More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0140 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_0400  cyclic diguanylate phosphodiesterase  77.96 
 
 		 464 aa  672    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0565  EAL domain-containing protein  77.96 
 
 		 515 aa  670    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0140  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 		 424 aa  866    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6290  diguanylate phosphodiesterase  74.52 
 
 		 428 aa  646    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0330  EAL domain-containing protein  76.83 
 
 		 429 aa  664    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4292  diguanylate phosphodiesterase  83.53 
 
 		 425 aa  723    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.843441 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0359  diguanylate phosphodiesterase  72.75 
 
 		 423 aa  637    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.834381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2960  diguanylate phosphodiesterase  74.23 
 
 		 428 aa  648    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.735556  normal  0.776936 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0380  cyclic diguanylate phosphodiesterase  78.2 
 
 		 464 aa  673    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2848  diguanylate phosphodiesterase  74.94 
 
 		 428 aa  655    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.423911  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2324  diguanylate phosphodiesterase  74.23 
 
 		 428 aa  648    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00890506  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0415  diguanylate phosphodiesterase  83.65 
 
 		 422 aa  721    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.404943 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2985  diguanylate phosphodiesterase  74.94 
 
 		 428 aa  655    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2938  diguanylate phosphodiesterase  74.23 
 
 		 428 aa  648    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2455  diguanylate phosphodiesterase  50.63 
 
 		 424 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000463502 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2585  diguanylate phosphodiesterase  50.63 
 
 		 424 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0503461  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0758  diguanylate phosphodiesterase  50.38 
 
 		 424 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121187  normal  0.125569 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2561  diguanylate phosphodiesterase  50.13 
 
 		 424 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0195477 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5868  diguanylate phosphodiesterase  49.62 
 
 		 424 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0145256  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1925  diguanylate phosphodiesterase  49.87 
 
 		 424 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2537  diguanylate phosphodiesterase  49.87 
 
 		 424 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119746  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0751  EAL domain-containing protein  49.37 
 
 		 424 aa  364  1e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2261  EAL domain-containing protein  48.86 
 
 		 424 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.807134  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0939  EAL domain-containing protein  48.86 
 
 		 422 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.876817  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2138  cyclic diguanylate phosphodiesterase  48.86 
 
 		 422 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0558  cyclic diguanylate phosphodiesterase  48.86 
 
 		 422 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1094  EAL domain-containing protein  48.86 
 
 		 424 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464012  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0943  cyclic diguanylate phosphodiesterase  48.86 
 
 		 422 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0778  diguanylate phosphodiesterase  48.22 
 
 		 436 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.263766  normal  0.696218 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3188  diguanylate phosphodiesterase  48.48 
 
 		 436 aa  355  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.117578 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0546  diguanylate phosphodiesterase  47.72 
 
 		 424 aa  354  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49841  normal  0.628054 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2288  diguanylate phosphodiesterase  45.55 
 
 		 419 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000327147  normal  0.604082 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2792  diguanylate phosphodiesterase  41.82 
 
 		 427 aa  309  6.999999999999999e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2214  diguanylate phosphodiesterase  41.87 
 
 		 428 aa  300  3e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.706339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0993  diguanylate phosphodiesterase  39.57 
 
 		 441 aa  280  3e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0192  diguanylate phosphodiesterase  41.08 
 
 		 429 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0109  hypothetical protein  77.91 
 
 		 171 aa  269  8e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00195405  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2261  hypothetical protein  77.91 
 
 		 171 aa  269  8e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3070  hypothetical protein  77.91 
 
 		 171 aa  269  8e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2024  hypothetical protein  77.91 
 
 		 171 aa  269  8e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4326  diguanylate phosphodiesterase  39.76 
 
 		 426 aa  252  7e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0277437  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2662  EAL domain-containing protein  32.64 
 
 		 428 aa  249  5e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31527  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3700  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.71 
 
 		 780 aa  249  9e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.973532 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1744  diguanylate phosphodiesterase  37.18 
 
 		 424 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.943154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1523  EAL domain-containing protein  36.75 
 
 		 427 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1389  EAL domain-containing protein  36.68 
 
 		 403 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1101  diguanylate phosphodiesterase  40.41 
 
 		 426 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1394  EAL domain-containing protein  36.68 
 
 		 403 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1176  diguanylate phosphodiesterase  36.89 
 
 		 411 aa  238  2e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1618  diguanylate phosphodiesterase  38.3 
 
 		 446 aa  237  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.991621  normal  0.575282 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0737  diguanylate phosphodiesterase  39.51 
 
 		 426 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1218  diguanylate phosphodiesterase  39.51 
 
 		 426 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.048247  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2834  diguanylate phosphodiesterase  37.47 
 
 		 440 aa  236  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.37 
 
 		 790 aa  236  7e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0244946 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3887  diguanylate phosphodiesterase  37.14 
 
 		 421 aa  233  5e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0192627  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1101  diguanylate phosphodiesterase  39.39 
 
 		 426 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1191  diguanylate phosphodiesterase  39.01 
 
 		 447 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0738047  normal  0.284826 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2085  diguanylate phosphodiesterase  39.44 
 
 		 423 aa  232  9e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2848  EAL domain-containing protein  37 
 
 		 427 aa  230  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197533  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5831  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.2 
 
 		 777 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.36212 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1766  EAL domain-containing protein  43.09 
 
 		 474 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.561967  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1192  EAL domain-containing protein  43.09 
 
 		 474 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.252573  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0770  diguanylate phosphodiesterase  32.47 
 
 		 414 aa  191  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.294803  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0677  EAL domain-containing protein  43.09 
 
 		 482 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0823154  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1033  diguanylate phosphodiesterase  30.71 
 
 		 413 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1754  diguanylate phosphodiesterase  32.67 
 
 		 431 aa  150  4e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2032  EAL domain protein  29.92 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2479  diguanylate phosphodiesterase  28.95 
 
 		 416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0612  diguanylate phosphodiesterase  37.36 
 
 		 197 aa  130  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.996724 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0662  putative signaling protein  32.93 
 
 		 266 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.260634  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0555  hypothetical protein  32.56 
 
 		 584 aa  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000218  diguanylate phosphodiesterase  35.92 
 
 		 272 aa  125  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3936  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.5 
 
 		 585 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.573208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3972  diguanylate phosphodiesterase  28.86 
 
 		 387 aa  125  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3810  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.5 
 
 		 585 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000137032  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0555  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.84 
 
 		 583 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3475  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.17 
 
 		 583 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3527  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.25 
 
 		 581 aa  125  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0514  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.5 
 
 		 585 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136052  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3319  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.48 
 
 		 584 aa  124  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.777593  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3754  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.14 
 
 		 585 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000868734  normal  0.0557959 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3003  diguanylate phosphodiesterase  29.7 
 
 		 387 aa  123  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176635 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0554  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.78 
 
 		 584 aa  123  7e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4345  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.3 
 
 		 572 aa  122  8e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3153  putative diguanylate phosphodiesterase  33.84 
 
 		 584 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.920716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2411  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.6 
 
 		 632 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893826 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1867  hypothetical protein  37.45 
 
 		 582 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145916  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21870  EAL domain/GGDEF domain-containing protein  37.45 
 
 		 601 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.220571  hitchhiker  0.00056029 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3724  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.19 
 
 		 580 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0883602  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000198  EAL domain protein  32.64 
 
 		 262 aa  120  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000396049  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0220  hypothetical protein  30.4 
 
 		 362 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05954  hypothetical protein  32.79 
 
 		 272 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0470  hypothetical protein  34.94 
 
 		 288 aa  118  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129901  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0220  hypothetical protein  30.4 
 
 		 360 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.44 
 
 		 766 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1820  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.6 
 
 		 599 aa  117  5e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.322861  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1320  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.6 
 
 		 584 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00692574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0436  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.42 
 
 		 590 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3219  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.04 
 
 		 554 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.267477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0467  EAL domain protein  33.63 
 
 		 351 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0116221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>