More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04670 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1283  excinuclease ABC subunit C  65.48 
 
 		 596 aa  838    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5031  excinuclease ABC, C subunit  51.27 
 
 		 603 aa  648    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1993  excinuclease ABC subunit C  52.63 
 
 		 599 aa  662    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0477  excinuclease ABC, C subunit  52.63 
 
 		 615 aa  638    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.966563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3221  excinuclease ABC, C subunit  53.64 
 
 		 602 aa  665    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.0605848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0726  excinuclease ABC subunit C  69.7 
 
 		 597 aa  899    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0387  excinuclease ABC, C subunit  54.61 
 
 		 598 aa  675    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.971851 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04670  excinuclease ABC, C subunit  100 
 
 		 598 aa  1226    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0024  excinuclease ABC subunit C  51.81 
 
 		 596 aa  629  1e-179  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0175  excinuclease ABC, subunit C  49.92 
 
 		 596 aa  595  1e-169  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0859  hypothetical protein  43.57 
 
 		 598 aa  501  1e-140  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00473 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  42.43 
 
 		 615 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  41.2 
 
 		 631 aa  466  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  39.67 
 
 		 619 aa  463  1e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  40.39 
 
 		 629 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  40.13 
 
 		 616 aa  456  1e-127  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  39.97 
 
 		 627 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  38.83 
 
 		 628 aa  442  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  38.26 
 
 		 628 aa  436  1e-121  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  38.12 
 
 		 607 aa  419  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  38.96 
 
 		 610 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  35.75 
 
 		 604 aa  375  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  35.83 
 
 		 624 aa  379  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  38.7 
 
 		 591 aa  375  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  39.3 
 
 		 596 aa  373  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  38.79 
 
 		 594 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  37.94 
 
 		 594 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  37.94 
 
 		 594 aa  369  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  37.94 
 
 		 594 aa  369  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  37.94 
 
 		 594 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  38.51 
 
 		 594 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  37.77 
 
 		 594 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  38.51 
 
 		 594 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  37.77 
 
 		 594 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  36.85 
 
 		 590 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  35.13 
 
 		 599 aa  366  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  37.77 
 
 		 594 aa  368  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  35.63 
 
 		 610 aa  362  8e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  35.42 
 
 		 613 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  32.85 
 
 		 614 aa  357  2.9999999999999997e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  36.13 
 
 		 594 aa  356  5e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  35.96 
 
 		 593 aa  356  5.999999999999999e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  35.96 
 
 		 593 aa  356  5.999999999999999e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  33.82 
 
 		 641 aa  353  2.9999999999999997e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  35.61 
 
 		 613 aa  353  4e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2306  excinuclease ABC subunit C  34.46 
 
 		 605 aa  352  8e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.391453  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  34.17 
 
 		 611 aa  352  8.999999999999999e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0979  excinuclease ABC, C subunit  33.5 
 
 		 623 aa  349  9e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0363417 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0853  excinuclease ABC, C subunit  33.5 
 
 		 608 aa  349  9e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  33.23 
 
 		 656 aa  349  9e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2059  excinuclease ABC subunit C  32.77 
 
 		 692 aa  348  1e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1280  excinuclease ABC subunit C  34.63 
 
 		 595 aa  348  1e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  35.4 
 
 		 620 aa  347  4e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  33.65 
 
 		 653 aa  346  7e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  35.24 
 
 		 620 aa  345  2e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  33.23 
 
 		 628 aa  342  8e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1110  excinuclease ABC subunit C  34.09 
 
 		 641 aa  342  8e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.537728  normal  0.126972 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  34.93 
 
 		 588 aa  341  2e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15160  Excinuclease ABC subunit C  34.56 
 
 		 650 aa  341  2.9999999999999998e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1222  excinuclease ABC subunit C  34.98 
 
 		 593 aa  340  4e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11085  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  32.04 
 
 		 613 aa  340  5.9999999999999996e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  32.52 
 
 		 611 aa  339  8e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  33.81 
 
 		 622 aa  339  9.999999999999999e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  33.17 
 
 		 607 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1093  excinuclease ABC subunit C  36.3 
 
 		 517 aa  337  2.9999999999999997e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  32.2 
 
 		 666 aa  337  3.9999999999999995e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2038  excinuclease ABC subunit C  33 
 
 		 603 aa  335  1e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331579  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3014  excinuclease ABC, C subunit  33.18 
 
 		 675 aa  335  1e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1161  excinuclease ABC subunit C  36.07 
 
 		 520 aa  334  2e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.342266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2133  excinuclease ABC subunit C  32.66 
 
 		 604 aa  335  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00985622  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  34.3 
 
 		 624 aa  335  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1544  excinuclease ABC, C subunit  31.7 
 
 		 659 aa  334  3e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.519608  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1145  excinuclease ABC, C subunit  35.85 
 
 		 594 aa  334  3e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1633  excinuclease ABC subunit C  32.67 
 
 		 705 aa  334  3e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.860828  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0044  excinuclease ABC, C subunit  31.72 
 
 		 613 aa  334  3e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.101531  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  32.51 
 
 		 598 aa  333  4e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  33.23 
 
 		 627 aa  333  5e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  32.39 
 
 		 638 aa  333  7.000000000000001e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2709  excinuclease ABC subunit C  35.47 
 
 		 519 aa  332  1e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.890107  normal  0.0209335 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  34.49 
 
 		 612 aa  332  1e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  33.18 
 
 		 625 aa  332  1e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  32.31 
 
 		 644 aa  331  2e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1822  excinuclease ABC subunit C  35.96 
 
 		 521 aa  331  3e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.201866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  33.98 
 
 		 617 aa  330  4e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  32.73 
 
 		 685 aa  330  4e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  33.98 
 
 		 617 aa  330  4e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  31.57 
 
 		 613 aa  330  4e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  33.39 
 
 		 607 aa  329  8e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09771  excinuclease ABC subunit C  33.91 
 
 		 652 aa  328  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4536  excinuclease ABC, C subunit  33.5 
 
 		 647 aa  329  1.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00719023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09791  excinuclease ABC subunit C  33.91 
 
 		 652 aa  328  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  31 
 
 		 622 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0936  excinuclease ABC subunit C  35.47 
 
 		 520 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0694942 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  32.85 
 
 		 636 aa  327  3e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1321  excinuclease ABC subunit C  35.35 
 
 		 516 aa  327  5e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0107777  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  32.57 
 
 		 601 aa  326  6e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  34.48 
 
 		 593 aa  326  7e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0909  excinuclease ABC subunit C  33.76 
 
 		 625 aa  326  7e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1252  excinuclease ABC, C subunit  31.5 
 
 		 647 aa  326  7e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1783  excinuclease ABC subunit C  31.94 
 
 		 653 aa  326  7e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>