176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1656 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  100 
 
 		 458 aa  909    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  40.09 
 
 		 420 aa  311  2e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  40.85 
 
 		 423 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  40.85 
 
 		 423 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  40.94 
 
 		 415 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  40.23 
 
 		 415 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  40 
 
 		 407 aa  302  7.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  39.69 
 
 		 424 aa  301  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  40.94 
 
 		 423 aa  300  4e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  40.18 
 
 		 423 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  40.18 
 
 		 423 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  40.18 
 
 		 423 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  39.96 
 
 		 423 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  40.18 
 
 		 423 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  39.73 
 
 		 424 aa  298  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  41.28 
 
 		 421 aa  297  2e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  38.89 
 
 		 428 aa  294  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  37.66 
 
 		 435 aa  293  4e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  40.96 
 
 		 421 aa  293  6e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  38.96 
 
 		 415 aa  291  1e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  38.04 
 
 		 435 aa  291  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  38.53 
 
 		 436 aa  290  3e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  38.06 
 
 		 431 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  38.89 
 
 		 428 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  38.06 
 
 		 431 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  38.72 
 
 		 389 aa  281  1e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  37.84 
 
 		 431 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  39.25 
 
 		 425 aa  278  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  39.25 
 
 		 437 aa  277  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  38.01 
 
 		 435 aa  278  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  38.41 
 
 		 410 aa  276  6e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  40.19 
 
 		 403 aa  272  1e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  37.67 
 
 		 426 aa  266  7e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  37.53 
 
 		 427 aa  265  2e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  38.36 
 
 		 428 aa  264  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  36.29 
 
 		 440 aa  264  3e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  41.95 
 
 		 413 aa  261  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  38.22 
 
 		 426 aa  261  2e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  41 
 
 		 412 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  38.59 
 
 		 471 aa  258  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0773  fucose permease  35.03 
 
 		 485 aa  256  5e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  37.09 
 
 		 412 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  36.09 
 
 		 436 aa  251  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  38.03 
 
 		 468 aa  248  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  35.45 
 
 		 405 aa  242  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  35.94 
 
 		 428 aa  220  3.9999999999999997e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  34.73 
 
 		 429 aa  216  5.9999999999999996e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  32.62 
 
 		 432 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1395  glucose/galactose transporter  36.38 
 
 		 431 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.774597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2077  glucose/galactose transporter  34.82 
 
 		 426 aa  209  1e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1486  glucose/galactose transporter  34.24 
 
 		 439 aa  208  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  32.64 
 
 		 406 aa  201  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0875  glucose/galactose transporter  33.4 
 
 		 429 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742352  hitchhiker  0.000720356 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  35.29 
 
 		 408 aa  199  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1104  glucose/galactose transporter  32.96 
 
 		 437 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0045785  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  30.43 
 
 		 417 aa  197  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1324  glucose/galactose transporter  30.65 
 
 		 413 aa  197  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  0.568114 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  35.06 
 
 		 408 aa  197  4.0000000000000005e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3606  fucose permease  30.84 
 
 		 425 aa  189  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  29.68 
 
 		 417 aa  186  9e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  30.11 
 
 		 420 aa  186  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4175  glucose/galactose transporter  30.8 
 
 		 446 aa  181  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.46 
 
 		 438 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985389  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2942  L-fucose transporter  30.47 
 
 		 438 aa  181  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4565  major facilitator transporter  32.19 
 
 		 488 aa  180  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178249  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3038  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.65 
 
 		 443 aa  180  4.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1420  major facilitator transporter  31.7 
 
 		 467 aa  180  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  30.13 
 
 		 417 aa  180  5.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  30.26 
 
 		 438 aa  179  7e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1182  glucose/galactose transporter  30.22 
 
 		 432 aa  179  8e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.884299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4488  glucose/galactose transporter  28.44 
 
 		 440 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.797276  normal  0.125839 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  30.99 
 
 		 431 aa  179  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  30.26 
 
 		 438 aa  178  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1315  glucose/galactose transporter  31.44 
 
 		 435 aa  178  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0258067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  30.26 
 
 		 438 aa  178  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  30.26 
 
 		 438 aa  178  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  30.84 
 
 		 417 aa  178  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  30.26 
 
 		 438 aa  178  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3437  L-fucose transporter  27.6 
 
 		 412 aa  176  6e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3207  glucose/galactose transporter  30 
 
 		 432 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1088  glucose/galactose transporter  30 
 
 		 432 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.307429  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1148  glucose/galactose transporter  30 
 
 		 432 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0988235  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0948  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.27 
 
 		 441 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000625246  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_002950  PG2170  sugar transporter  29.66 
 
 		 429 aa  174  3.9999999999999995e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1215  glucose/galactose transporter  31.22 
 
 		 434 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000975208  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3137  L-fucose transporter  29.83 
 
 		 438 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3200  L-fucose transporter  29.83 
 
 		 438 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3185  L-fucose transporter  29.83 
 
 		 438 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3120  L-fucose transporter  29.4 
 
 		 438 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.38497  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1494  L-fucose transporter  30.27 
 
 		 414 aa  173  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.289824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3300  L-fucose transporter  29.83 
 
 		 438 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2702  glucose/galactose transporter  29.61 
 
 		 433 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0791256  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  31.24 
 
 		 419 aa  172  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  28.22 
 
 		 409 aa  172  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3687  glucose/galactose transporter  29.73 
 
 		 413 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.04252 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1080  glucose/galactose transporter  30.37 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000174019  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3110  glucose/galactose transporter  30.07 
 
 		 432 aa  171  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0409592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0466  glucose/galactose transporter  29.32 
 
 		 408 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2931  glucose/galactose transporter  30.07 
 
 		 432 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470631  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3013  glucose/galactose transporter  30.07 
 
 		 432 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0638848  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>