More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0913 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0913  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
341 aa  674    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000688111  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05860  glycosyl transferase  37.8 
 
 
351 aa  275  6e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181902 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0228  glycosyl transferase family protein  35.15 
 
 
333 aa  172  7.999999999999999e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000082788  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1661  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
316 aa  149  5e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4113  glycosyl transferase family 2  25.55 
 
 
343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.902695  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0604  putative glycosyl transferase  24.23 
 
 
340 aa  124  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.781878  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1029  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 
360 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0718  family 2 glycosyl transferase  26.83 
 
 
352 aa  119  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00805458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1349  glycosyltransferase  25.79 
 
 
343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2541  putative glycosyl transferase  23.58 
 
 
341 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3875  glycosyl transferase family 2  23.73 
 
 
331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3564  glycosyl transferase family protein  23.91 
 
 
389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0838  glycosyl transferase family 2  24.21 
 
 
368 aa  96.7  5e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  23.08 
 
 
337 aa  96.3  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1038  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
355 aa  92.8  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.378242  normal  0.03094 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08480  glycosyl transferase  20.95 
 
 
324 aa  92  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.525807 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  22.91 
 
 
822 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  22.87 
 
 
358 aa  89.7  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  0.0000016442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7649  glycosyl transferase family 2  23.38 
 
 
352 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4523  glycosyl transferase family protein  21.9 
 
 
336 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131272  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4957  glycosyl transferase family protein  22.32 
 
 
330 aa  76.6  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.083679 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5927  succinoglycan biosynthesis protein  21.43 
 
 
341 aa  76.3  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  25.76 
 
 
260 aa  75.9  0.0000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  25.26 
 
 
411 aa  72.8  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  26.13 
 
 
395 aa  71.2  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1959  glycosyl transferase family protein  20.98 
 
 
329 aa  70.5  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.465626 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0722  succinoglycan biosynthesis protein ExoA  18.83 
 
 
353 aa  69.7  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  25.22 
 
 
425 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
322 aa  68.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  21.25 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  20.67 
 
 
477 aa  67  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  25.86 
 
 
328 aa  67  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1222  glycosyl transferase family protein  20.35 
 
 
329 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.966529  normal  0.285342 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3835  hypothetical protein  25.48 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  26.17 
 
 
399 aa  66.6  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0704  glycosyl transferase family 2  28.18 
 
 
462 aa  66.2  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.439605  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 
428 aa  65.9  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  24.57 
 
 
528 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  22.07 
 
 
301 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  25.65 
 
 
403 aa  63.9  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2563  glycosyl transferase family protein  19.91 
 
 
329 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4805  glycosyl transferase family protein  21.93 
 
 
339 aa  63.5  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  29.25 
 
 
581 aa  63.9  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  21.26 
 
 
365 aa  63.5  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1291  glycosyl transferase family protein  20.56 
 
 
351 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
429 aa  62.8  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1078  glycosyl transferase family protein  24.19 
 
 
232 aa  62.8  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892634  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1040  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
380 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0221  glycosyl transferase family protein  26.04 
 
 
368 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  23.32 
 
 
321 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0057  putative glycosyltransferase  22.31 
 
 
443 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00631  glycosyl transferase family protein  23.58 
 
 
443 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  21.08 
 
 
418 aa  61.2  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  21.08 
 
 
418 aa  61.2  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0218  glycosyl transferase family protein  36.7 
 
 
379 aa  60.8  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0657  glycosyl transferase family protein  21.64 
 
 
331 aa  60.8  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  22.18 
 
 
333 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  22.86 
 
 
549 aa  60.8  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0338  cell wall biogenesis glycosyltransferase  36.44 
 
 
242 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 
311 aa  60.1  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  24.78 
 
 
1002 aa  59.7  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0060  putative glycosyltransferase  22.67 
 
 
439 aa  59.7  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1244  glycosyl transferase family 2  23.48 
 
 
328 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.161463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1214  glycosyl transferase family 2  23.48 
 
 
328 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  23.58 
 
 
509 aa  59.3  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2238  glycosyl transferase family 2  24.54 
 
 
374 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2026  glycosyl transferase family 2  27.35 
 
 
384 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  21.43 
 
 
442 aa  57.4  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  28.86 
 
 
333 aa  57.8  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
238 aa  57.4  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1457  glycosyl transferase family protein  21.46 
 
 
356 aa  57.8  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.7433 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  21.43 
 
 
442 aa  57.4  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  22.84 
 
 
433 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1578  glycosyl transferase family 2  25.35 
 
 
305 aa  57  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  35 
 
 
247 aa  57  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0354  glycosyl transferase family 2  23.6 
 
 
331 aa  57  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  26.16 
 
 
694 aa  57  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2467  glycosyl transferase family protein  22.28 
 
 
322 aa  57  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  22.84 
 
 
433 aa  56.6  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0402  glycosyl transferase family 2  23.4 
 
 
359 aa  56.6  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.20489 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  22.84 
 
 
433 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2431  glycosyl transferase family 2  24.43 
 
 
397 aa  56.6  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  21.49 
 
 
410 aa  56.2  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  22.84 
 
 
433 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  22.62 
 
 
310 aa  55.8  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2008  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 
379 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1791  b-glycosyltransferase  24.06 
 
 
344 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  23.24 
 
 
335 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  22.49 
 
 
433 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  25.73 
 
 
374 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  24.41 
 
 
1115 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  22.84 
 
 
433 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3376  glycosyl transferase family 2  23.27 
 
 
669 aa  54.7  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1256  glycosyl transferase family protein  22.97 
 
 
240 aa  54.3  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000223583  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02661  glycosyltransferase  29.41 
 
 
248 aa  54.3  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  22.49 
 
 
433 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1196  b-glycosyltransferase  24.23 
 
 
349 aa  53.5  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.959593  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2174  polysaccharide-forming b-glycosyltransferase-like protein  22.26 
 
 
376 aa  53.5  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.486335 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0167  glycosyl transferase family 2  36.75 
 
 
365 aa  53.5  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00277804  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0487  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
284 aa  53.1  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.843285 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>