More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2378 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3214  alanyl-tRNA synthetase  59.66 
 
 
881 aa  1015  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0063614  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 
880 aa  673  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2033  alanyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 
879 aa  639  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1750  alanyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 
879 aa  637  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 
874 aa  637  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  41.17 
 
 
877 aa  673  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.63922e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 
874 aa  660  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4054  alanyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 
874 aa  644  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100715  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2617  alanyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 
879 aa  636  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00109675  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1819  alanyl-tRNA synthetase  58.39 
 
 
892 aa  1025  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  3.66282e-05 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1694  alanyl-tRNA synthetase  60 
 
 
892 aa  1023  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0569274  normal  0.130258 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2346  alanyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 
897 aa  840  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413447  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 
897 aa  678  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0616  alanyl-tRNA synthetase  52.31 
 
 
893 aa  865  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 
876 aa  645  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 
878 aa  642  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0744  alanyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 
888 aa  636  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.453512  normal  0.711122 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 
874 aa  658  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 
874 aa  654  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 
874 aa  658  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 
874 aa  678  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 
874 aa  676  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 
884 aa  670  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
892 aa  658  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.00247e-06  unclonable  3.09197e-08 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 
874 aa  674  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1828  alanyl-tRNA synthetase  58.17 
 
 
892 aa  1014  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222093  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3763  alanyl-tRNA synthetase  53.41 
 
 
898 aa  857  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 
878 aa  703  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0705  alanyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 
874 aa  640  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722358  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1423  alanyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 
874 aa  640  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429159  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2387  alanyl-tRNA synthetase  52.33 
 
 
897 aa  838  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.648952  normal  0.0242506 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 
863 aa  639  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1660  alanyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 
874 aa  640  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0773336  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1637  alanyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 
874 aa  639  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365835  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 
880 aa  703  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2640  alanyl-tRNA synthetase  52.61 
 
 
898 aa  829  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747101  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2393  alanyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 
897 aa  840  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.545162 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2278  alanyl-tRNA synthetase  54.53 
 
 
892 aa  940  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00416969  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 
897 aa  678  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 
878 aa  657  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3032  alanyl-tRNA synthetase  59.21 
 
 
893 aa  1008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1330  alanyl-tRNA synthetase  61.77 
 
 
886 aa  1034  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0429057  normal  0.324853 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 
878 aa  655  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12576  alanyl-tRNA synthetase  52 
 
 
904 aa  845  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.251019  normal  0.0860525 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3223  alanyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 
931 aa  636  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2407  alanyl-tRNA synthetase  61.02 
 
 
896 aa  994  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.714506  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 
876 aa  659  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0455  alanyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 
874 aa  640  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.70342  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3075  alanyl-tRNA synthetase  59.82 
 
 
888 aa  1015  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2320  alanyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 
900 aa  872  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.871367  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3297  alanyl-tRNA synthetase  53.97 
 
 
891 aa  910  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000320998  normal  0.10569 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0895  alanyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 
874 aa  640  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131636  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 
878 aa  691  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  1.49569e-05 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 
879 aa  660  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1351  alanyl-tRNA synthetase  56.79 
 
 
895 aa  956  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16360  alanyl-tRNA synthetase  54.79 
 
 
902 aa  930  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2070  alanyl-tRNA synthetase  60.2 
 
 
889 aa  1051  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450401  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12510  alanyl-tRNA synthetase  52.73 
 
 
893 aa  879  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617945  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 
874 aa  654  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15270  alanyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 
888 aa  941  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0205422  normal  0.854238 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2135  alanyl-tRNA synthetase  64 
 
 
889 aa  1052  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00198775  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17690  alanyl-tRNA synthetase  58.44 
 
 
895 aa  1006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.010603  normal  0.139761 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 
875 aa  636  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2047  alanyl-tRNA synthetase  63.43 
 
 
889 aa  1079  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0621427  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1975  alanyl-tRNA synthetase  53.03 
 
 
890 aa  905  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.235306  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 
867 aa  647  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3878  alanyl-tRNA synthetase  52.25 
 
 
885 aa  870  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.785303  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3158  alanyl-tRNA synthetase  56.6 
 
 
897 aa  932  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412954  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0375  alanine--tRNA ligase  51.57 
 
 
894 aa  854  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6094  Alanine--tRNA ligase  63.26 
 
 
890 aa  1032  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0138717  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1689  alanyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 
895 aa  926  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.153123  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 
876 aa  657  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 
882 aa  646  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2378  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
889 aa  1799  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0951  alanyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 
854 aa  642  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.197115  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 
874 aa  640  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 
876 aa  664  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2015  alanyl-tRNA synthetase  54.19 
 
 
898 aa  933  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86953e-08 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0658  alanyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 
889 aa  642  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1818  alanyl-tRNA synthetase  56.36 
 
 
897 aa  885  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17806  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2014  alanyl-tRNA synthetase  56.14 
 
 
896 aa  880  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226707  normal  0.142525 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12720  alanyl-tRNA synthetase  54.72 
 
 
903 aa  897  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 
879 aa  706  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3088  alanyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 
880 aa  638  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 
897 aa  669  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5265  alanyl-tRNA synthetase  53.46 
 
 
890 aa  932  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 
883 aa  672  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0814  alanyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 
893 aa  635  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 
882 aa  642  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0898  alanyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 
881 aa  634  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1052  alanyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 
877 aa  634  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.103695 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00451  alanyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 
886 aa  634  1e-180  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 
876 aa  634  1e-180  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 
874 aa  635  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0934  alanyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 
877 aa  634  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 
876 aa  633  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.08446e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 
880 aa  635  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  41.66 
 
 
876 aa  634  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  4.68314e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  41.66 
 
 
876 aa  633  1e-180  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.53011e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 
865 aa  633  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>