More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1512 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1512  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
379 aa  795    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0964  queuine tRNA-ribosyltransferase  82.49 
 
 
377 aa  672    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1404  queuine tRNA-ribosyltransferase  74.93 
 
 
376 aa  606  9.999999999999999e-173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.2387 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1756  queuine tRNA-ribosyltransferase  76.34 
 
 
377 aa  604  9.999999999999999e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.185271  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0712  queuine tRNA-ribosyltransferase  73.4 
 
 
377 aa  594  1e-168  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1759  queuine tRNA-ribosyltransferase  71.88 
 
 
377 aa  592  1e-168  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1591  queuine tRNA-ribosyltransferase  73.14 
 
 
379 aa  588  1e-167  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00100827  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0710  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.01 
 
 
376 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.66 
 
 
375 aa  433  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00865  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.69 
 
 
376 aa  432  1e-120  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1197  queuine tRNA-ribosyltransferase (tRNA-guanine transglycosylase)  53.37 
 
 
376 aa  433  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.196997  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0045  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.42 
 
 
376 aa  427  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.642849  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3359  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.21 
 
 
377 aa  428  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.142206  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1430  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.93 
 
 
376 aa  428  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143529  normal  0.876583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4079  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.39 
 
 
376 aa  418  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.137728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6918  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.15 
 
 
376 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.625358  normal  0.464203 
 
 
-
 
NC_002950  PG0500  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.67 
 
 
376 aa  413  1e-114  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.260336 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.94 
 
 
373 aa  412  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1985  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.88 
 
 
376 aa  409  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.92 
 
 
370 aa  411  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.54 
 
 
370 aa  407  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
369 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.48 
 
 
373 aa  404  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.87 
 
 
374 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.67 
 
 
367 aa  397  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.81 
 
 
379 aa  396  1e-109  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.86 
 
 
379 aa  392  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.4 
 
 
355 aa  391  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.66 
 
 
380 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.33 
 
 
372 aa  393  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 
379 aa  390  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.37 
 
 
380 aa  389  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 
380 aa  389  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.72 
 
 
379 aa  391  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.23 
 
 
372 aa  389  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2844  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.13 
 
 
377 aa  389  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.5 
 
 
372 aa  391  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 
373 aa  389  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.72 
 
 
379 aa  391  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.81 
 
 
382 aa  389  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.89 
 
 
380 aa  389  1e-107  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.6 
 
 
394 aa  388  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.31 
 
 
380 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.54 
 
 
370 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 
357 aa  387  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.79 
 
 
379 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.07 
 
 
379 aa  383  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.96 
 
 
371 aa  383  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.79 
 
 
379 aa  382  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.79 
 
 
379 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.79 
 
 
379 aa  382  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.79 
 
 
379 aa  382  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.79 
 
 
379 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.79 
 
 
379 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.19 
 
 
372 aa  382  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.36 
 
 
371 aa  382  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.9 
 
 
379 aa  383  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.34 
 
 
379 aa  382  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0276  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.13 
 
 
377 aa  383  1e-105  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000356589  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.07 
 
 
379 aa  383  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.09 
 
 
370 aa  379  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2026  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.69 
 
 
407 aa  380  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.82 
 
 
372 aa  379  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2757  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.7 
 
 
386 aa  381  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.717518 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1187  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.06 
 
 
384 aa  378  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00200873  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.96 
 
 
373 aa  376  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.09 
 
 
388 aa  377  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0820  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.87 
 
 
387 aa  375  1e-103  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2429  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.79 
 
 
367 aa  375  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0026  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.39 
 
 
374 aa  375  1e-103  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.59 
 
 
374 aa  375  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0455  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.24 
 
 
384 aa  372  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0514  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.34 
 
 
370 aa  372  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2201  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.73 
 
 
380 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1912  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.73 
 
 
380 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.288264  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.96 
 
 
395 aa  375  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0218  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.46 
 
 
376 aa  369  1e-101  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.989201  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.47 
 
 
367 aa  368  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2243  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.7 
 
 
375 aa  368  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.982522 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.01 
 
 
369 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114064  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.26 
 
 
368 aa  369  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1330  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.23 
 
 
365 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.442991  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.6 
 
 
368 aa  368  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0681  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.96 
 
 
370 aa  366  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.111123  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.82 
 
 
381 aa  365  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3755  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.83 
 
 
387 aa  364  1e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.145582 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0911  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.13 
 
 
368 aa  363  2e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8642e-32 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3258  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.33 
 
 
368 aa  363  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000643926  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0144  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.83 
 
 
384 aa  362  4e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0518824  decreased coverage  0.000581764 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.82 
 
 
369 aa  363  4e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2182  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.32 
 
 
374 aa  362  6e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2068  Queuine tRNA-ribosyltransferase  47.55 
 
 
371 aa  362  6e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3335  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.87 
 
 
368 aa  362  6e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00131766  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1275  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.62 
 
 
336 aa  361  1e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.98 
 
 
392 aa  361  1e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3278  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.4 
 
 
369 aa  361  1e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.275264  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.01 
 
 
387 aa  361  1e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2187  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.03 
 
 
375 aa  361  1e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0565  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.14 
 
 
373 aa  361  1e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.005662  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2247  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.58 
 
 
374 aa  360  2e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.929742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>