61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0322 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0322  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  585  1e-166  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00232188  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  22.68 
 
 
352 aa  70.5  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  23.87 
 
 
347 aa  65.1  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  22.56 
 
 
360 aa  61.2  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  23.53 
 
 
371 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  25.46 
 
 
357 aa  57.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  23.02 
 
 
361 aa  56.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  22.83 
 
 
359 aa  56.2  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  26.38 
 
 
349 aa  56.2  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  23.71 
 
 
373 aa  56.2  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  24.26 
 
 
349 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  22.73 
 
 
364 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1459  inner-membrane translocator  26.76 
 
 
290 aa  53.9  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4193  inner-membrane translocator  21.12 
 
 
375 aa  53.9  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0474  inner-membrane translocator  21.85 
 
 
334 aa  54.3  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.000000132511  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  22.63 
 
 
367 aa  53.9  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  23.83 
 
 
355 aa  53.5  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1717  inner-membrane translocator  22.98 
 
 
361 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318895  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  26.69 
 
 
368 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1692  inner-membrane translocator  23.98 
 
 
367 aa  52.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108076  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1119  inner-membrane translocator  20.77 
 
 
364 aa  52  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582837  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1699  inner-membrane translocator  20.63 
 
 
363 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0601171 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  22.36 
 
 
442 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2018  inner-membrane translocator  20.63 
 
 
363 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345381  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0751  inner-membrane translocator  25.38 
 
 
301 aa  51.2  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0953  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.49 
 
 
354 aa  49.7  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  22.76 
 
 
309 aa  49.7  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  24.14 
 
 
361 aa  49.7  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  27.13 
 
 
365 aa  49.3  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  26.07 
 
 
311 aa  49.3  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  23.28 
 
 
366 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  24 
 
 
366 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0569  ABC transporter, permease protein  22.48 
 
 
360 aa  48.5  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0568  ABC transporter, permease protein  23.43 
 
 
306 aa  48.1  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  23.2 
 
 
364 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0534  ABC transporter, permease protein  22.27 
 
 
358 aa  48.5  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  20.92 
 
 
376 aa  47.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  24.05 
 
 
338 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  22.71 
 
 
403 aa  47.4  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0535  ABC transporter, permease protein  23.43 
 
 
306 aa  47  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1120  inner-membrane translocator  22.48 
 
 
363 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016502  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3901  inner-membrane translocator  25 
 
 
306 aa  46.6  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.725338  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5056  inner-membrane translocator  21.48 
 
 
363 aa  46.2  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  21.07 
 
 
310 aa  46.2  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  25 
 
 
427 aa  45.8  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  22.46 
 
 
349 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0766  inner-membrane translocator  20.43 
 
 
366 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.286695  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1509  branched chain amino acid ABC transporter, permease protein  22.28 
 
 
306 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1646  inner-membrane translocator  20.32 
 
 
335 aa  44.3  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.12829  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3577  inner-membrane translocator  21.84 
 
 
360 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2059  ABC transporter permease  23.57 
 
 
363 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0851  inner-membrane translocator  23.33 
 
 
310 aa  44.3  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  21.48 
 
 
286 aa  44.3  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  21.25 
 
 
349 aa  43.9  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1003  inner-membrane translocator  24.11 
 
 
369 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4143  inner-membrane translocator  22.22 
 
 
382 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  21.07 
 
 
376 aa  43.9  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  22.47 
 
 
344 aa  43.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5876  inner-membrane translocator  27.68 
 
 
306 aa  43.1  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585609  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3630  inner-membrane translocator  22.38 
 
 
306 aa  42.7  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  21.36 
 
 
360 aa  42.7  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>