More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0500 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0500  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
376 aa  784    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.260336 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6918  queuine tRNA-ribosyltransferase  67.02 
 
 
376 aa  541  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.625358  normal  0.464203 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00865  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.89 
 
 
376 aa  528  1e-149  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4079  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.76 
 
 
376 aa  526  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.137728 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1985  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.1 
 
 
376 aa  514  1e-144  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0045  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.56 
 
 
376 aa  509  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.642849  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1430  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.77 
 
 
376 aa  507  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143529  normal  0.876583 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1197  queuine tRNA-ribosyltransferase (tRNA-guanine transglycosylase)  61.97 
 
 
376 aa  505  9.999999999999999e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.196997  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0710  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.56 
 
 
376 aa  501  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3359  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.13 
 
 
377 aa  499  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.142206  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0026  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.51 
 
 
374 aa  461  1e-129  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1759  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.81 
 
 
377 aa  424  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1756  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.74 
 
 
377 aa  408  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.185271  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1404  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.28 
 
 
376 aa  410  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.2387 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1591  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.93 
 
 
379 aa  410  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00100827  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0712  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.34 
 
 
377 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0964  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.6 
 
 
377 aa  403  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.96 
 
 
379 aa  399  9.999999999999999e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1512  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.67 
 
 
379 aa  400  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.13 
 
 
371 aa  398  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.21 
 
 
373 aa  395  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.62 
 
 
357 aa  397  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.07 
 
 
375 aa  389  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.95 
 
 
394 aa  390  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2844  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.23 
 
 
377 aa  391  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.69 
 
 
370 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2757  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.5 
 
 
386 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.717518 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.96 
 
 
370 aa  383  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.92 
 
 
392 aa  382  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2026  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.04 
 
 
407 aa  381  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.78 
 
 
372 aa  381  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.26 
 
 
374 aa  380  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.78 
 
 
372 aa  379  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.07 
 
 
373 aa  375  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.62 
 
 
373 aa  372  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.37 
 
 
370 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.69 
 
 
380 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.86 
 
 
370 aa  372  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.41 
 
 
380 aa  373  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2243  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.16 
 
 
375 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.982522 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.86 
 
 
380 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.84 
 
 
372 aa  373  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.68 
 
 
379 aa  371  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0276  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.81 
 
 
377 aa  370  1e-101  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000356589  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.8 
 
 
367 aa  370  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.68 
 
 
379 aa  371  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0144  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.59 
 
 
384 aa  368  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0518824  decreased coverage  0.000581764 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.56 
 
 
355 aa  365  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.99 
 
 
372 aa  366  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.96 
 
 
371 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.32 
 
 
379 aa  364  2e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.16 
 
 
373 aa  363  3e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1330  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
365 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.442991  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0084  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.59 
 
 
384 aa  361  1e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000052368  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.27 
 
 
374 aa  361  1e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.32 
 
 
395 aa  359  3e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.79 
 
 
379 aa  357  9.999999999999999e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.21 
 
 
379 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1866  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 
380 aa  358  9.999999999999999e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000457262  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.66 
 
 
379 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1927  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
383 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000713351  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.66 
 
 
379 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2876  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.68 
 
 
377 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.38 
 
 
379 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.38 
 
 
379 aa  356  5e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.38 
 
 
379 aa  356  5e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.38 
 
 
379 aa  356  5e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.38 
 
 
379 aa  356  5e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.38 
 
 
379 aa  356  5e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.38 
 
 
379 aa  356  5e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.38 
 
 
379 aa  356  5e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1267  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.76 
 
 
373 aa  355  6.999999999999999e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1268  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.18 
 
 
376 aa  353  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236624  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0218  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.09 
 
 
376 aa  353  2e-96  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.989201  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2182  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
374 aa  354  2e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1187  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.67 
 
 
384 aa  353  2e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00200873  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.58 
 
 
369 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.42 
 
 
381 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2247  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.32 
 
 
374 aa  353  4e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.929742  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0820  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.31 
 
 
387 aa  352  5e-96  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00354  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.45 
 
 
375 aa  351  1e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.520405  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3203  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.45 
 
 
375 aa  351  1e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.372376  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0436  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.45 
 
 
375 aa  351  1e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0325  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.45 
 
 
375 aa  351  1e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3733  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.38 
 
 
375 aa  351  1e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.812012  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00358  hypothetical protein  49.45 
 
 
375 aa  351  1e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.575633  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2191  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.77 
 
 
371 aa  351  1e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.314247 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.45 
 
 
375 aa  351  1e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000187089 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0486  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.45 
 
 
375 aa  351  1e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0476  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.45 
 
 
375 aa  351  1e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0438  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.45 
 
 
375 aa  351  1e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2997  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.85 
 
 
384 aa  350  2e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2476  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 
383 aa  350  3e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0019  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.86 
 
 
379 aa  350  3e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1938  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 
376 aa  349  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1771  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.7 
 
 
377 aa  349  4e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2187  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.8 
 
 
375 aa  349  5e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2647  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.63 
 
 
381 aa  349  6e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000956702  hitchhiker  0.00180241 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1752  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.86 
 
 
376 aa  349  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.543726  normal  0.0577466 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1321  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.6 
 
 
391 aa  348  7e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>