More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0728 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 321 aa  628  1e-179  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1239  protoheme IX farnesyltransferase  68.2 
 
 		 316 aa  376  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.377478 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  61.09 
 
 		 315 aa  360  1e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  61.72 
 
 		 315 aa  360  2e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  61.72 
 
 		 312 aa  359  3e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  57.46 
 
 		 316 aa  354  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  57.14 
 
 		 316 aa  352  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  59.21 
 
 		 316 aa  352  5.9999999999999994e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  61.13 
 
 		 318 aa  350  1e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  62.13 
 
 		 312 aa  348  9e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  64.81 
 
 		 315 aa  347  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  62.21 
 
 		 313 aa  346  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  63.79 
 
 		 310 aa  344  1e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  64.13 
 
 		 312 aa  343  2e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  64.13 
 
 		 353 aa  343  2e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  61.67 
 
 		 313 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  64.13 
 
 		 328 aa  343  2e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  64.13 
 
 		 328 aa  343  2e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  57.39 
 
 		 325 aa  341  8e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4789  protoheme IX farnesyltransferase  64.13 
 
 		 313 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0031  protoheme IX farnesyltransferase  60.62 
 
 		 316 aa  323  3e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823652  normal  0.697538 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3457  protoheme IX farnesyltransferase  63.43 
 
 		 317 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3585  protoheme IX farnesyltransferase  63.06 
 
 		 317 aa  320  3e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3261  protoheme IX farnesyltransferase  63.06 
 
 		 317 aa  319  5e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  57.99 
 
 		 309 aa  317  2e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0901  protoheme IX farnesyltransferase  61.82 
 
 		 312 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110093  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2347  protoheme IX farnesyltransferase  63 
 
 		 317 aa  316  4e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0262  protoheme IX farnesyltransferase  64.1 
 
 		 317 aa  315  6e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284022  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  58.25 
 
 		 305 aa  310  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0475  protoheme IX farnesyltransferase  56.4 
 
 		 310 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1827  protoheme IX farnesyltransferase  56.4 
 
 		 310 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0766556  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0405  protoheme IX farnesyltransferase  56.54 
 
 		 311 aa  301  1e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.789326  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4504  protoheme IX farnesyltransferase  52.33 
 
 		 345 aa  297  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  52.45 
 
 		 315 aa  295  6e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0615  protoheme IX farnesyltransferase  56.38 
 
 		 310 aa  292  5e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2232  protoheme IX farnesyltransferase  54.72 
 
 		 330 aa  290  2e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0835279  hitchhiker  0.00671366 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  55.4 
 
 		 308 aa  289  5.0000000000000004e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  56.76 
 
 		 317 aa  287  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  51.8 
 
 		 295 aa  282  6.000000000000001e-75  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0915  protoheme IX farnesyltransferase  53.31 
 
 		 304 aa  281  8.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.010873  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1141  protoheme IX farnesyltransferase  56.13 
 
 		 328 aa  279  6e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2335  protoheme IX farnesyltransferase  52.74 
 
 		 313 aa  277  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.377934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3877  protoheme IX farnesyltransferase  51.19 
 
 		 302 aa  275  6e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  49.3 
 
 		 302 aa  271  1e-71  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  46.59 
 
 		 295 aa  261  2e-68  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1004  protoheme IX farnesyltransferase  46.1 
 
 		 295 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.458622  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  48.23 
 
 		 302 aa  221  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  44.41 
 
 		 323 aa  215  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  42.33 
 
 		 302 aa  215  8e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  44.79 
 
 		 323 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  44.79 
 
 		 323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  41.47 
 
 		 324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  43.9 
 
 		 328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  42.35 
 
 		 301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  43.75 
 
 		 622 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  40.67 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  44.06 
 
 		 535 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  41.05 
 
 		 299 aa  209  6e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  42.31 
 
 		 534 aa  206  5e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4162  protoheme IX farnesyltransferase  42.02 
 
 		 301 aa  206  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  43.45 
 
 		 309 aa  205  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  47.28 
 
 		 443 aa  203  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  41.96 
 
 		 317 aa  202  6e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  39.81 
 
 		 328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  42.96 
 
 		 300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  42.96 
 
 		 300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  42.96 
 
 		 300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  42.96 
 
 		 300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  42.96 
 
 		 300 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  42.96 
 
 		 300 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  42.96 
 
 		 300 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  42.96 
 
 		 300 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  44.37 
 
 		 296 aa  199  6e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  41.47 
 
 		 300 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  41.96 
 
 		 301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  42.36 
 
 		 318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0188  protoheme IX farnesyltransferase  41.98 
 
 		 304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  41.47 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  41.47 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4238  protoheme IX farnesyltransferase  41.05 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  41.47 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  41.47 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01380  protoheme IX farnesyltransferase  42.32 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  41.47 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  42.36 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  39.19 
 
 		 303 aa  195  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  43.4 
 
 		 312 aa  194  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2402  protoheme IX farnesyltransferase  42.21 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04028  protoheme IX farnesyltransferase  42.12 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  40.62 
 
 		 302 aa  193  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  40.6 
 
 		 306 aa  193  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0319  protoheme IX farnesyltransferase  41.58 
 
 		 297 aa  192  5e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2850  protoheme IX farnesyltransferase  41.81 
 
 		 306 aa  192  7e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3527  protoheme IX farnesyltransferase  41.81 
 
 		 306 aa  192  7e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.153236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0713  protoheme IX farnesyltransferase  41.84 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  40.56 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0228  protoheme IX farnesyltransferase  41.26 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0630  protoheme IX farnesyltransferase  41.84 
 
 		 301 aa  191  2e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.781454  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  39.02 
 
 		 307 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0466  protoheme IX farnesyltransferase  41.46 
 
 		 300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.622131  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>