293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0010 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0010  cytochrome c class I  100 
 
 		 123 aa  258  2e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0031  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  60.32 
 
 		 126 aa  147  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214026  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2005  sulfide dehydrogenase, cytochrome subunit  58.14 
 
 		 127 aa  144  6e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0152993  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0011  cytochrome c class I  62.5 
 
 		 124 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.159983  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0009  cytochrome c class I  59.81 
 
 		 124 aa  133  8e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.136601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0010  cytochrome c class I  56.1 
 
 		 126 aa  130  6.999999999999999e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000266179  hitchhiker  0.00574029 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2034  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  50.72 
 
 		 98 aa  76.6  0.00000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.738809 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1162  cytochrome c, class I  43.84 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.806523  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2995  cytochrome c, class I  48 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1738  cytochrome c, class I  43.84 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0626  cytochrome c class I  44.12 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1330  cytochrome c553-like protein  39.73 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.219398  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3047  cytochrome c class I  45.33 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.545307  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0237  cytochrome c, class I  34.34 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424011  normal  0.118914 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1673  cytochrome c, class I  34.78 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0729  hypothetical protein  47.83 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1946  cytochrome c, class I  39.19 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0592942  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  36.67 
 
 		 222 aa  63.5  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3330  cytochrome c553-like protein  47.89 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2428  putative cytochrome c  46.38 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1665  cytochrome c, class I  43.48 
 
 		 104 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0134409  normal  0.341373 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  43.48 
 
 		 107 aa  62  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4567  cytochrome c class I  45.07 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798656  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3262  cytochrome c, class I  42.67 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161977  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  44.12 
 
 		 102 aa  62  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4438  cytochrome c553-like  45.59 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  34.4 
 
 		 265 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3427  cytochrome c, class I  38.68 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  38.1 
 
 		 217 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0685  cytochrome c class I  31.03 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18451  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  43.59 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1266  cytochrome c, class I  43.06 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.14391  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  42.86 
 
 		 318 aa  58.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1844  cytochrome c class I  38.2 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000314475  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0281  cytochrome c class I  41.67 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  42.5 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0299  cytochrome c, class I  44.05 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  39.73 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0308  cytochrome c class I  44.05 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618372  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5760  cytochrome c class I  36.99 
 
 		 266 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  40.48 
 
 		 215 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4839  cytochrome c, class I  44.62 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.173442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  40.48 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  40.48 
 
 		 265 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  40.48 
 
 		 265 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3479  cytochrome c, class I  42.86 
 
 		 217 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0380  cytochrome c, class I  42.86 
 
 		 217 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  40.48 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  40.48 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2727  cytochrome c, class I  42.86 
 
 		 217 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0359  cytochrome c class I  42.86 
 
 		 217 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1464  cytochrome c, class I  47.62 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00242813  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3745  cytochrome C  40.48 
 
 		 545 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110713  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  36.23 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  45.16 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  40 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  41.43 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0687  cytochrome c class I  42.11 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  38.67 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0982  cytochrome c class I  31.03 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0520697  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4954  Cytochrome c553-like protein  36.84 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  41.27 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2873  cytochrome c family protein  35.71 
 
 		 262 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  38.03 
 
 		 227 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  35.44 
 
 		 207 aa  53.9  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3028  class I cytochrome c  42.86 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135761  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4249  putative cytochrome subunit of sulfide dehydrogenase  36.84 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.22639 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  43.75 
 
 		 237 aa  53.9  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3771  putative cytochrome c  32.71 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  32.97 
 
 		 224 aa  53.9  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  36.99 
 
 		 205 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00327  cytochrome C552  38.67 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1354  cytochrome c family protein  35.71 
 
 		 262 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1493  putative cytochrome c related protein  35.71 
 
 		 262 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.164831  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  39.13 
 
 		 382 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  41.54 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4365  cytochrome subunit of sulfide dehydrogenase  40.51 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1360  cytochrome c family protein  35.71 
 
 		 262 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.264003  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  34.29 
 
 		 216 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  34.29 
 
 		 217 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1185  cytochrome c family protein  37.88 
 
 		 214 aa  52.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  36.05 
 
 		 211 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  33.33 
 
 		 205 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0115  class I triheme cytochrome c  43.94 
 
 		 414 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  39.06 
 
 		 221 aa  52  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 200 aa  52.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1751  cytochrome c, class I  43.94 
 
 		 414 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.399641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2985  cytochrome c553-like protein  33.61 
 
 		 281 aa  52  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2741  class I diheme cytochrome c4  34.04 
 
 		 198 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.236816  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2756  putative cytochrome c  33.64 
 
 		 217 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3265  cytochrome c class I  39.39 
 
 		 219 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838246  normal  0.141063 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1704  cytochrome c, monohaem  43.08 
 
 		 878 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2578  hypothetical protein  39.71 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.365734 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  35.82 
 
 		 191 aa  50.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  41.54 
 
 		 225 aa  50.4  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1400  class I diheme cytochrome c4  34.04 
 
 		 198 aa  50.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  35 
 
 		 205 aa  50.4  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2918  cytochrome c class I  39.39 
 
 		 219 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059713 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1071  cytochrome c, class I  30.97 
 
 		 105 aa  50.4  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0930552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0769  putative cytochrome c  31.86 
 
 		 199 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>