More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_20310 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_20310  metalloendopeptidase-like membrane protein  100 
 
 		 446 aa  907    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1037  Peptidase M23  32.46 
 
 		 477 aa  205  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501943  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25170  metalloendopeptidase-like membrane protein  31.03 
 
 		 462 aa  189  5.999999999999999e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2398  Peptidase M23  29.93 
 
 		 474 aa  177  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0487248 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1246  Peptidase M23  33.25 
 
 		 446 aa  176  6e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2663  peptidase M23B  31.74 
 
 		 464 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0453096  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1270  peptidase M23B  30.63 
 
 		 419 aa  145  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0866  Peptidase M23  47.15 
 
 		 489 aa  140  6e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.329722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19390  metalloendopeptidase-like membrane protein  51.54 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2767  Peptidase M23  32.99 
 
 		 451 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.327973 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  28.32 
 
 		 379 aa  124  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  33.48 
 
 		 375 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  22.7 
 
 		 441 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  46.83 
 
 		 411 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  38.8 
 
 		 376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  27.23 
 
 		 374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  32.5 
 
 		 374 aa  114  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  22.54 
 
 		 431 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  35.75 
 
 		 375 aa  113  8.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  43.2 
 
 		 314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  32.62 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  37.5 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  34.6 
 
 		 404 aa  111  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  45.24 
 
 		 404 aa  110  6e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  34.47 
 
 		 400 aa  110  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  29.83 
 
 		 377 aa  110  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  48.39 
 
 		 569 aa  109  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3187  Peptidase M23  25.71 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  42.86 
 
 		 524 aa  108  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  43.44 
 
 		 412 aa  108  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  30.8 
 
 		 377 aa  107  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  27.14 
 
 		 402 aa  106  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  30.65 
 
 		 373 aa  105  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  43.9 
 
 		 681 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  41.91 
 
 		 741 aa  104  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  42.11 
 
 		 430 aa  103  5e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  41.09 
 
 		 417 aa  103  7e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  45.31 
 
 		 265 aa  102  9e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  43.9 
 
 		 674 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  43.09 
 
 		 676 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  41.27 
 
 		 305 aa  102  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  41.6 
 
 		 392 aa  101  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  44.72 
 
 		 697 aa  101  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  44.72 
 
 		 697 aa  101  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  43.9 
 
 		 699 aa  100  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  44.17 
 
 		 402 aa  100  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  42.02 
 
 		 472 aa  100  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  28.77 
 
 		 375 aa  100  7e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  40.91 
 
 		 475 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  45.83 
 
 		 437 aa  99.8  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  40.98 
 
 		 286 aa  99.8  9e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1905  peptidase M23B  45.76 
 
 		 683 aa  99.8  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0809274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  46.88 
 
 		 288 aa  98.6  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  44.88 
 
 		 453 aa  99  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  40.32 
 
 		 665 aa  99  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  42.28 
 
 		 527 aa  99  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  40.8 
 
 		 392 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  42.86 
 
 		 325 aa  97.8  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1868  Peptidase M23  39.84 
 
 		 398 aa  97.8  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0529967  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  40.83 
 
 		 460 aa  97.4  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0504  peptidase M23B  39.17 
 
 		 419 aa  97.4  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  42.02 
 
 		 471 aa  97.1  6e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  33.17 
 
 		 274 aa  97.1  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4531  Peptidase M23  42.98 
 
 		 137 aa  97.1  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.45926 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0824  Peptidase M23  45.97 
 
 		 378 aa  97.1  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  40.8 
 
 		 391 aa  96.3  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  42.02 
 
 		 471 aa  96.7  9e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  44.44 
 
 		 503 aa  95.5  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  43.33 
 
 		 454 aa  95.9  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0247  M24/M37 family peptidase  41.67 
 
 		 449 aa  95.9  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  39.84 
 
 		 372 aa  96.3  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1417  peptidase M23B  44.85 
 
 		 523 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  40.34 
 
 		 695 aa  95.1  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  40.44 
 
 		 472 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  39.53 
 
 		 379 aa  95.5  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0558  peptidase M23B  49.17 
 
 		 445 aa  95.5  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.926866  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1145  Peptidase M23  41.79 
 
 		 390 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  41.18 
 
 		 503 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  43.15 
 
 		 490 aa  94.4  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  41.94 
 
 		 517 aa  94  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  40.44 
 
 		 473 aa  94  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  41.35 
 
 		 440 aa  94  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  27.61 
 
 		 379 aa  94  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  42.74 
 
 		 533 aa  94  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2498  peptidase M23B  44 
 
 		 646 aa  94  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.13296 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  39.06 
 
 		 513 aa  94  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  41.35 
 
 		 440 aa  94  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  40.44 
 
 		 475 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  40.44 
 
 		 474 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  28.38 
 
 		 387 aa  93.6  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0565  Peptidase M23  46.61 
 
 		 475 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  40.44 
 
 		 473 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2761  peptidase M23  40.97 
 
 		 529 aa  93.2  7e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.758494  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  41.13 
 
 		 415 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  42.86 
 
 		 490 aa  93.6  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  37.5 
 
 		 271 aa  93.2  8e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1891  peptidase M23B  39.37 
 
 		 314 aa  93.2  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  41.35 
 
 		 437 aa  93.2  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0074  peptidase M23B  41.32 
 
 		 513 aa  93.2  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  41.67 
 
 		 455 aa  93.2  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>