More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5812 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5812  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 299 aa  590  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.613812  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  91.3 
 
 		 299 aa  530  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  92.28 
 
 		 299 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  90.97 
 
 		 299 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  90.97 
 
 		 299 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.59 
 
 		 297 aa  415  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.335118 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1705  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.61 
 
 		 297 aa  407  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.39 
 
 		 300 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0553918 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2693  putative short chain oxidoreductase  64.86 
 
 		 299 aa  391  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.233392  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.33 
 
 		 301 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4664  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.57 
 
 		 308 aa  345  5e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.01 
 
 		 299 aa  330  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.82 
 
 		 308 aa  325  5e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000847254  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.24 
 
 		 302 aa  314  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3013  putative oxidoreductase, short- chain dehydrogenase/reductase  55.07 
 
 		 321 aa  308  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2372  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.69 
 
 		 201 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.67309 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.82 
 
 		 307 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.45 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.958738  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.45 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.64 
 
 		 297 aa  166  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000449491  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.93 
 
 		 285 aa  161  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0965696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.89 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 		 291 aa  149  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.387596  hitchhiker  0.000782233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.04 
 
 		 292 aa  143  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.980475  normal  0.163061 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.52 
 
 		 276 aa  124  3e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.62 
 
 		 329 aa  122  9e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.821163 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.42 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.665507 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4067  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  37.44 
 
 		 298 aa  119  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122191  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.37 
 
 		 268 aa  119  9e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.57 
 
 		 286 aa  113  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3107  short-chain alcohol-related dehydrogenase  34.15 
 
 		 272 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.710903  normal  0.301955 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3545  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 		 268 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  34.92 
 
 		 344 aa  109  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.61 
 
 		 285 aa  109  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.593467  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5364  short chain dehydrogenase  40.31 
 
 		 270 aa  109  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 		 286 aa  109  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.866601  normal  0.69464 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  37.63 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6770  short chain dehydrogenase  36.7 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.44 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2279  short chain dehydrogenase  40.31 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  37.1 
 
 		 271 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.04 
 
 		 273 aa  106  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135056  normal  0.0706675 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 		 281 aa  106  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30 
 
 		 273 aa  105  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0526  short chain dehydrogenase  35.97 
 
 		 279 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0040  short chain dehydrogenase  35.11 
 
 		 283 aa  105  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  36.51 
 
 		 286 aa  105  9e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 		 268 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46600  short chain dehydrogenase  34.57 
 
 		 268 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000918039  hitchhiker  0.00000172259 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3218  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 		 268 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.88 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1586  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.43 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.21 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 		 317 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.69 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000406118  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3731  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 327 aa  103  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1825  short chain dehydrogenase  36.89 
 
 		 278 aa  103  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.356255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.01 
 
 		 271 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.09 
 
 		 306 aa  102  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1905  short chain dehydrogenase  28.57 
 
 		 280 aa  102  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0945301  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  33.71 
 
 		 278 aa  102  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  34.93 
 
 		 272 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1861  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  34.04 
 
 		 270 aa  102  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0952097  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 		 284 aa  102  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0942  short chain dehydrogenase  36.13 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.12 
 
 		 267 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  36.17 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  38.54 
 
 		 286 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000200632 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  32.8 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.74 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  31.75 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2355  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.741108  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0029  short chain dehydrogenase  32.4 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0106  short chain dehydrogenase  34.03 
 
 		 284 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.417565  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3237  short chain dehydrogenase  32.31 
 
 		 274 aa  99.8  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.996911 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3541  short chain dehydrogenase  32.38 
 
 		 270 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100637  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.08 
 
 		 279 aa  99.8  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000868521 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 		 281 aa  99.4  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1698  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.79 
 
 		 298 aa  99  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 		 272 aa  99  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  31.7 
 
 		 847 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.45 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.016311  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 282 aa  98.6  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.556145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4835  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.38 
 
 		 273 aa  97.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000227026 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.18 
 
 		 275 aa  97.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.274606 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.74 
 
 		 293 aa  97.1  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.23 
 
 		 279 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 		 282 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 		 275 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 		 265 aa  96.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2541  short chain dehydrogenase  28.65 
 
 		 291 aa  96.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000142979  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.84 
 
 		 296 aa  96.7  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2783  short chain dehydrogenase  26.62 
 
 		 291 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0502462 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4288  short chain dehydrogenase  36.02 
 
 		 287 aa  97.1  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>