223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3867 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3867  regulatory protein ArsR  100 
 
 
118 aa  224  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248206  normal  0.706318 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1865  transcriptional regulator, ArsR family  61.62 
 
 
105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0248  regulatory protein ArsR  60.82 
 
 
109 aa  105  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1535  ArsR family transcriptional regulator  41.84 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0449302 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0251  transcriptional regulator, ArsR family  43.62 
 
 
120 aa  70.5  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4480  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2848  transcriptional regulator, ArsR family  40.37 
 
 
118 aa  68.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000188384  normal  0.0300767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0241  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
119 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000436096 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  38.04 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3317  transcriptional regulator, TrmB  46.27 
 
 
108 aa  58.9  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  37.62 
 
 
110 aa  57  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3928  transcriptional regulator, ArsR family  40.86 
 
 
107 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.479587 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
103 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
109 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 
106 aa  54.3  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1120  transcriptional regulator, ArsR family  34.65 
 
 
112 aa  52.8  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.360075 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0625  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 
117 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.906206 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  42.42 
 
 
118 aa  52.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2717  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 
111 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4237  ArsR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
113 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0889801  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 
115 aa  52  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  38.03 
 
 
110 aa  51.2  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4189  ArsR family transcriptional regulator  43.84 
 
 
117 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519791  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4255  ArsR family transcriptional regulator  43.84 
 
 
117 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.071217 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4416  ArsR family transcriptional regulator  43.84 
 
 
117 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.381445  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4542  regulatory protein ArsR  43.94 
 
 
111 aa  50.8  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.436444 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4982  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.21 
 
 
111 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
107 aa  50.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  25.77 
 
 
107 aa  50.4  0.000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2215  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
111 aa  50.1  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3513  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 
109 aa  50.1  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  28.97 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
112 aa  49.7  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  28.97 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
111 aa  50.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  28.97 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0828  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 
120 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  28.97 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4551  regulatory protein ArsR  42.37 
 
 
110 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4142  regulatory protein ArsR  36.63 
 
 
114 aa  49.7  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2970  ArsR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3937  regulatory protein, ArsR  42.62 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3509  regulatory protein, ArsR  41.43 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  27.78 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0539  transcriptional regulator, ArsR family  42.37 
 
 
124 aa  48.9  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5082  transcriptional regulator, ArsR family  43.28 
 
 
107 aa  48.9  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.657053 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4571  regulatory protein ArsR  45.45 
 
 
168 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  43.08 
 
 
118 aa  47.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 
128 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
133 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0777  transcriptional regulator, ArsR family  32.71 
 
 
267 aa  47  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
99 aa  47  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1802  ArsR family transcriptional regulator  37.86 
 
 
116 aa  47  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.35409  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
108 aa  47  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  34.85 
 
 
113 aa  47  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2551  regulatory protein ArsR  36.46 
 
 
111 aa  47  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365475  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
122 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3558  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681826  normal  0.406985 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
109 aa  47  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2599  ArsR family transcriptional regulator  45.76 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3885  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
116 aa  47  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11439  normal  0.100535 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  43.94 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  25.25 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 
115 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  37.11 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  29.03 
 
 
105 aa  46.2  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  38.98 
 
 
119 aa  45.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0720  regulatory protein ArsR  41.67 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.849038  normal  0.217468 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  37.1 
 
 
99 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20650  transcriptional regulator, ArsR family  37.88 
 
 
119 aa  45.4  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  30.95 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11840  transcriptional regulator, ArsR family  36.14 
 
 
119 aa  46.2  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0733  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
106 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  27.59 
 
 
107 aa  45.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  32.63 
 
 
108 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  27.59 
 
 
106 aa  45.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16640  hypothetical protein  35.06 
 
 
266 aa  45.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  29.67 
 
 
110 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3194  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 
115 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.847871  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  29.89 
 
 
107 aa  45.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  28 
 
 
112 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0627  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.960217  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  33.61 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3521  ArsR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
368 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
111 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  31.96 
 
 
117 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
104 aa  45.1  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5266  transcriptional regulator, ArsR family  36.07 
 
 
368 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  31.63 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2602  ArsR family transcriptional regulator  34 
 
 
121 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2464  ArsR family transcriptional regulator  34 
 
 
121 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889424  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4133  regulatory protein ArsR  32.29 
 
 
106 aa  45.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6292  transcriptional regulator, ArsR family  43.82 
 
 
116 aa  45.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>