More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1023 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1023  outer membrane protein (porin)  100 
 
 
361 aa  712    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615146  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  94.2 
 
 
362 aa  650    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  94.2 
 
 
362 aa  650    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  94.2 
 
 
362 aa  650    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4126  porin  85.03 
 
 
372 aa  567  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.464673  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4590  porin  85.29 
 
 
372 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0340402  hitchhiker  0.00422531 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3115  outer membrane protein (porin)  81.38 
 
 
374 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  76.72 
 
 
374 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  76.72 
 
 
374 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  76.72 
 
 
374 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  79.08 
 
 
363 aa  534  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1353  outer membrane porin OpcP  76.32 
 
 
376 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.666158  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2476  outer membrane porin precursor  76.46 
 
 
374 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  76.32 
 
 
376 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0954  putative outer membrane porin  76.32 
 
 
376 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  76.32 
 
 
376 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  67.02 
 
 
377 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  67.11 
 
 
377 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4101  porin  58.29 
 
 
372 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  51.79 
 
 
387 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  52.82 
 
 
383 aa  345  5e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  52.56 
 
 
383 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  52.47 
 
 
379 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  52.47 
 
 
379 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  52.47 
 
 
379 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  52.47 
 
 
379 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  52.21 
 
 
379 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  52.32 
 
 
381 aa  336  5e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  52.43 
 
 
381 aa  335  9e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  51.95 
 
 
379 aa  333  4e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  52.52 
 
 
374 aa  332  9e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  52.82 
 
 
380 aa  325  5e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  50.77 
 
 
379 aa  324  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  52.56 
 
 
380 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  50.26 
 
 
380 aa  322  8e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  52.32 
 
 
381 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  50.52 
 
 
384 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  51.29 
 
 
383 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  52.45 
 
 
384 aa  320  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  51.03 
 
 
381 aa  316  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  50.26 
 
 
383 aa  317  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  49.63 
 
 
391 aa  315  6e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  49.1 
 
 
383 aa  315  7e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  49.1 
 
 
380 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  48.85 
 
 
380 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  49.87 
 
 
384 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  49.87 
 
 
384 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  49.87 
 
 
384 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  49.87 
 
 
384 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  49.87 
 
 
384 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  49.87 
 
 
384 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  49.87 
 
 
384 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  49.61 
 
 
414 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  49.87 
 
 
380 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  49.61 
 
 
380 aa  309  4e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  53.1 
 
 
383 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  48.84 
 
 
380 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  47.53 
 
 
381 aa  305  7e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  49.5 
 
 
390 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  49.22 
 
 
379 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  48.84 
 
 
379 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  48.08 
 
 
384 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  48.7 
 
 
383 aa  301  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  47.59 
 
 
384 aa  298  7e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  50.41 
 
 
409 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  46.84 
 
 
384 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  47.57 
 
 
384 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  47.57 
 
 
384 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  46.84 
 
 
384 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  46.84 
 
 
384 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  47.21 
 
 
384 aa  295  9e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  47.31 
 
 
384 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  47.31 
 
 
384 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  47.31 
 
 
384 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  47.31 
 
 
384 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  47.74 
 
 
409 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  47.74 
 
 
409 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  47.49 
 
 
391 aa  288  9e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  46.19 
 
 
384 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  45.64 
 
 
383 aa  286  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  49.73 
 
 
385 aa  285  7e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  46.82 
 
 
386 aa  285  7e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  45.94 
 
 
384 aa  285  8e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  46.58 
 
 
376 aa  285  8e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  46.3 
 
 
411 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  47.77 
 
 
375 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  45.05 
 
 
383 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  44.97 
 
 
394 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  46.92 
 
 
386 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  48.03 
 
 
375 aa  281  9e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  43.97 
 
 
394 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  44.33 
 
 
396 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  46.65 
 
 
383 aa  279  4e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  47.24 
 
 
375 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  47.24 
 
 
375 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  46.65 
 
 
383 aa  279  4e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  46.65 
 
 
383 aa  279  6e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02026  porin signal peptide protein  46.37 
 
 
382 aa  275  6e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.555277 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  46.91 
 
 
384 aa  275  9e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  44.02 
 
 
386 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>