223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1753 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  100 
 
 
182 aa  383  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  59.78 
 
 
183 aa  244  4e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  53.85 
 
 
184 aa  220  7e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  52.91 
 
 
177 aa  197  9e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.84 
 
 
188 aa  140  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3313  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.44 
 
 
181 aa  139  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6617  deaminase-reductase domain-containing protein  40.96 
 
 
188 aa  135  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3196  bifunctional deaminase-reductase-like  36.78 
 
 
182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.21 
 
 
182 aa  124  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  36.9 
 
 
190 aa  121  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.14 
 
 
192 aa  121  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.63 
 
 
182 aa  120  9e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4632  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.81 
 
 
183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170903  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5813  deaminase-reductase domain-containing protein  35.48 
 
 
188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.85 
 
 
188 aa  119  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.57 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  37.04 
 
 
181 aa  115  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4552  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.02 
 
 
183 aa  115  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  33.51 
 
 
199 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.24 
 
 
188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.26 
 
 
188 aa  114  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1267  deaminase-reductase domain-containing protein  33.53 
 
 
200 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.924885  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.43 
 
 
188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  32.43 
 
 
188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  32.43 
 
 
188 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3200  deaminase-reductase domain-containing protein  34.44 
 
 
176 aa  108  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  34.57 
 
 
178 aa  107  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  35.98 
 
 
181 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0489  deaminase-reductase domain-containing protein  34.25 
 
 
176 aa  107  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.684638  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0711  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.56 
 
 
176 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0366042  normal  0.491773 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.42 
 
 
180 aa  106  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.48 
 
 
187 aa  105  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.51 
 
 
187 aa  104  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  34.05 
 
 
187 aa  102  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4307  bifunctional deaminase-reductase-like  35.9 
 
 
167 aa  101  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.912167  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.54 
 
 
187 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.97 
 
 
187 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291407  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  31.05 
 
 
183 aa  99.8  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  34.55 
 
 
183 aa  98.6  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.67 
 
 
176 aa  98.2  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.02 
 
 
185 aa  97.4  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1605  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.35 
 
 
187 aa  96.7  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.184387  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  34.38 
 
 
178 aa  96.7  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.04 
 
 
189 aa  95.9  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3644  hypothetical protein  33.71 
 
 
190 aa  95.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.05 
 
 
180 aa  95.1  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  30.32 
 
 
180 aa  94.7  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.35 
 
 
186 aa  94.7  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  35.29 
 
 
183 aa  94  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  33.99 
 
 
185 aa  93.2  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1629  deaminase-reductase domain-containing protein  30.29 
 
 
185 aa  92.8  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.399046  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4298  deaminase-reductase domain-containing protein  30.11 
 
 
186 aa  92.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.943714 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
188 aa  92.8  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.67 
 
 
190 aa  90.1  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  30.53 
 
 
181 aa  89  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3987  bifunctional deaminase-reductase-like  31.49 
 
 
177 aa  88.2  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68682  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  26.92 
 
 
185 aa  88.2  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000023862  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.35 
 
 
187 aa  87  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.81 
 
 
185 aa  87  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1705  deaminase-reductase domain-containing protein  28.02 
 
 
194 aa  86.7  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5832  deaminase-reductase domain-containing protein  30.89 
 
 
187 aa  84.3  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4932  deaminase-reductase domain-containing protein  34.69 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.916718  normal  0.605792 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  29.73 
 
 
189 aa  82.8  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.89 
 
 
188 aa  82  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25630  dihydrofolate reductase  27.98 
 
 
196 aa  81.6  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.258312 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  35.62 
 
 
179 aa  81.6  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  32.81 
 
 
181 aa  81.3  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.32 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.41 
 
 
176 aa  79  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.57 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.65 
 
 
181 aa  78.2  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.26 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  31.06 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.37 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  29.7 
 
 
195 aa  75.5  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25 
 
 
194 aa  74.7  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.8 
 
 
193 aa  74.7  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0471  deaminase-reductase domain-containing protein  30.85 
 
 
184 aa  74.3  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0146314  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0204  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.75 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  28.79 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.8 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3071  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.27 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.28 
 
 
221 aa  72  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.79 
 
 
201 aa  71.2  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2397  dihydrofolate reductase  38.74 
 
 
116 aa  71.2  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
204 aa  71.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.74 
 
 
189 aa  70.9  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0541  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.59 
 
 
185 aa  70.9  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.932074 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2749  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.19 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0206598 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.32 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.88 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3672  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  29.73 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.04 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5564  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.84 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  35.14 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  29.79 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.58 
 
 
196 aa  68.6  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0339  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.68 
 
 
188 aa  67.8  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.183511 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  28.34 
 
 
180 aa  67.8  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  26.77 
 
 
195 aa  67.8  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>