193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0586 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0586  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 		 380 aa  778    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00449508  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  30.16 
 
 		 365 aa  108  2e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  29.84 
 
 		 365 aa  108  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  29.52 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1384  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.65 
 
 		 373 aa  104  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1214  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.32 
 
 		 374 aa  100  3e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  29.55 
 
 		 366 aa  100  4e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2332  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 		 375 aa  99  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0453  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  27.2 
 
 		 374 aa  99.4  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.73 
 
 		 372 aa  99  1e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02449  Glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 		 376 aa  98.6  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.634775  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13013  wlae protein  29.67 
 
 		 321 aa  90.1  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  25.21 
 
 		 379 aa  86.3  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  24.63 
 
 		 375 aa  84  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.88 
 
 		 396 aa  81.6  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1592  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 		 346 aa  82  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512714  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 		 1032 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  21.85 
 
 		 346 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  26.15 
 
 		 420 aa  73.9  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1199  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 		 356 aa  72  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0236987  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3477  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 		 418 aa  71.2  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  30.12 
 
 		 365 aa  71.6  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1699  glycosyl transferase, group 1  28.75 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  24.8 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  22.92 
 
 		 376 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 		 365 aa  69.3  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1772  glycosyl transferase, group 1  27.65 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  22.84 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  23.58 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0896  hypothetical protein  29.03 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.143199  hitchhiker  0.00101666 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4332  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  26.32 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4682  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.27 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4277  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 356 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  21.96 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4472  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 356 aa  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3889  glycosyl transferase, group 1  26.14 
 
 		 356 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3984  glycosyl transferase, group 1  26.14 
 
 		 356 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4093  glycosyl transferase, group 1  26.14 
 
 		 356 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3103  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0778318  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  22.54 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07651  glycosyltransferase  23.62 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.457452  hitchhiker  0.00512375 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0569  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 		 394 aa  59.7  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3171  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2819  glycosyl transferase, group 1  35.06 
 
 		 359 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4099  glycosyl transferase, group 1  25.53 
 
 		 361 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.342089 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  22.34 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0115  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3895  glycosyl transferase, group 1  25.23 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4280  glycosyl transferase group 1  24.7 
 
 		 361 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404551 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4679  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.92 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0664  glycosyl transferase, group 1  22.99 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.591322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1475  glycosyl transferase  32.89 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.16503  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1026  glycosyl transferase, group 1  28.72 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0104  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.29 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00001508 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4335  glycosyl transferase group 1  24.7 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4475  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 		 361 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.921087 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3987  glycosyl transferase, group 1  25.23 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3700  glycosyl transferase, group 1  25.69 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0432  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 		 350 aa  57  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  23.64 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  23.44 
 
 		 374 aa  56.2  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0356  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 		 361 aa  55.8  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2591  glycosyl transferase group 1  22.3 
 
 		 478 aa  55.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.97646  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  26.38 
 
 		 375 aa  55.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  28.37 
 
 		 388 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1431  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.51 
 
 		 498 aa  55.1  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  22.63 
 
 		 350 aa  55.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  23.84 
 
 		 419 aa  55.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  30.63 
 
 		 363 aa  55.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0780  glycosyl transferase, group 1  24.89 
 
 		 369 aa  55.5  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.716964  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  24 
 
 		 376 aa  54.3  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5440  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.77 
 
 		 372 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  23.18 
 
 		 385 aa  53.5  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0291  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 		 360 aa  53.5  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.832234  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3099  glycosyl transferase group 1  29.86 
 
 		 358 aa  53.1  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  26.22 
 
 		 370 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0579  glycosyl transferase group 1  24.58 
 
 		 398 aa  53.1  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  29.7 
 
 		 364 aa  53.1  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0113  glycosyl transferase group 1  22.05 
 
 		 361 aa  52.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.57 
 
 		 415 aa  52.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  25.98 
 
 		 368 aa  52.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 		 369 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  23.98 
 
 		 425 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5157  group 1 glycosyl transferase  23.75 
 
 		 399 aa  52.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  22.87 
 
 		 374 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0193  glycosyl transferase, group 1  24.27 
 
 		 364 aa  51.6  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  27.78 
 
 		 419 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  20.92 
 
 		 390 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  24.24 
 
 		 361 aa  51.6  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1470  mannosyl transferase  31.11 
 
 		 350 aa  51.2  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000263764  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.09 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3693  glycosyltransferase  29.93 
 
 		 350 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3918  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  26.4 
 
 		 363 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0109965 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.09 
 
 		 420 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>