More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2488 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2488  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 
181 aa  363  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000402457  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  69.06 
 
 
181 aa  250  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  65.73 
 
 
178 aa  240  1e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  63.64 
 
 
181 aa  227  8e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  56.42 
 
 
179 aa  202  2e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  56.74 
 
 
180 aa  200  9.999999999999999e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  53.98 
 
 
180 aa  193  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  40.24 
 
 
192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.36 
 
 
180 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.48 
 
 
180 aa  99.4  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.06 
 
 
180 aa  95.1  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.52 
 
 
184 aa  94  9e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  36 
 
 
180 aa  94  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.95 
 
 
182 aa  94  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2585  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.87 
 
 
183 aa  93.2  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.78 
 
 
180 aa  90.9  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.22 
 
 
180 aa  89.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.41 
 
 
179 aa  89.4  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.49 
 
 
181 aa  88.6  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.24 
 
 
179 aa  87  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.68 
 
 
183 aa  86.3  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  28.98 
 
 
178 aa  86.7  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.94 
 
 
180 aa  85.5  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.49 
 
 
180 aa  85.5  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.18 
 
 
180 aa  85.1  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5430  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.49 
 
 
180 aa  85.1  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5433  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.49 
 
 
180 aa  85.1  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5486  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.49 
 
 
180 aa  85.1  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.151912  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  32.14 
 
 
190 aa  84.7  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5521  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.49 
 
 
180 aa  84.3  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000263908  hitchhiker  0.00000000000000110124 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  32.39 
 
 
188 aa  84.3  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.81 
 
 
179 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.56 
 
 
179 aa  84  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.32 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.93 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  30.64 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.75 
 
 
185 aa  82.4  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.37 
 
 
178 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.86 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.75 
 
 
185 aa  82.4  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.58 
 
 
179 aa  82  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5022  ATP synthase F1, delta subunit  31.21 
 
 
178 aa  81.6  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557058  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1028  ATP synthase F1, delta subunit  31.61 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.99 
 
 
179 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.39 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.39 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.39 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  32.93 
 
 
194 aa  79.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.39 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.13 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.39 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.01 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.44 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.41 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  26.67 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2760  ATP synthase F1, delta subunit  31.18 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.98 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  25.15 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.99 
 
 
193 aa  77.8  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.59 
 
 
184 aa  77.8  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0200  ATP synthase F1, delta subunit  31.74 
 
 
175 aa  77  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0296098  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.76 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.77 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3287  ATP synthase F1, delta subunit  30.23 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.19524  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3878  ATP synthase F1, delta subunit  28.82 
 
 
178 aa  75.9  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000205385  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.9 
 
 
190 aa  75.9  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  28.4 
 
 
217 aa  75.9  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0182  ATPase, delta subunit (H(+)-transporting two-sector ATPase)  31.52 
 
 
182 aa  75.9  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.861028 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2433  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.09 
 
 
178 aa  75.9  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.270416  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16541  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.4 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.536377  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0603  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.01 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1504  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.01 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.4 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 
186 aa  74.3  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  26.86 
 
 
182 aa  74.3  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.38 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0023  ATP synthase F1, delta subunit  28.65 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0910717  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3077  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.65 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26673  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.76 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0620  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.94 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.14 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2872  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.61 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2185  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.39 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3461  ATP synthase F1, delta subunit  29.65 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.330748  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.55 
 
 
186 aa  72.4  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0307  ATP synthase F1, delta subunit  31.76 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000503063  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.11 
 
 
186 aa  72  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3134  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.65 
 
 
179 aa  72  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  27.54 
 
 
190 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1232  ATP synthase F1, delta subunit  32.35 
 
 
186 aa  72.4  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  30.11 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16311  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.88 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.52 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.55 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002027  ATP synthase delta chain  30.94 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.002001  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2747  ATP synthase F1, delta subunit  35.4 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00491756  normal  0.287613 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2828  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3062  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.94 
 
 
177 aa  70.5  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7383  ATP synthase F1, delta subunit  26.35 
 
 
190 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.705381  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0019  ATP synthase F1, delta subunit  28.07 
 
 
178 aa  70.9  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000168594  hitchhiker  0.000447823 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>