More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2690 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 285 aa  574  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.593467  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  82.11 
 
 		 286 aa  465  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.866601  normal  0.69464 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.52 
 
 		 286 aa  251  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.74 
 
 		 283 aa  238  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.463236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2734  hypothetical protein  92.77 
 
 		 85 aa  160  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.225602  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.01 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 276 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  33.71 
 
 		 344 aa  136  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 		 300 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 		 317 aa  134  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  37.8 
 
 		 272 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0029  short chain dehydrogenase  36.74 
 
 		 278 aa  132  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  35.63 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3541  short chain dehydrogenase  40.4 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100637  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1861  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  38.38 
 
 		 270 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0952097  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3731  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 		 327 aa  129  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.97 
 
 		 273 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0040  short chain dehydrogenase  37.33 
 
 		 283 aa  129  8.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.95 
 
 		 273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.14 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.17 
 
 		 269 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.77 
 
 		 338 aa  127  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2279  short chain dehydrogenase  37.17 
 
 		 272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.22 
 
 		 280 aa  125  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2060  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 270 aa  125  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4288  short chain dehydrogenase  35.74 
 
 		 287 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1698  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.05 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0160935 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  36.32 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 		 272 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  37.76 
 
 		 271 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  32.31 
 
 		 278 aa  122  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  37.27 
 
 		 279 aa  122  6e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  42.02 
 
 		 286 aa  122  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000200632 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3209  short chain dehydrogenase  35.87 
 
 		 268 aa  122  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.821388  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 		 282 aa  122  8e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0983  short chain dehydrogenase  32.13 
 
 		 277 aa  122  8e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 		 282 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.556145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 268 aa  121  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.122827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.8 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.78 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2582  short chain dehydrogenase  29.6 
 
 		 291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0166341  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2787  short chain dehydrogenase  29.84 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2506  short chain dehydrogenase  29.84 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0942  short chain dehydrogenase  36.65 
 
 		 268 aa  120  3e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2541  short chain dehydrogenase  28.16 
 
 		 291 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000142979  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0876  short chain dehydrogenase  34.75 
 
 		 274 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0898899  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.22 
 
 		 273 aa  119  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0106  short chain dehydrogenase  36.65 
 
 		 284 aa  119  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.417565  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  33.46 
 
 		 847 aa  119  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2783  short chain dehydrogenase  28.06 
 
 		 291 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0502462 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.63 
 
 		 275 aa  118  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.24 
 
 		 291 aa  118  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2507  short chain dehydrogenase  29.44 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 		 268 aa  118  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0057  short chain dehydrogenase  36.67 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.551816 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2827  short chain dehydrogenase  28.86 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0982  short chain dehydrogenase  34.8 
 
 		 285 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2590  short chain dehydrogenase  32.45 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3645  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0519409 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2778  short chain dehydrogenase  32.45 
 
 		 281 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 		 279 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1073  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  33.72 
 
 		 847 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.77 
 
 		 286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1905  short chain dehydrogenase  28.29 
 
 		 280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0945301  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.2 
 
 		 280 aa  116  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152344 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2448  short chain dehydrogenase  34.33 
 
 		 277 aa  116  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 		 279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.016311  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0526  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 279 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.63 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2942  short chain dehydrogenase  31.69 
 
 		 280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.976984  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6205  short chain dehydrogenase  37.37 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  35.38 
 
 		 272 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  32.27 
 
 		 276 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.11 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0756  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0776  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2139  short chain dehydrogenase  37.16 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.980351 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0762  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 		 271 aa  113  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.85 
 
 		 287 aa  113  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0037  short chain dehydrogenase  35.53 
 
 		 283 aa  113  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.04 
 
 		 271 aa  113  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3545  short chain dehydrogenase  34.03 
 
 		 268 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  34.39 
 
 		 295 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.16 
 
 		 266 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146439  normal  0.0308076 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8863  short chain dehydrogenase  40.31 
 
 		 282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  34.3 
 
 		 295 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 		 285 aa  112  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.300574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.01 
 
 		 282 aa  112  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 		 285 aa  112  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1177  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 		 288 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46600  short chain dehydrogenase  36.51 
 
 		 268 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000918039  hitchhiker  0.00000172259 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 		 279 aa  112  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>