More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_07010 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_07010  ribonuclease HII  100 
 
 
262 aa  531  1e-150  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  7.06526e-06  normal  0.43338 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10380  ribonuclease HII  59.14 
 
 
258 aa  298  5e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  2.18298e-06  unclonable  1.18399e-09 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1405  Ribonuclease H  58.69 
 
 
262 aa  240  2e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  1.42088e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0699  Ribonuclease H  48.22 
 
 
257 aa  220  2e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  4.99736e-09  hitchhiker  4.00312e-06 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  36.08 
 
 
277 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  38.6 
 
 
268 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.13775e-09  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1960  ribonuclease HII  35.6 
 
 
272 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.317166  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1678  ribonuclease HII  35.6 
 
 
272 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.652859  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  38.12 
 
 
253 aa  166  5e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  37.68 
 
 
242 aa  163  2e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  42.51 
 
 
255 aa  162  4e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  36.25 
 
 
257 aa  162  5e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  41.76 
 
 
256 aa  161  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  37.61 
 
 
257 aa  152  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  40.43 
 
 
250 aa  150  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  34.8 
 
 
254 aa  149  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  39.04 
 
 
253 aa  149  3e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  35.06 
 
 
256 aa  149  4e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  35.41 
 
 
308 aa  148  7e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  42.62 
 
 
206 aa  148  1e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  6.92909e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  37.35 
 
 
255 aa  147  2e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  44.2 
 
 
198 aa  147  2e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  2.94513e-05 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  37.05 
 
 
260 aa  146  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.19683e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  36.65 
 
 
259 aa  146  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  6.48841e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  46.41 
 
 
209 aa  145  9e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  46.41 
 
 
209 aa  145  9e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1328  ribonuclease HII  36 
 
 
255 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.506161  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  37.45 
 
 
338 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1303  ribonuclease HII  36 
 
 
255 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00555633  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1415  ribonuclease HII  36.9 
 
 
258 aa  144  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000335536  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  34.92 
 
 
257 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.97601e-62 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  41.81 
 
 
197 aa  143  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  41.71 
 
 
205 aa  142  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  39.3 
 
 
255 aa  142  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  34.92 
 
 
257 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  7.80116e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  43.52 
 
 
214 aa  142  5e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  34.92 
 
 
257 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  38.89 
 
 
260 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  35.71 
 
 
257 aa  142  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  6.11644e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  34.92 
 
 
257 aa  142  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.96428e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  35.32 
 
 
257 aa  142  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0976  ribonuclease H  43.06 
 
 
206 aa  141  8e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  38.05 
 
 
257 aa  140  1e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  3.3795e-07  unclonable  9.76968e-26 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0664  ribonuclease HII  40.43 
 
 
267 aa  141  1e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0628332  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  41.84 
 
 
221 aa  141  1e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  35.32 
 
 
257 aa  140  2e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  6.96667e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  45.86 
 
 
240 aa  140  2e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  33.73 
 
 
256 aa  139  4e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  45.51 
 
 
210 aa  139  5e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0342  ribonuclease HII  43.09 
 
 
184 aa  139  5e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0247134  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0011  ribonuclease HII  44.26 
 
 
208 aa  137  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  1.50276e-09  normal  0.177364 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0963  ribonuclease HII  44.94 
 
 
198 aa  136  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.765501  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  42.54 
 
 
235 aa  135  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  42.52 
 
 
307 aa  135  5e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1993  ribonuclease HII  43.17 
 
 
206 aa  135  5e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0017  ribonuclease HII  43.78 
 
 
299 aa  135  6e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  39.78 
 
 
225 aa  135  7e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  38.89 
 
 
248 aa  134  1e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  43.02 
 
 
226 aa  134  2e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  1.43368e-05  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0628  ribonuclease H  43.17 
 
 
210 aa  134  2e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  41.76 
 
 
248 aa  134  2e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  44.13 
 
 
236 aa  133  2e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  37.91 
 
 
206 aa  134  2e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  4.38708e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  42.7 
 
 
198 aa  133  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  41.01 
 
 
212 aa  133  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  41.24 
 
 
206 aa  132  4e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  41.34 
 
 
204 aa  133  4e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  40.33 
 
 
249 aa  133  4e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  45.65 
 
 
212 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  44.38 
 
 
201 aa  132  6e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  45.65 
 
 
212 aa  132  8e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  41.01 
 
 
203 aa  131  9e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  42.94 
 
 
198 aa  131  9e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  43.58 
 
 
232 aa  131  1e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  38.86 
 
 
217 aa  131  1e-29  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  43.58 
 
 
232 aa  131  1e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  41.01 
 
 
211 aa  131  1e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1923  ribonuclease HII  36.62 
 
 
221 aa  130  2e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1991  Ribonuclease H  37.1 
 
 
232 aa  130  2e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.7081e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  41.94 
 
 
214 aa  130  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  41.44 
 
 
208 aa  130  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  42.7 
 
 
201 aa  129  4e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  38 
 
 
213 aa  129  4e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01115  ribonuclease HII  46.67 
 
 
211 aa  129  4e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0002331  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  41.58 
 
 
208 aa  129  4e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  39.89 
 
 
196 aa  129  4e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  42.13 
 
 
201 aa  129  5e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2147  ribonuclease HII  39.79 
 
 
220 aa  129  6e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  42.37 
 
 
198 aa  129  6e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1839  ribonuclease HII  44.68 
 
 
196 aa  129  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.010294  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0017  ribonuclease HII  45.16 
 
 
206 aa  129  6e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00136282  unclonable  9.28974e-07 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1765  ribonuclease HII  40.54 
 
 
183 aa  128  7e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0654906  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0189  Ribonuclease H  37.99 
 
 
197 aa  129  7e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.682381  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  41.81 
 
 
198 aa  129  7e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0280  ribonuclease HII  37.63 
 
 
188 aa  128  8e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.259622  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1292  Ribonuclease H  32.97 
 
 
209 aa  128  8e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  3.58144e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  44.38 
 
 
229 aa  128  9e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  41.75 
 
 
210 aa  128  1e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  39.13 
 
 
230 aa  128  1e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  44.2 
 
 
191 aa  127  1e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>