89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4559 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4559  pyrimidine 5'-nucleotidase  100 
 
 
222 aa  449  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0455  pyrimidine 5'-nucleotidase  47.06 
 
 
240 aa  202  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0294  pyrimidine 5'-nucleotidase  45.95 
 
 
248 aa  192  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1243  pyrimidine 5-nucleotidase  44.44 
 
 
213 aa  181  7e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.882257  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0657  pyrimidine 5'-nucleotidase  45.41 
 
 
215 aa  179  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.114356 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0065  pyrimidine 5'-nucleotidase  44.75 
 
 
237 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.284923  decreased coverage  0.00705345 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2912  pyrimidine 5'-nucleotidase  45.83 
 
 
280 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0082  pyrimidine 5'-nucleotidase  44.75 
 
 
235 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723897  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0449  hydrolase  44 
 
 
250 aa  178  5.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2827  pyrimidine 5-nucleotidase  46.96 
 
 
237 aa  176  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.112564  normal  0.0242793 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0382  pyrimidine 5'-nucleotidase  41.78 
 
 
232 aa  175  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0582701  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0955  pyrimidine 5'-nucleotidase  43.69 
 
 
249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.559689  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2620  pyrimidine 5'-nucleotidase  43.24 
 
 
248 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0626666 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1026  HAD superfamily hydrolase  48.9 
 
 
234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2341  pyrimidine 5'-nucleotidase  43.24 
 
 
248 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3343  pyrimidine 5-nucleotidase  46.19 
 
 
238 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0967  HAD superfamily hydrolase  48.9 
 
 
234 aa  171  9e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2297  pyrimidine 5-nucleotidase  42.59 
 
 
214 aa  170  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2390  putative pyrimidine 5'-nucleotidase  42.79 
 
 
215 aa  171  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.664306  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0520  pyrimidine 5'-nucleotidase  42.92 
 
 
215 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2296  pyrimidine 5'-nucleotidase  42.06 
 
 
243 aa  169  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.310547 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1870  hydrolase  42.92 
 
 
215 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3943  pyrimidine 5'-nucleotidase  43.52 
 
 
228 aa  166  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3072  HAD family hydrolase  42.19 
 
 
220 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791447  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0631  pyrimidine 5'-nucleotidase  43.06 
 
 
233 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1385  pyrimidine 5'-nucleotidase  44.04 
 
 
243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0603953  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0867  pyrimidine 5'-nucleotidase  43.36 
 
 
243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.652613  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1204  pyrimidine 5'-nucleotidase  47.22 
 
 
240 aa  164  8e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00476471 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0812  pyrimidine 5-nucleotidase  41.59 
 
 
235 aa  164  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935066  normal  0.61408 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3331  pyrimidine 5'-nucleotidase  47.83 
 
 
268 aa  164  9e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.142582 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1357  pyrimidine 5'-nucleotidase  49.45 
 
 
234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0074  pyrimidine 5-nucleotidase  42.86 
 
 
233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0135144 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0071  pyrimidine 5'-nucleotidase  40.54 
 
 
237 aa  162  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0142063  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0678  pyrimidine 5-nucleotidase  42.04 
 
 
236 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7331  HAD-superfamily hydrolase  41.63 
 
 
231 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.178908  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1899  pyrimidine 5'-nucleotidase  44.55 
 
 
249 aa  159  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.226115  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3070  pyrimidine 5-nucleotidase  38.77 
 
 
238 aa  154  7e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3699  pyrimidine 5-nucleotidase  39.09 
 
 
237 aa  151  7e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1836  pyrimidine 5-nucleotidase  41.71 
 
 
229 aa  148  6e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00207221  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1534  pyrimidine 5'-nucleotidase  42.62 
 
 
216 aa  145  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.78669  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0010  pyrimidine 5'-nucleotidase  39.44 
 
 
221 aa  124  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32249  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0628  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  34.62 
 
 
212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.821924  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2059  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.36 
 
 
214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288048  normal  0.220082 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2256  pyrimidine 5-nucleotidase  33.33 
 
 
241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0948171  hitchhiker  0.0000228381 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2923  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.72 
 
 
220 aa  109  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0724502  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0541  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.04 
 
 
233 aa  108  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2986  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.2 
 
 
217 aa  100  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0234941  hitchhiker  0.000703738 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0337  pyrimidine 5'-nucleotidase  35.26 
 
 
267 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0063  pyrimidine 5'-nucleotidase  33.51 
 
 
252 aa  95.1  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.264362  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0500  hypothetical protein  32.97 
 
 
243 aa  95.1  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0032  hypothetical protein  33.16 
 
 
287 aa  94.7  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0181  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  33.16 
 
 
322 aa  94  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3395  pyrimidine 5'-nucleotidase  32.84 
 
 
281 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3718  pyrimidine 5'-nucleotidase  33.16 
 
 
285 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3097  pyrimidine 5'-nucleotidase  36.65 
 
 
263 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.143226  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2483  pyrimidine 5-nucleotidase  36.65 
 
 
263 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0380059  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3113  pyrimidine 5'-nucleotidase  35.6 
 
 
263 aa  89  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.735685 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3248  HAD-superfamily hydrolase  33.68 
 
 
267 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.800899  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3439  HAD-superfamily hydrolase  33.68 
 
 
267 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0194  HAD-superfamily hydrolase  33.68 
 
 
267 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0184  HAD-superfamily hydrolase  33.68 
 
 
267 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610769  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2180  HAD-superfamily hydrolase  33.68 
 
 
267 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2909  HAD-superfamily hydrolase  33.68 
 
 
267 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378471  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0159  HAD-superfamily hydrolase  33.16 
 
 
267 aa  87.8  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0141  pyrimidine 5-nucleotidase  31.35 
 
 
334 aa  87.4  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0804995 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4386  HAD family hydrolase  33.16 
 
 
267 aa  85.9  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_7521  predicted protein  30.11 
 
 
212 aa  85.9  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0283312  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6448  HAD family hydrolase  31.65 
 
 
263 aa  85.5  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.895915  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3093  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.39 
 
 
263 aa  85.1  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3144  pyrimidine 5'-nucleotidase  32.98 
 
 
263 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3006  pyrimidine 5'-nucleotidase  32.98 
 
 
263 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18726  predicted protein  33.16 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.245332 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84214  suppressor of deletion of TFIIS  26.24 
 
 
287 aa  62.8  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538947  normal  0.0127046 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06325  pyrimidine 5'-nucleotidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13470)  27.07 
 
 
223 aa  60.1  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.882261  normal  0.0669048 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9879  predicted protein  30 
 
 
188 aa  60.5  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.753142  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15835  predicted protein  39.62 
 
 
190 aa  58.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0367369  normal  0.333156 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0495  hydrolase  29.12 
 
 
232 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0765  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.95 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20560  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.43 
 
 
246 aa  42.4  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.497192 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.47 
 
 
212 aa  42.7  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0762  HAD family hydrolase  25.37 
 
 
229 aa  42.7  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0896  HAD-superfamily hydrolase  32.09 
 
 
228 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1518  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  22.92 
 
 
216 aa  42  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2443  HAD-superfamily hydrolase  32.09 
 
 
228 aa  42  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151709  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0730  haloacid dehalogenase, IA family protein  32.09 
 
 
228 aa  42  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2363  HAD-superfamily hydrolase  32.09 
 
 
228 aa  42  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340076  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2715  HAD-superfamily hydrolase  32.09 
 
 
228 aa  42  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0231  HAD-superfamily hydrolase  32.09 
 
 
228 aa  42  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2179  HAD family hydrolase  28.21 
 
 
223 aa  41.6  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.812633 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>