More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2683 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2683  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 209 aa  399  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29940  two component transcriptional regulator, LuxR family  71.36 
 
 		 234 aa  266  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.683883 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  68.27 
 
 		 212 aa  266  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0606  two component transcriptional regulator, LuxR family  72.06 
 
 		 212 aa  265  5e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  66.83 
 
 		 211 aa  251  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  62.25 
 
 		 207 aa  247  8e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.39 
 
 		 211 aa  241  5e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  60.78 
 
 		 209 aa  237  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  60.29 
 
 		 212 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6980  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.17 
 
 		 213 aa  230  9e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.84 
 
 		 210 aa  228  6e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  57.35 
 
 		 217 aa  220  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0615  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.82 
 
 		 216 aa  217  7.999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3541  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.9 
 
 		 211 aa  211  7.999999999999999e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.485125  normal  0.513005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0074  response regulator receiver protein  55.56 
 
 		 207 aa  209  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.24 
 
 		 222 aa  209  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0277  response regulator receiver protein  56.37 
 
 		 214 aa  204  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0928  response regulator receiver protein  57.28 
 
 		 207 aa  203  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0513  two component transcriptional regulator, LuxR family  63.24 
 
 		 209 aa  203  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.52986  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  53.37 
 
 		 209 aa  198  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.11 
 
 		 213 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4922  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.45 
 
 		 206 aa  191  8e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0302523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4606  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.17 
 
 		 207 aa  190  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.296562 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.77 
 
 		 226 aa  190  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 229 aa  187  9e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  47.77 
 
 		 226 aa  185  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0232  response regulator receiver protein  50.95 
 
 		 213 aa  184  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  45.19 
 
 		 218 aa  183  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  47.89 
 
 		 218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18530  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  52.63 
 
 		 209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1936  response regulator receiver protein  53.88 
 
 		 205 aa  182  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4946  two component transcriptional regulator, LuxR family  47 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  43.13 
 
 		 216 aa  181  5.0000000000000004e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  46.67 
 
 		 227 aa  181  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3811  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.73 
 
 		 206 aa  180  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252848 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7301  response regulator receiver protein  47.89 
 
 		 220 aa  180  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.86 
 
 		 225 aa  180  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2881  response regulator receiver  51.67 
 
 		 220 aa  181  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00126066  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.22 
 
 		 218 aa  180  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3632  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.24 
 
 		 209 aa  179  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00835522  normal  0.0174868 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0278  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.95 
 
 		 225 aa  179  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000789071 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  47.32 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.47 
 
 		 221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3251  response regulator receiver protein  45.83 
 
 		 221 aa  178  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0642  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.31 
 
 		 208 aa  178  4.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0485  two component LuxR family transcriptional regulator  51.81 
 
 		 208 aa  177  8e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0855535  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 221 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  48.13 
 
 		 216 aa  176  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2340  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.26 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 219 aa  175  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.23 
 
 		 225 aa  175  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9329  response regulator receiver protein  46.33 
 
 		 217 aa  175  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0116  two component LuxR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 209 aa  175  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0717  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 209 aa  174  6e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.854815  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 222 aa  174  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.07 
 
 		 215 aa  174  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0480  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.44 
 
 		 214 aa  174  8e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  47.03 
 
 		 230 aa  174  8e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 213 aa  174  8e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.96 
 
 		 227 aa  174  9e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 222 aa  174  9e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.6 
 
 		 217 aa  173  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.47 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.5 
 
 		 218 aa  174  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4002  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 222 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.947887  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0549  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.2 
 
 		 220 aa  172  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1972  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 217 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000794288  unclonable  0.0000000332591 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.29 
 
 		 209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  46.33 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.69 
 
 		 231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.33 
 
 		 224 aa  172  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.31 
 
 		 210 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  46.7 
 
 		 223 aa  171  7.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00310  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  48.84 
 
 		 213 aa  171  9e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 228 aa  170  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.41 
 
 		 209 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 225 aa  170  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 222 aa  170  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7160  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.7 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.79 
 
 		 216 aa  169  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.33 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.37 
 
 		 230 aa  169  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  44.49 
 
 		 228 aa  169  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 212 aa  169  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3380  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.3 
 
 		 222 aa  169  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1845  LuxR response regulator receiver  45.58 
 
 		 215 aa  169  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00433344  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  42.79 
 
 		 215 aa  168  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 215 aa  168  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1940  LuxR response regulator receiver  42.18 
 
 		 222 aa  168  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.95717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2635  response regulator receiver  48.04 
 
 		 207 aa  168  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  47.34 
 
 		 227 aa  168  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1938  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 209 aa  168  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1972  response regulator receiver  40.38 
 
 		 209 aa  168  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  46.51 
 
 		 220 aa  168  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4778  two component LuxR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 208 aa  168  6e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000269792  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.58 
 
 		 225 aa  168  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0767  LuxR response regulator receiver  46.08 
 
 		 221 aa  167  8e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.88397  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25060  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  44.6 
 
 		 222 aa  167  9e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.444591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>