More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_6117 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_6117  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 248 aa  493  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.213518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2218  GntR family transcriptional regulator  75.86 
 
 		 268 aa  346  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6082  transcriptional regulator GntR family  47.35 
 
 		 230 aa  208  8e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6551  transcriptional regulator, GntR family  51.96 
 
 		 230 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158828  normal  0.969199 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6257  GntR family transcriptional regulator  48.4 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648776  normal  0.0618122 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5580  transcriptional regulator, GntR family  49.32 
 
 		 231 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6111  GntR family transcriptional regulator  54.21 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2481  GntR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 219 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2254  GntR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 254 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.576687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3443  GntR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 266 aa  166  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2405  transcriptional regulator GntR  41.74 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.146644  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2671  transcriptional regulator, GntR family  40.85 
 
 		 250 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0107111  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2081  GntR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3649  GntR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 250 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.078478  normal  0.168934 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2259  GntR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 250 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3236  GntR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 250 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  38.79 
 
 		 239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0982  GntR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84517 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0450  GntR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256428  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0383  GntR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000295575  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5802  GntR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154475  normal  0.167902 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 227 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1967  GntR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 239 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0532674  normal  0.202649 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1214  GntR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 220 aa  121  8e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000309103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  37.38 
 
 		 231 aa  121  9e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  34.13 
 
 		 231 aa  118  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 225 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  32.85 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  35.56 
 
 		 237 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 235 aa  113  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 235 aa  113  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3247  GntR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 230 aa  113  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 231 aa  112  6e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2967  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 229 aa  112  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 223 aa  109  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 233 aa  109  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 230 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  30.59 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1060  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 235 aa  106  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 229 aa  105  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 229 aa  105  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  30.85 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  36.04 
 
 		 217 aa  102  8e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  31.89 
 
 		 227 aa  102  8e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 222 aa  99.8  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 249 aa  99.4  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 246 aa  97.1  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 230 aa  96.3  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 290 aa  96.3  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3403  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 237 aa  95.5  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3577  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 236 aa  95.5  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000218035  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 219 aa  94.7  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3148  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 250 aa  93.2  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.275687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  36.23 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  29.85 
 
 		 226 aa  93.2  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  28.86 
 
 		 221 aa  92.8  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 230 aa  91.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  32.65 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 251 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 260 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 227 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  31.34 
 
 		 212 aa  90.1  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4691  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 233 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517604  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  34.9 
 
 		 232 aa  89.4  5e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3622  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 239 aa  88.6  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 229 aa  88.6  9e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6033  transcriptional regulator, GntR family  31.94 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  29.84 
 
 		 231 aa  88.6  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 222 aa  87.4  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2268  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 214 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 234 aa  87  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7518  transcriptional regulator  34.17 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  31.98 
 
 		 211 aa  85.9  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3619  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 239 aa  85.9  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00335274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 211 aa  86.3  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 212 aa  85.9  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4357  GntR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 240 aa  85.5  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.899298  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 227 aa  85.5  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 223 aa  85.1  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 275 aa  85.1  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2304  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 224 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39728 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1127  GntR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>