More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1591 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1759  queuine tRNA-ribosyltransferase  80.27 
 
 
377 aa  652  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1591  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
379 aa  793  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00100827  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1756  queuine tRNA-ribosyltransferase  80.05 
 
 
377 aa  649  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.185271  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0712  queuine tRNA-ribosyltransferase  76.66 
 
 
377 aa  625  1e-178  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1404  queuine tRNA-ribosyltransferase  78.23 
 
 
376 aa  617  1e-175  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.2387 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0964  queuine tRNA-ribosyltransferase  72.65 
 
 
377 aa  589  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1512  queuine tRNA-ribosyltransferase  73.14 
 
 
379 aa  574  1e-163  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0710  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.13 
 
 
376 aa  448  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0500  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.93 
 
 
376 aa  410  1e-113  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.260336 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3359  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 
377 aa  407  1e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.142206  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1197  queuine tRNA-ribosyltransferase (tRNA-guanine transglycosylase)  51.76 
 
 
376 aa  402  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.196997  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1430  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.6 
 
 
376 aa  398  1e-110  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143529  normal  0.876583 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6918  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.4 
 
 
376 aa  398  1e-110  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.625358  normal  0.464203 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.94 
 
 
375 aa  400  1e-110  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00865  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.4 
 
 
376 aa  399  1e-110  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.37 
 
 
379 aa  395  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.37 
 
 
379 aa  395  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4079  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.68 
 
 
376 aa  396  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.137728 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0045  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.4 
 
 
376 aa  392  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.642849  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.94 
 
 
373 aa  392  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 
379 aa  385  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.33 
 
 
370 aa  385  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  3.78979e-06  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.81 
 
 
379 aa  385  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.53 
 
 
370 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1985  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.53 
 
 
376 aa  383  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.46 
 
 
380 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.88 
 
 
373 aa  383  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.56741e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
379 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  2.56565e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.87 
 
 
372 aa  378  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
379 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.28432e-05 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 
379 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  2.27158e-05  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
379 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.48017e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 
379 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  5.78318e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
379 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.70513e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.96 
 
 
372 aa  378  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.39 
 
 
395 aa  379  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
379 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  3.10592e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
379 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  5.75969e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
379 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  4.8864e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.2 
 
 
379 aa  376  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  8.51523e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.39 
 
 
380 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.96 
 
 
372 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.93 
 
 
372 aa  375  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
379 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0276  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.86 
 
 
377 aa  374  1e-102  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000356589  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2026  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.25 
 
 
407 aa  372  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.19 
 
 
357 aa  372  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.32 
 
 
374 aa  373  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
371 aa  370  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.3 
 
 
370 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.12 
 
 
367 aa  370  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.72 
 
 
380 aa  368  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.48 
 
 
380 aa  370  1e-101  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.8 
 
 
369 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.52 
 
 
379 aa  368  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1187  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.6 
 
 
384 aa  366  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00200873  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0026  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.2 
 
 
374 aa  365  1e-100  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.23 
 
 
371 aa  366  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.32 
 
 
373 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.6 
 
 
373 aa  366  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.31 
 
 
380 aa  365  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.18 
 
 
370 aa  365  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2757  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 
386 aa  365  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.717518 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2243  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.09 
 
 
375 aa  363  2e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.982522 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2247  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.33 
 
 
374 aa  363  2e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.929742  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.12 
 
 
374 aa  363  2e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2844  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.45 
 
 
377 aa  363  3e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2201  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.95 
 
 
380 aa  361  1e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1912  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.95 
 
 
380 aa  361  1e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.288264  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3270  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.05 
 
 
379 aa  361  1e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756074  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.9 
 
 
394 aa  360  3e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0820  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.41 
 
 
387 aa  360  3e-98  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0455  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.23 
 
 
384 aa  360  3e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.81 
 
 
382 aa  360  3e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3555  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.01 
 
 
378 aa  359  4e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2346  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.92 
 
 
376 aa  359  5e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.395355  normal  0.213508 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3296  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.77 
 
 
383 aa  359  5e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300958  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0770  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.96 
 
 
376 aa  359  5e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.196276 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1275  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.51 
 
 
336 aa  358  7e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0218  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.77 
 
 
376 aa  358  1e-97  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.989201  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3071  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.78 
 
 
383 aa  357  2e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.73 
 
 
355 aa  357  2e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.38291e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0019  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.05 
 
 
379 aa  357  2e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0133  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.96 
 
 
414 aa  357  2e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.954831  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0280  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.05 
 
 
375 aa  357  2e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1347  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.03 
 
 
372 aa  357  2e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2187  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.97 
 
 
375 aa  356  3e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1330  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.7 
 
 
365 aa  355  9e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.442991  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3438  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.68 
 
 
378 aa  354  2e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  2.61691e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2869  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.09 
 
 
380 aa  352  5e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.92 
 
 
372 aa  352  6e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3755  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.95 
 
 
387 aa  352  9e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.145582 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2876  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.27 
 
 
377 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1891  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.96 
 
 
380 aa  350  2e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186331  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.3 
 
 
388 aa  350  2e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1156  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.89 
 
 
388 aa  350  3e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10772  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3054  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.54 
 
 
379 aa  348  6e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0377683  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2804  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.67 
 
 
376 aa  349  6e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0175  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.09 
 
 
381 aa  348  9e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.82 
 
 
392 aa  348  9e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>