123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1380 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1380  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
300 aa  592  1e-168  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  98.67 
 
 
300 aa  584  1e-166  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  97.33 
 
 
300 aa  580  1e-164  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0530  conserved hypothetical protein, putative radical SAM domain protein  64.77 
 
 
302 aa  381  1e-105  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  57.14 
 
 
308 aa  317  2e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1012  signal recognition particle protein  50 
 
 
304 aa  300  3e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0316  Radical SAM domain protein  49.33 
 
 
303 aa  285  7e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1472  radical SAM domain-containing protein  49.66 
 
 
300 aa  280  2e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  46.67 
 
 
310 aa  263  2e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  47.42 
 
 
300 aa  257  2e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  43.67 
 
 
303 aa  241  1e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2341  Radical SAM domain protein  32.36 
 
 
330 aa  150  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.109673 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1142  radical SAM domain-containing protein  33.2 
 
 
310 aa  149  8e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2049  radical SAM domain-containing protein  36.84 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11060  Radical SAM domain protein  32.61 
 
 
239 aa  145  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00221485  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  32.57 
 
 
680 aa  144  3e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0336  hypothetical protein  35.1 
 
 
319 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.300886  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0361  radical SAM domain-containing protein  30.74 
 
 
313 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.763423 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0108  radical SAM domain-containing protein  32.02 
 
 
295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0454  radical SAM domain-containing protein  34.35 
 
 
312 aa  136  5e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.383393  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1179  radical SAM domain-containing protein  26.3 
 
 
331 aa  135  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0808  radical SAM domain-containing protein  31.92 
 
 
320 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0458  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 
332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0912  Radical SAM domain protein  31.17 
 
 
314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.883819  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2156  radical SAM family protein  31.36 
 
 
313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04120  Radical SAM domain protein  29.39 
 
 
311 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0688  MoaA/NifB/PqqE family protein  30.36 
 
 
312 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110468  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1848  radical SAM domain-containing protein  31.78 
 
 
310 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0322  radical SAM domain-containing protein  31.38 
 
 
364 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.44863  normal  0.156857 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1223  Radical SAM domain protein  31.1 
 
 
237 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674183 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1559  Radical SAM domain protein  31.78 
 
 
316 aa  122  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0969548  hitchhiker  0.000892375 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2416  Radical SAM domain protein  31.58 
 
 
328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0828  Fe-S oxidoreductase  32.64 
 
 
326 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.389597  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1155  Radical SAM domain protein  27.42 
 
 
319 aa  116  3.9999999999999997e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1638  radical SAM domain-containing protein  30.32 
 
 
313 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00824164  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0538  radical SAM domain-containing protein  31.05 
 
 
329 aa  116  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1962  radical SAM domain-containing protein  28.71 
 
 
323 aa  116  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1460  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.62 
 
 
312 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3462  radical SAM domain-containing protein  33.19 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1586  hypothetical protein  27.62 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1667  Radical SAM domain protein  30.62 
 
 
321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.332302  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0991  Radical SAM domain protein  31.84 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2043  Radical SAM domain protein  32.04 
 
 
267 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1404  radical SAM domain-containing protein  31.86 
 
 
320 aa  112  9e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.937371  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1149  radical SAM family Fe-S protein  30.71 
 
 
326 aa  108  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1531  radical SAM domain-containing protein  28.21 
 
 
308 aa  107  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0562  radical SAM domain-containing protein  29.86 
 
 
311 aa  105  9e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4632  radical SAM family protein  29.76 
 
 
270 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453222  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2377  Radical SAM domain protein  28.63 
 
 
365 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3775  Radical SAM domain protein  28.99 
 
 
266 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3606  radical SAM domain-containing protein  32.08 
 
 
244 aa  99.4  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1760  radical SAM domain-containing protein  29.91 
 
 
323 aa  92.4  8e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.265975  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1039  radical SAM domain-containing protein  27.23 
 
 
231 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0813206  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1292  hypothetical protein  23.36 
 
 
291 aa  60.8  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2206  tRNA-modifying enzyme  21.46 
 
 
358 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.543832 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0729  hypothetical protein  24.89 
 
 
293 aa  53.5  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1529  tRNA-modifying enzyme  21.74 
 
 
341 aa  53.5  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000116298 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  29.01 
 
 
332 aa  53.1  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2402  radical SAM domain-containing protein  25.42 
 
 
297 aa  53.1  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2248  radical SAM domain-containing protein  23.11 
 
 
332 aa  52.4  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000000187282  normal  0.0755271 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  30.61 
 
 
329 aa  51.2  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0576  radical SAM domain-containing protein  26.73 
 
 
457 aa  50.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.11056  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2366  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.4 
 
 
332 aa  50.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08560  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.97 
 
 
366 aa  50.4  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.209245  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2970  Wyosine base formation domain protein  26.8 
 
 
345 aa  49.7  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1555  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.66 
 
 
348 aa  49.7  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0700995  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0911  radical SAM domain-containing protein  26.49 
 
 
497 aa  49.3  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0855  hypothetical protein  26.71 
 
 
278 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  6.94924e-18  unclonable  0.0000000890564 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0084  tRNA-modifying enzyme  20.81 
 
 
351 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0866  tRNA-modifying enzyme  21 
 
 
380 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0326  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.15 
 
 
318 aa  48.9  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0940  Wyosine base formation domain protein  22.51 
 
 
350 aa  48.9  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884068  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0881  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.61 
 
 
329 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.659843  hitchhiker  0.00030609 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2571  radical SAM domain-containing protein  26.01 
 
 
365 aa  48.5  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4633  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.39 
 
 
323 aa  47.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0510268  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34160  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.99 
 
 
339 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.142269  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1440  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.24 
 
 
312 aa  47.4  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1202  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.06 
 
 
335 aa  47  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3299  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.91 
 
 
347 aa  47  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.483331 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4477  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.74 
 
 
350 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4564  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.74 
 
 
350 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4860  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.74 
 
 
350 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.861086  normal  0.112762 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1372  tRNA-modifying enzyme  20.69 
 
 
358 aa  46.6  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.376963  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0169  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.4 
 
 
375 aa  46.6  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280654  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1943  radical SAM family protein  27.63 
 
 
267 aa  46.2  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.545667  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1371  radical SAM domain-containing protein  25.74 
 
 
457 aa  46.2  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145601 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1926  radical SAM domain-containing protein  26.79 
 
 
347 aa  46.2  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.265306  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1320  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25 
 
 
327 aa  45.8  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155131  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1592  radical SAM domain-containing protein  24.5 
 
 
354 aa  45.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2177  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.52 
 
 
339 aa  45.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.697668  normal  0.807394 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0368  radical SAM domain-containing protein  23.31 
 
 
574 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0312  radical SAM domain-containing protein  26.34 
 
 
446 aa  45.8  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.977529  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02954  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.28 
 
 
329 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0183  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 
481 aa  45.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0323  Radical SAM domain protein  29.37 
 
 
265 aa  45.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2095  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  25.95 
 
 
326 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3491  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.21 
 
 
328 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50634  predicted protein  28.86 
 
 
336 aa  44.3  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.612985 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0103  radical SAM domain-containing protein  24.38 
 
 
482 aa  45.1  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0892  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.86 
 
 
326 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>