More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1404 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1756  queuine tRNA-ribosyltransferase  80.65 
 
 		 377 aa  635    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.185271  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1404  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 		 376 aa  782    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.2387 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1759  queuine tRNA-ribosyltransferase  76.53 
 
 		 377 aa  624  1e-178  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0712  queuine tRNA-ribosyltransferase  78.93 
 
 		 377 aa  620  1e-176  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0964  queuine tRNA-ribosyltransferase  76 
 
 		 377 aa  615  1e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1591  queuine tRNA-ribosyltransferase  78.23 
 
 		 379 aa  617  1e-175  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00100827  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1512  queuine tRNA-ribosyltransferase  74.93 
 
 		 379 aa  590  1e-167  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0710  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.88 
 
 		 376 aa  444  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.33 
 
 		 375 aa  420  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0500  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.28 
 
 		 376 aa  410  1e-113  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.260336 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3359  queuine tRNA-ribosyltransferase  52 
 
 		 377 aa  409  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.142206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4079  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.42 
 
 		 376 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.137728 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00865  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.87 
 
 		 376 aa  401  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.88 
 
 		 369 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1197  queuine tRNA-ribosyltransferase (tRNA-guanine transglycosylase)  51.34 
 
 		 376 aa  400  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.196997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.02 
 
 		 373 aa  392  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 		 370 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 		 370 aa  393  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6918  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.47 
 
 		 376 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.625358  normal  0.464203 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.68 
 
 		 379 aa  389  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.53 
 
 		 380 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.6 
 
 		 372 aa  388  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2026  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.88 
 
 		 407 aa  388  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.5 
 
 		 371 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.6 
 
 		 373 aa  390  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.68 
 
 		 379 aa  389  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1430  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.68 
 
 		 376 aa  389  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143529  normal  0.876583 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0045  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.6 
 
 		 376 aa  389  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.642849  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.19 
 
 		 370 aa  385  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.68 
 
 		 379 aa  385  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.94 
 
 		 374 aa  387  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2844  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.34 
 
 		 377 aa  386  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.4 
 
 		 395 aa  385  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2757  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.19 
 
 		 386 aa  383  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.717518 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.4 
 
 		 380 aa  382  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.48 
 
 		 379 aa  384  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.09 
 
 		 371 aa  384  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.13 
 
 		 367 aa  384  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.13 
 
 		 355 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.18 
 
 		 372 aa  379  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.18 
 
 		 372 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.96 
 
 		 372 aa  378  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0026  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.92 
 
 		 374 aa  380  1e-104  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.06 
 
 		 380 aa  380  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.47 
 
 		 380 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.62 
 
 		 373 aa  377  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 		 379 aa  378  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.86 
 
 		 357 aa  375  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.93 
 
 		 373 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.68 
 
 		 379 aa  375  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.68 
 
 		 379 aa  375  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.73 
 
 		 379 aa  375  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1985  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.26 
 
 		 376 aa  377  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.78 
 
 		 374 aa  378  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.68 
 
 		 379 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2243  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.73 
 
 		 375 aa  373  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.982522 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.68 
 
 		 379 aa  374  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.68 
 
 		 379 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.68 
 
 		 379 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.68 
 
 		 379 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.68 
 
 		 379 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.15 
 
 		 379 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0218  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.2 
 
 		 376 aa  372  1e-102  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.989201  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1347  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.65 
 
 		 372 aa  373  1e-102  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.68 
 
 		 379 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.67 
 
 		 388 aa  369  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.06 
 
 		 370 aa  369  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.43 
 
 		 380 aa  371  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1330  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.72 
 
 		 365 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.442991  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.85 
 
 		 394 aa  365  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2247  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.92 
 
 		 374 aa  365  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.929742  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.31 
 
 		 382 aa  365  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0820  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.67 
 
 		 387 aa  365  1e-100  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.26 
 
 		 368 aa  365  1e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2201  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.31 
 
 		 380 aa  364  1e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1912  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.31 
 
 		 380 aa  364  1e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.288264  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 		 372 aa  364  1e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.38 
 
 		 381 aa  363  3e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1187  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.79 
 
 		 384 aa  362  4e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00200873  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3123  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.98 
 
 		 374 aa  361  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00561158  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3384  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.98 
 
 		 374 aa  361  1e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000344335  normal  0.488605 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3264  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.98 
 
 		 374 aa  361  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000400897  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0681  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.72 
 
 		 370 aa  360  2e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.111123  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3291  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.11 
 
 		 381 aa  359  4e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.87 
 
 		 368 aa  358  6e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2187  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.71 
 
 		 375 aa  358  8e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3438  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.72 
 
 		 378 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000261691  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0133  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.81 
 
 		 414 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.954831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2876  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.13 
 
 		 377 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1275  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.21 
 
 		 336 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2906  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.11 
 
 		 387 aa  356  5e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.905549  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0276  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.68 
 
 		 377 aa  355  5e-97  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000356589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3555  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.21 
 
 		 378 aa  355  5.999999999999999e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1061  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.14 
 
 		 374 aa  355  6.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.84 
 
 		 387 aa  355  7.999999999999999e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0084  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 		 384 aa  355  7.999999999999999e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000052368  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0019  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.9 
 
 		 379 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3054  queuine tRNA-ribosyltransferase  48 
 
 		 379 aa  354  1e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0377683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2869  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.86 
 
 		 380 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3258  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.53 
 
 		 368 aa  354  1e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000643926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>