253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0572 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0572  3'-5' exonuclease  100 
 
 		 204 aa  417  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0155  3'-5' exonuclease  77.83 
 
 		 204 aa  327  5.0000000000000004e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.299764 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0419  3'-5' exonuclease  73.04 
 
 		 204 aa  316  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0047  3'-5' exonuclease  72.55 
 
 		 204 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0659  3'-5' exonuclease  72.06 
 
 		 204 aa  310  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.265112 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0174  3'-5' exonuclease  71.08 
 
 		 204 aa  307  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2425  3'-5' exonuclease  69.65 
 
 		 209 aa  305  3e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0196  3'-5' exonuclease  68.97 
 
 		 203 aa  304  6e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950897 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0179  3'-5' exonuclease  68.45 
 
 		 206 aa  300  1e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00803697  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2497  3'-5' exonuclease  69.8 
 
 		 209 aa  300  1e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.308179 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3589  3'-5' exonuclease  70.44 
 
 		 203 aa  297  7e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0228  3'-5' exonuclease  68.97 
 
 		 203 aa  297  8e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5125  3'-5' exonuclease  69.65 
 
 		 207 aa  296  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0268839  normal  0.933758 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2720  3'-5' exonuclease  68.81 
 
 		 209 aa  295  3e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.0609935 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5275  3'-5' exonuclease  67.65 
 
 		 204 aa  291  5e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28449  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0125  putative 3'-5' exonuclease family protein  68.63 
 
 		 204 aa  290  9e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00602859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0171  3'-5' exonuclease  66.99 
 
 		 206 aa  290  1e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0027  3'-5' exonuclease  67.16 
 
 		 204 aa  290  1e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.189554  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5922  3'-5' exonuclease  68.14 
 
 		 204 aa  286  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0068  3'-5' exonuclease  68.45 
 
 		 206 aa  285  4e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2775  3'-5' exonuclease  68.14 
 
 		 204 aa  285  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0109  3'-5' exonuclease  66.18 
 
 		 204 aa  283  8e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.378562  normal  0.35649 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2813  3'-5' exonuclease  67.65 
 
 		 204 aa  281  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1152  ribonuclease D  67.65 
 
 		 204 aa  280  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2343  3'-5' exonuclease  65.85 
 
 		 205 aa  276  2e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2609  3'-5' exonuclease  66.18 
 
 		 204 aa  276  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0333  3'-5' exonuclease  65.35 
 
 		 210 aa  273  2.0000000000000002e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273167  normal  0.287022 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3464  3'-5' exonuclease  64.22 
 
 		 208 aa  272  3e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0120  ribonuclease D  64.22 
 
 		 208 aa  271  4.0000000000000004e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.818192  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0117  3'-5' exonuclease family protein  62.44 
 
 		 205 aa  269  2e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0135  3'-5' exonuclease  62.93 
 
 		 205 aa  268  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4954  3'-5' exonuclease  64.71 
 
 		 205 aa  267  8e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.332898  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0120  3'-5' exonuclease family protein  61.95 
 
 		 205 aa  266  1e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3251  3'-5' exonuclease  64.22 
 
 		 205 aa  265  2.9999999999999995e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0015  3'-5' exonuclease  64.18 
 
 		 206 aa  265  5e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2903  3'-5' exonuclease  62.75 
 
 		 205 aa  258  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.865613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1669  3'-5' exonuclease  62.14 
 
 		 218 aa  258  4e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.335885  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3984  3'-5' exonuclease  63.9 
 
 		 205 aa  258  4e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4028  3'-5' exonuclease  62.25 
 
 		 208 aa  256  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0816  3'-5' exonuclease  59.41 
 
 		 216 aa  256  2e-67  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00362431  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1011  3'-5' exonuclease family protein  59.31 
 
 		 204 aa  254  4e-67  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0881939  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1219  3'-5' exonuclease domain-containing protein  61.58 
 
 		 206 aa  254  6e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485799  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4358  3'-5' exonuclease  61.27 
 
 		 208 aa  252  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583903 
 
 
-
 
NC_002978  WD0878  3'-5' exonuclease  60 
 
 		 206 aa  251  6e-66  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0529  3'-5' exonuclease family protein  57.5 
 
 		 206 aa  246  1e-64  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0327  3'-5' exonuclease  52.63 
 
 		 213 aa  206  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3799  3'-5' exonuclease  54.84 
 
 		 209 aa  205  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1914  3'-5' exonuclease  55.32 
 
 		 209 aa  203  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1621  3'-5' exonuclease  52.04 
 
 		 207 aa  200  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.169628  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2509  3'-5' exonuclease  53.72 
 
 		 209 aa  198  5e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1118  3'-5' exonuclease  52.69 
 
 		 210 aa  194  7e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1147  3'-5' exonuclease  52.69 
 
 		 210 aa  194  7e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2246  3'-5' exonuclease  55.68 
 
 		 217 aa  192  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.520239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0678  3'-5' exonuclease  53.76 
 
 		 211 aa  191  7e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1922  3'-5' exonuclease  52.43 
 
 		 214 aa  187  7e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0431536  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0407  3'-5' exonuclease  53.76 
 
 		 214 aa  186  1e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.23143  normal  0.475558 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17761  putative ribonuclease D  49.19 
 
 		 211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1676  putative ribonuclease D  49.19 
 
 		 211 aa  180  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17711  putative ribonuclease D  44.17 
 
 		 213 aa  180  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.606229  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17921  putative ribonuclease D  48.11 
 
 		 211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17051  putative ribonuclease D  47.31 
 
 		 214 aa  178  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20321  putative ribonuclease D  46.24 
 
 		 214 aa  171  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1157  putative ribonuclease D  45.7 
 
 		 214 aa  170  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22631  putative ribonuclease D  51.3 
 
 		 212 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.528712 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  38.96 
 
 		 393 aa  94.7  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2546  ribonuclease D  36.36 
 
 		 389 aa  94.4  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  37.01 
 
 		 392 aa  87  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0326  ribonuclease D  36.55 
 
 		 392 aa  85.5  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0491656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1102  ribonuclease D  31.21 
 
 		 381 aa  85.5  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.447104 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  32.14 
 
 		 388 aa  83.2  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0750  ribonuclease D  31.21 
 
 		 385 aa  82.8  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  31.21 
 
 		 385 aa  82.8  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2542  ribonuclease D  30.06 
 
 		 385 aa  82.4  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1474  ribonuclease D  32.91 
 
 		 385 aa  81.6  0.000000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.366853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1887  putative ribonuclease D  33.54 
 
 		 385 aa  81.6  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0137487  normal  0.150443 
 
 
-
 
NC_002978  WD0186  ribonuclease D, putative  31.01 
 
 		 392 aa  81.6  0.000000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0506  ribonuclease D  33.55 
 
 		 395 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4526  ribonuclease D  35.25 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780043  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1249  ribonuclease D  29.48 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606694  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1582  3'-5' exonuclease  35 
 
 		 385 aa  80.1  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1838  ribonuclease D  35.71 
 
 		 386 aa  80.5  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.529278  normal  0.0732716 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2949  ribonuclease D  30.3 
 
 		 392 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1164  3'-5' exonuclease  36.25 
 
 		 550 aa  78.2  0.00000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0638405  normal  0.521406 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0323  RNase D  31.93 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.85777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2494  ribonuclease D  29.48 
 
 		 382 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1337  ribonuclease D  29.76 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118451  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2334  ribonuclease D  29.05 
 
 		 384 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1588  ribonuclease D  27.62 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5131  ribonuclease D  33.09 
 
 		 389 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3141  ribonuclease D  32.61 
 
 		 384 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.579669 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0208  ribonuclease D  31.82 
 
 		 405 aa  75.5  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.790947 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3191  3'-5' exonuclease  33.74 
 
 		 382 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2915  ribonuclease D  32.61 
 
 		 384 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.71174 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0971  DNA-directed DNA polymerase  30.77 
 
 		 583 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2073  ribonuclease D  33.33 
 
 		 386 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3039  ribonuclease D  32.61 
 
 		 384 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2064  ribonuclease D  33.94 
 
 		 375 aa  75.1  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0869  ribonuclease D  31.17 
 
 		 391 aa  74.7  0.0000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0942058  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1839  ribonuclease D  34.34 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0204908  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1892  ribonuclease D  34.34 
 
 		 375 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>