174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1359 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1359  translation initiation factor 2, alpha subunit  100 
 
 		 277 aa  555  1e-157  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.256809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1687  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  40.91 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.640158  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0433  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  41.57 
 
 		 264 aa  206  3e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1783  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  40.82 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.030089 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1152  translation initiation factor 2, alpha subunit  40.7 
 
 		 254 aa  200  3e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0995  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  42.05 
 
 		 266 aa  198  7.999999999999999e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1802  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  37.69 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0642  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  36.4 
 
 		 265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000204722  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2023  translation initiation factor 2, alpha subunit  36.02 
 
 		 266 aa  178  8e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1128  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  38.91 
 
 		 264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0957  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  35.11 
 
 		 261 aa  169  4e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.652274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2051  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  36.68 
 
 		 259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1951  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  34.51 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.612676 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1567  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  33.85 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  35.5 
 
 		 265 aa  158  9e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0964  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  35.5 
 
 		 265 aa  158  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.497618  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0703  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  34.5 
 
 		 262 aa  156  3e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1699  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  33.33 
 
 		 265 aa  153  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.328913  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0982  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  35.11 
 
 		 265 aa  152  5e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0416  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  34.1 
 
 		 257 aa  152  7e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.131172  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1396  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  35.94 
 
 		 265 aa  151  8.999999999999999e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0200343  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1299  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  34.75 
 
 		 257 aa  143  4e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0870  translation initiation factor 2, alpha subunit  31.32 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2502  translation initiation factor 2, alpha subunit  32.31 
 
 		 266 aa  129  7.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0077  RNA-binding S1 domain-containing protein  31.91 
 
 		 265 aa  122  9e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.541121 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2790  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  30.57 
 
 		 266 aa  120  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.289487  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2880  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  29.88 
 
 		 277 aa  119  7e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.651055  normal  0.408906 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  31.78 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00230  eukaryotic translation initiation factor 2 alpha subunit, putative  27.38 
 
 		 300 aa  106  5e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.433033  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34538  predicted protein  30.2 
 
 		 320 aa  102  6e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000454395  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03156  translation initiation factor eIF2 alpha subunit (Eurofung)  24.91 
 
 		 308 aa  90.1  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119592  Eukaryotic translation initiation factor 2, alpha subunit  32.89 
 
 		 322 aa  75.1  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0150821  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2860  general stress protein 13  30.95 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1349  RNA-binding S1 domain-containing protein  34.95 
 
 		 543 aa  54.7  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.143474  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1301  RNA binding S1 domain protein  37.5 
 
 		 140 aa  54.3  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000152887  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1337  RNA-binding S1 domain-containing protein  32.69 
 
 		 543 aa  53.5  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000610744  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3511  general stress protein 13  30.53 
 
 		 133 aa  52.4  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2080  cytidylate kinase/ribosomal protein S1  34.78 
 
 		 811 aa  51.6  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3070  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.93 
 
 		 707 aa  50.8  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.526485  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0056  hypothetical protein  31.15 
 
 		 152 aa  49.7  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000148596  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1607  RNA-binding S1 domain-containing protein  33.78 
 
 		 365 aa  49.3  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00859677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4770  general stress protein 13  32.1 
 
 		 114 aa  48.9  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4610  general stress protein 13  32.1 
 
 		 114 aa  48.9  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4632  general stress protein 13  32.1 
 
 		 114 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5032  general stress protein 13  32.1 
 
 		 114 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0608546  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5132  general stress protein 13  32.1 
 
 		 114 aa  48.9  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1795  SSU ribosomal protein S1P  36 
 
 		 539 aa  49.3  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0056  hypothetical protein  39.74 
 
 		 132 aa  49.3  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0202  general stress protein 13  32.1 
 
 		 114 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4722  general stress protein 13  28.85 
 
 		 114 aa  48.9  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5011  general stress protein 13  32.1 
 
 		 114 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0745  30S ribosomal protein S1  34 
 
 		 491 aa  48.9  0.00009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.146171  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5039  general stress protein 13  32.1 
 
 		 114 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5044  general stress protein 13  32.1 
 
 		 114 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0696  hypothetical protein  35.11 
 
 		 140 aa  48.9  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000983919  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3006  general stress protein 13  30.11 
 
 		 124 aa  48.9  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0056  hypothetical protein  35.8 
 
 		 161 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000117621  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0059  hypothetical protein  35.8 
 
 		 160 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000544172  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0060  hypothetical protein  35.8 
 
 		 160 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0056  hypothetical protein  35.8 
 
 		 160 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.61011e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0056  hypothetical protein  35.8 
 
 		 160 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000079318  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0060  hypothetical protein  35.8 
 
 		 160 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0066  hypothetical protein  35.8 
 
 		 161 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000157952  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5250  hypothetical protein  35.8 
 
 		 161 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000341067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0070  hypothetical protein  35.8 
 
 		 160 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000137683  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3356  30S ribosomal protein S1  32.08 
 
 		 481 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0698685  normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1702  30S ribosomal protein S1  30.63 
 
 		 577 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3561  30S ribosomal protein S1  31.53 
 
 		 481 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0469219  normal  0.360425 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0058  hypothetical protein  37.5 
 
 		 132 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000238948  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0067  hypothetical protein  35.8 
 
 		 160 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2015  RNA-binding S1 domain-containing protein  30.38 
 
 		 411 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0652883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1102  30S ribosomal protein S1  34.72 
 
 		 401 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000946853  normal  0.0119462 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1450  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  32.98 
 
 		 718 aa  47.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.103052  normal  0.272177 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0191  RNA binding S1 domain protein  34.44 
 
 		 134 aa  47.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0235  30S ribosomal protein S1  33.72 
 
 		 577 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.00000120876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1618  RNA-binding S1 domain-containing protein  33.71 
 
 		 532 aa  47.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0601  30S ribosomal protein S1  34.02 
 
 		 500 aa  46.6  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1437  RNA binding S1 domain protein  30.77 
 
 		 400 aa  46.6  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.245145  normal  0.159598 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0092  RNA binding S1  28.32 
 
 		 130 aa  46.6  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000304617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2459  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.73 
 
 		 710 aa  46.6  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00423347  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0142  RNA binding S1 domain protein  36.78 
 
 		 128 aa  46.6  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000417569  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1540  30S ribosomal protein S1  33 
 
 		 558 aa  46.6  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0896  30S ribosomal protein S1  30.07 
 
 		 408 aa  46.6  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1597  30S ribosomal protein S1  33 
 
 		 558 aa  46.6  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1505  30S ribosomal protein S1  28.78 
 
 		 343 aa  46.2  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000040832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0122  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.49 
 
 		 126 aa  46.2  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0247  ribosomal protein S1  32.18 
 
 		 562 aa  45.8  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4663  30S ribosomal protein S1  32.91 
 
 		 390 aa  45.8  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0608752  decreased coverage  0.00279875 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1161  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  28.57 
 
 		 712 aa  45.4  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000184021  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3324  guanosine pentaphosphate synthetase I/polyribonucleotide nucleotidyltransferase  31.25 
 
 		 775 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.109983  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1112  RNA binding S1 domain protein  32.91 
 
 		 397 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000019918  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0402  30S ribosomal protein S1  30.36 
 
 		 567 aa  45.1  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0674  RNA binding S1  32.93 
 
 		 127 aa  45.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.175739 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0931  30S ribosomal protein S1  34.94 
 
 		 561 aa  45.4  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0923  30S ribosomal protein S1  31.91 
 
 		 576 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.261659  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3013  30S ribosomal protein S1  34.15 
 
 		 556 aa  45.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000348916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4028  30S ribosomal protein S1  31.65 
 
 		 321 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.861757  hitchhiker  0.00019437 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1730  RNA-binding S1 domain-containing protein  30.77 
 
 		 403 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0218599  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1587  30S ribosomal protein S1  37.65 
 
 		 559 aa  45.4  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000113977  hitchhiker  0.000457786 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0873  30S ribosomal protein S1  31.65 
 
 		 551 aa  44.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0435842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>