptosyltransferase family protein  26.87 
 
 		 341 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0111  glycosyl transferase family protein  20.53 
 
 		 359 aa  48.9  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3611  glycosyl transferase family protein  21.15 
 
 		 348 aa  48.9  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2715  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  22.73 
 
 		 363 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.902664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0852  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  26.82 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0864  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  45.65 
 
 		 331 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0801  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.57 
 
 		 335 aa  48.5  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>