More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7403 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7403  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 
618 aa  1184    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1593  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.11 
 
 
512 aa  268  2e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421913  normal  0.822638 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0353  trypsin-like serine protease  43.43 
 
 
583 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.326819  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0620  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.11 
 
 
674 aa  253  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.98 
 
 
417 aa  250  5e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.63894  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1398  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.43 
 
 
349 aa  245  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7239  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.71 
 
 
569 aa  239  9e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  43.17 
 
 
423 aa  236  6e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4679  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.46 
 
 
440 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0383364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4299  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.46 
 
 
440 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4385  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.46 
 
 
440 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.7 
 
 
579 aa  229  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11001  serine protease pepD  45.83 
 
 
464 aa  229  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000053367  normal  0.424973 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1889  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.64 
 
 
515 aa  226  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5199  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.46 
 
 
640 aa  225  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.219359  normal  0.800514 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32730  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  39.44 
 
 
443 aa  221  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229019  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4006  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.81 
 
 
497 aa  216  8e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503851  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0658  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.79 
 
 
434 aa  213  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3992  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.89 
 
 
501 aa  213  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4066  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.89 
 
 
501 aa  213  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3284  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.87 
 
 
420 aa  211  4e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.71487  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0850  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.77 
 
 
475 aa  211  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0856  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.77 
 
 
475 aa  211  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0131628  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0867  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.77 
 
 
475 aa  211  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2158  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.88 
 
 
507 aa  208  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0489221  normal  0.0113989 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4842  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.24 
 
 
456 aa  208  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.369386 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3684  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.88 
 
 
518 aa  206  7e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.358044  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0459  2-alkenal reductase  37.53 
 
 
584 aa  206  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8413  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  37.01 
 
 
527 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3273  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  38.76 
 
 
485 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4062  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.22 
 
 
524 aa  204  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1859  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.09 
 
 
544 aa  204  5e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.308507  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1186  HtrA2 peptidase  35.92 
 
 
597 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.934322  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06450  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  39.28 
 
 
517 aa  201  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5142  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  40.95 
 
 
614 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309432  normal  0.441282 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0705  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.48 
 
 
439 aa  199  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2919  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.5 
 
 
558 aa  198  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  hitchhiker  0.00800528 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2202  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.72 
 
 
497 aa  191  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.718376  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0797  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.45 
 
 
512 aa  190  7e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11247  serine protease htrA  36.24 
 
 
528 aa  190  8e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.039312  hitchhiker  0.00292251 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1069  PDZ/DHR/GLGF domain protein  36.7 
 
 
497 aa  189  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.905759  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1008  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.81 
 
 
487 aa  187  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24150  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  34.45 
 
 
515 aa  188  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0659  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.91 
 
 
428 aa  187  7e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.397901  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3888  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.85 
 
 
506 aa  186  9e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0507  trypsin-like serine protease  35.32 
 
 
489 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0535  2-alkenal reductase  40.96 
 
 
469 aa  184  5.0000000000000004e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.474663  normal  0.227386 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0886  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.74 
 
 
916 aa  183  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.421013 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3830  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.54 
 
 
515 aa  183  8.000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778945  normal  0.0341938 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0712  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.3 
 
 
426 aa  183  8.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.482576 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0813  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.82 
 
 
485 aa  183  9.000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  33.81 
 
 
467 aa  183  9.000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3234  2-alkenal reductase  39.89 
 
 
575 aa  182  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222667  normal  0.0363808 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1353  trypsin-like serine protease  36.41 
 
 
673 aa  181  2e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4494  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.04 
 
 
496 aa  182  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.18457  normal  0.102663 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.4 
 
 
545 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331753  normal  0.316507 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1212  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.29 
 
 
471 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152583  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3622  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.5 
 
 
486 aa  177  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0344622  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2743  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  32.32 
 
 
545 aa  177  6e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4901  HtrA2 peptidase  35.85 
 
 
407 aa  173  7.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25880  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  37.02 
 
 
537 aa  172  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10940  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  36.86 
 
 
539 aa  170  8e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000345024  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2092  protease Do  31.55 
 
 
471 aa  170  8e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  38.75 
 
 
459 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07340  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  36.38 
 
 
552 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.191801 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2439  trypsin-like serine protease  32.24 
 
 
407 aa  168  2.9999999999999998e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0015948  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0016  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.67 
 
 
401 aa  167  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  38.75 
 
 
459 aa  167  4e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  37.1 
 
 
393 aa  166  9e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1344  trypsin  35.49 
 
 
594 aa  165  2.0000000000000002e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0379667 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1946  trypsin-like serine protease  38.51 
 
 
379 aa  164  4.0000000000000004e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2174  serine protease  34.39 
 
 
409 aa  164  5.0000000000000005e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00156367  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  36.59 
 
 
393 aa  163  8.000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016371  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0593  htrA protein  34.23 
 
 
498 aa  162  1e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0069  trypsin-like serine protease  41.28 
 
 
419 aa  163  1e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0357916  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  31.94 
 
 
409 aa  162  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.12 
 
 
486 aa  161  3e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12778  serine protease precursor  33.73 
 
 
467 aa  161  3e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2417  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.76 
 
 
392 aa  160  5e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0358901  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1125  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.38 
 
 
523 aa  160  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33278  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  37.09 
 
 
453 aa  160  5e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0052  serine protease  35.69 
 
 
483 aa  159  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292411 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  37.85 
 
 
389 aa  158  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  37.32 
 
 
511 aa  158  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  34.12 
 
 
383 aa  158  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  33.33 
 
 
482 aa  157  4e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.91 
 
 
379 aa  157  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  33.43 
 
 
485 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  31.85 
 
 
453 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  34.52 
 
 
522 aa  157  6e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  36.07 
 
 
487 aa  157  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  38.28 
 
 
411 aa  156  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  35.61 
 
 
379 aa  156  9e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2002  trypsin-like serine protease  34.97 
 
 
411 aa  156  9e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.172847  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  35.01 
 
 
518 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0580  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.24 
 
 
361 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2247  peptidase S1C, Do  35.48 
 
 
497 aa  156  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3025  2-alkenal reductase  38.46 
 
 
413 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0951822  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  31.86 
 
 
442 aa  156  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1398  protease Do  38.89 
 
 
496 aa  156  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>