191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10158 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_10158  short-chain dehydrogenase  100 
 
 		 509 aa  1063    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04190  oxidoreductase  47.01 
 
 		 527 aa  462  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1626  oxidoreductase  43.14 
 
 		 539 aa  435  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.498473  normal  0.638708 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1749  oxidoreductase  44.44 
 
 		 535 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0726127  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1678  oxidoreductase  44.2 
 
 		 538 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00133842  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2199  oxidoreductase  44.3 
 
 		 539 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0323008  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45855  predicted protein  41.56 
 
 		 650 aa  343  4e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.306932  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44390  predicted protein  44.39 
 
 		 433 aa  343  5e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0516105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7573  putative short chain dehydrogenase  39.52 
 
 		 454 aa  305  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5303  oxidoreductase  38.43 
 
 		 463 aa  289  7e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 		 485 aa  287  4e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0270  putative short chain dehydrogenase  40.69 
 
 		 503 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0850168  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00730  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  39.64 
 
 		 529 aa  276  4e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0884  putative short chain dehydrogenase  40.54 
 
 		 570 aa  276  8e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4441  putative short chain dehydrogenase  41.61 
 
 		 474 aa  276  8e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2398  oxidoreductase  38.88 
 
 		 437 aa  273  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1517  oxidoreductase  42.03 
 
 		 492 aa  273  7e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1920  putative short chain dehydrogenase  41.87 
 
 		 500 aa  273  7e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4871  putative short chain dehydrogenase  40.74 
 
 		 495 aa  271  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00534901  normal  0.736841 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1886  putative oxidoreductase  37.55 
 
 		 483 aa  271  2e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00334435 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1055  oxidoreductase  40.29 
 
 		 507 aa  271  2e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.730863  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2139  putative short chain dehydrogenase  41.4 
 
 		 483 aa  269  8.999999999999999e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.538588  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4251  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  40.24 
 
 		 447 aa  268  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.044314  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00530  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  40.94 
 
 		 482 aa  261  3e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.191096  normal  0.164201 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.66 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 		 303 aa  57  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38463  predicted protein  33.61 
 
 		 342 aa  55.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622688  normal  0.36197 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.5 
 
 		 239 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2783  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  24.54 
 
 		 245 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88990  predicted protein  32.63 
 
 		 363 aa  55.1  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0137755 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_89854  predicted protein  32.63 
 
 		 363 aa  55.1  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.264825  hitchhiker  0.0060203 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35460  predicted protein  32.74 
 
 		 301 aa  53.5  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1674  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.4 
 
 		 254 aa  53.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3749  short chain dehydrogenase  29 
 
 		 254 aa  53.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.91 
 
 		 257 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2972  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.85 
 
 		 245 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 		 265 aa  51.6  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.76513  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.56 
 
 		 301 aa  52  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5878  gluconate 5-dehydrogenase  24.39 
 
 		 259 aa  50.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.854497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 		 324 aa  50.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.010862 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  34.34 
 
 		 316 aa  50.1  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.83 
 
 		 264 aa  50.1  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.296993 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.35 
 
 		 327 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17961  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  34.31 
 
 		 300 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.140714 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.67 
 
 		 237 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 		 253 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0213931 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15620  oxidoreductase  31.18 
 
 		 320 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000160845  hitchhiker  2.2896399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2742  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 252 aa  49.3  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0442377  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3350  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.37 
 
 		 314 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.244541  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1006  short chain dehydrogenase  28.1 
 
 		 253 aa  48.9  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.85 
 
 		 244 aa  48.5  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31 
 
 		 283 aa  48.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0213  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.93 
 
 		 264 aa  47.8  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 		 253 aa  48.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1782  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.74 
 
 		 244 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1586  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.61 
 
 		 261 aa  47.8  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0571917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3338  tropinone reductase  29.55 
 
 		 267 aa  47.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0617958 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.52 
 
 		 260 aa  47.8  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2801  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.29 
 
 		 248 aa  47.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  30.43 
 
 		 286 aa  47.4  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 		 274 aa  47.4  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.157395 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 		 253 aa  47.4  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0267314 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 		 328 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0947  gluconate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  30 
 
 		 258 aa  47.4  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.815693 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 		 328 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 		 328 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.82 
 
 		 256 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367673  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 		 315 aa  47.4  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.839369  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  30.21 
 
 		 303 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2379  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.93 
 
 		 472 aa  47  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0955086 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.87 
 
 		 255 aa  47  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6414  gluconate 5-dehydrogenase  33.66 
 
 		 254 aa  47  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118789  normal  0.389185 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3207  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36 
 
 		 246 aa  46.2  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.819769  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02177  short chain dehydrogenase/oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15740)  30.83 
 
 		 337 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.186122 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  32.35 
 
 		 257 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3004  short chain dehydrogenase  31.52 
 
 		 268 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 		 249 aa  46.6  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964587  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3825  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 		 261 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1084  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 		 248 aa  46.6  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.68 
 
 		 254 aa  46.6  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19521  normal  0.023029 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0878  short chain dehydrogenase  30.19 
 
 		 261 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.787197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  29.17 
 
 		 302 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4265  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.19 
 
 		 250 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5468  predicted protein  33.71 
 
 		 292 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13582  short chain dehydrogenase  25.44 
 
 		 259 aa  46.6  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.117031 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.42 
 
 		 246 aa  46.2  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4325  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.19 
 
 		 250 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00118279  normal  0.0328571 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.17 
 
 		 303 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1086  short chain dehydrogenase  28.38 
 
 		 232 aa  46.6  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6753  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.52 
 
 		 280 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.87 
 
 		 329 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.18 
 
 		 186 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1751  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.74 
 
 		 257 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.96 
 
 		 246 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1693  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.7 
 
 		 308 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.97 
 
 		 239 aa  46.2  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3915  acetoacetyl-CoA reductase  33.65 
 
 		 252 aa  45.8  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.76 
 
 		 267 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 		 312 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.2 
 
 		 247 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>