More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2355 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2355  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 258 aa  526  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.741108  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6247  short chain dehydrogenase  88.76 
 
 		 258 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893931  normal  0.68092 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1584  short chain dehydrogenase  88.76 
 
 		 258 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6723  short chain dehydrogenase  87.98 
 
 		 258 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2216  short chain dehydrogenase  50.39 
 
 		 260 aa  238  5e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0248  short chain dehydrogenase  46.33 
 
 		 264 aa  224  9e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.362488  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1588  short chain dehydrogenase  46.33 
 
 		 264 aa  224  9e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0912  short chain dehydrogenase  46.33 
 
 		 264 aa  224  9e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1148  short chain dehydrogenase  46.33 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.382657  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1964  short chain dehydrogenase  44.66 
 
 		 264 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1983  short chain dehydrogenase  44.66 
 
 		 264 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00829881  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3866  short chain dehydrogenase  45.49 
 
 		 258 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5800  short chain dehydrogenase  45.49 
 
 		 258 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4503  short chain dehydrogenase  45.49 
 
 		 258 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1347  short chain dehydrogenase  44.71 
 
 		 258 aa  215  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.371645 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2387  short chain dehydrogenase  46.09 
 
 		 264 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3356  short chain dehydrogenase  45.66 
 
 		 267 aa  211  9e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4362  short chain dehydrogenase  43.51 
 
 		 270 aa  211  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0228985 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1470  short chain dehydrogenase  40.91 
 
 		 271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.686209  normal  0.826438 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4060  short chain dehydrogenase  42.53 
 
 		 259 aa  192  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1209  short chain dehydrogenase  39.85 
 
 		 270 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  0.298722 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47060  short chain dehydrogenase  42.91 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.734179 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7041  short chain dehydrogenase  36.64 
 
 		 277 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  normal  0.204999 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5725  short chain dehydrogenase  35.62 
 
 		 277 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6377  short chain dehydrogenase  36.21 
 
 		 277 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1451  short chain dehydrogenase  36.21 
 
 		 277 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  35.86 
 
 		 276 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  40.1 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  33.76 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1905  short chain dehydrogenase  34.78 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0945301  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6919  short chain dehydrogenase  36.05 
 
 		 276 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0843  short chain dehydrogenase  31.4 
 
 		 275 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6478  short chain dehydrogenase  34.76 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0193628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4537  short chain dehydrogenase  34.32 
 
 		 277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2506  short chain dehydrogenase  30.17 
 
 		 291 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2541  short chain dehydrogenase  34.01 
 
 		 291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000142979  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.84 
 
 		 267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615665  normal  0.271714 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2590  short chain dehydrogenase  32.14 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2507  short chain dehydrogenase  32.14 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2783  short chain dehydrogenase  32.14 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0502462 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7039  short chain dehydrogenase  36.02 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0246661  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.63 
 
 		 286 aa  113  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2778  short chain dehydrogenase  32.14 
 
 		 281 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8863  short chain dehydrogenase  39.33 
 
 		 282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.83 
 
 		 285 aa  112  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46420  short chain dehydrogenase  34.19 
 
 		 277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000350021  hitchhiker  0.000971378 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0040  short chain dehydrogenase  32.24 
 
 		 283 aa  112  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1687  short chain dehydrogenase  34.85 
 
 		 279 aa  112  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2827  short chain dehydrogenase  33.16 
 
 		 291 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.74 
 
 		 280 aa  111  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152344 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2806  short chain dehydrogenase  28.81 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.928497  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1655  hypothetical protein  34.52 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2787  short chain dehydrogenase  32.14 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4288  short chain dehydrogenase  37.24 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2582  short chain dehydrogenase  30.04 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0166341  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0984  short chain dehydrogenase  33.89 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.84 
 
 		 281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.38 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1648  hypothetical protein  34.52 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.958738  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.9 
 
 		 281 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.212887  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5243  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 		 245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4451  short chain dehydrogenase  37.07 
 
 		 270 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.2 
 
 		 287 aa  108  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  35.6 
 
 		 279 aa  108  7.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0029  short chain dehydrogenase  31.05 
 
 		 278 aa  108  8.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  36.65 
 
 		 344 aa  108  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1274  short chain dehydrogenase  37.07 
 
 		 270 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4574  short chain dehydrogenase  37.56 
 
 		 270 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1560  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  34.27 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.91 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3107  short-chain alcohol-related dehydrogenase  35.94 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  36.67 
 
 		 279 aa  105  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  34.97 
 
 		 286 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37 
 
 		 281 aa  106  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0876  short chain dehydrogenase  37.23 
 
 		 274 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 		 247 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00179214  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.46 
 
 		 286 aa  105  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.137743 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2717  short chain dehydrogenase  36.55 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 		 306 aa  103  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0101  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.97 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104553  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1180  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.14 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0718028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.35 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.09 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4067  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  33.16 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122191  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.62 
 
 		 279 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 		 256 aa  103  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 		 264 aa  102  4e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2942  short chain dehydrogenase  31.93 
 
 		 280 aa  102  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.976984  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.83 
 
 		 300 aa  102  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0898899  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>