More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1373 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  89.07 
 
 
443 aa  637    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  89.07 
 
 
461 aa  636    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  89.07 
 
 
443 aa  636    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  89.07 
 
 
461 aa  636    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  100 
 
 
443 aa  860    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  89.07 
 
 
461 aa  636    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  89.07 
 
 
452 aa  637    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  89.07 
 
 
461 aa  636    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  68.4 
 
 
458 aa  534  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  67.84 
 
 
440 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  67.1 
 
 
435 aa  490  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  66.33 
 
 
439 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  66.08 
 
 
437 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  66.33 
 
 
439 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1329  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  45.15 
 
 
425 aa  271  2e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  41.2 
 
 
418 aa  269  8.999999999999999e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  41.19 
 
 
418 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  40.9 
 
 
443 aa  267  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  43.48 
 
 
426 aa  264  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  40.21 
 
 
421 aa  263  6.999999999999999e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  41.71 
 
 
451 aa  259  6e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  41.73 
 
 
438 aa  255  9e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1089  outer membrane efflux protein  43.04 
 
 
444 aa  250  4e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  39.29 
 
 
415 aa  246  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  38.48 
 
 
423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  38.48 
 
 
423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  38.48 
 
 
423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4596  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin  42.19 
 
 
431 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688687  hitchhiker  0.005842 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  38.48 
 
 
394 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  37.6 
 
 
416 aa  233  5e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2209  outer membrane efflux protein  40 
 
 
433 aa  233  6e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.798472  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  38.44 
 
 
428 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  37.59 
 
 
471 aa  233  7.000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3557  outer membrane efflux protein  40.39 
 
 
442 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  38.7 
 
 
428 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0491  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  42.35 
 
 
441 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  35.54 
 
 
472 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  39.11 
 
 
408 aa  206  9e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2504  outer membrane efflux protein  38.83 
 
 
436 aa  201  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10477  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  38.73 
 
 
408 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3287  outer membrane efflux protein  39.43 
 
 
464 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2408  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC, putative  38.79 
 
 
425 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00195815  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2042  outer membrane efflux protein  39.02 
 
 
417 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367282  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  33.5 
 
 
424 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  33.82 
 
 
423 aa  156  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  32.35 
 
 
438 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1848  outer membrane efflux protein  31.82 
 
 
423 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3648  outer membrane efflux protein  32.58 
 
 
424 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2298  outer membrane efflux protein  31.94 
 
 
423 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  32.14 
 
 
422 aa  146  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4530  outer membrane efflux protein  33.09 
 
 
425 aa  143  5e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  31.65 
 
 
423 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2142  outer membrane efflux protein  31.67 
 
 
423 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.143725 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3343  outer membrane efflux protein  33.08 
 
 
423 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.141208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1455  Outer membrane efflux protein  31.57 
 
 
423 aa  139  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.170729  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3802  Outer membrane efflux protein  28.86 
 
 
465 aa  128  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1582  outer membrane efflux protein  27.17 
 
 
523 aa  117  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0665  outer membrane efflux protein  28.18 
 
 
453 aa  110  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000306808  hitchhiker  0.00231848 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2373  HelC protein  25.62 
 
 
414 aa  110  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3371  outer membrane efflux protein  29.82 
 
 
407 aa  110  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.252246  normal  0.409086 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  25.26 
 
 
437 aa  108  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31040  putative cation efflux system protein  30.58 
 
 
415 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000919684  unclonable  5.14474e-22 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  28.05 
 
 
434 aa  106  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2567  outer membrane efflux protein  31.04 
 
 
433 aa  105  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3870  Co/Zn/Cd efflux system component  29.1 
 
 
448 aa  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  27.93 
 
 
432 aa  104  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4120  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmyC  26.79 
 
 
460 aa  104  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0516  outer membrane efflux protein  25.99 
 
 
413 aa  104  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2339  outer membrane efflux protein  30.2 
 
 
437 aa  103  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.884796  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  26.89 
 
 
432 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  25.82 
 
 
431 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  25.78 
 
 
432 aa  101  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1044  HelC protein  25.13 
 
 
416 aa  100  6e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2254  Outer membrane efflux protein  27.94 
 
 
436 aa  99.8  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4156  outer membrane efflux protein  26.35 
 
 
446 aa  99.4  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.283296 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  27.57 
 
 
432 aa  98.6  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2284  outer membrane efflux protein  30.86 
 
 
420 aa  98.6  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185931  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2609  outer membrane efflux protein  30.47 
 
 
425 aa  96.3  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00407  putative outer membrane cation efflux system protein  29.61 
 
 
451 aa  95.5  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00236087  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2097  Outer membrane efflux protein  23.98 
 
 
435 aa  95.1  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.771655  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1957  putative RND efflux system protein  26.58 
 
 
444 aa  94.4  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2353  chemiosmotic efflux system C protein C  26.06 
 
 
437 aa  94.4  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0150  Outer membrane efflux protein  28.72 
 
 
415 aa  94  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.921658  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0502  outer membrane efflux protein  27.25 
 
 
433 aa  92  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  26.57 
 
 
437 aa  91.7  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  27.64 
 
 
428 aa  90.9  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1176  Outer membrane efflux protein  30.4 
 
 
429 aa  90.9  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2447  outer membrane efflux protein  32.42 
 
 
423 aa  90.1  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2065  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  27.32 
 
 
441 aa  89  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3455  outer membrane efflux protein  25.13 
 
 
449 aa  87  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414344  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2075  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  25.78 
 
 
437 aa  86.7  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1958  aconitate hydratase 1  27.21 
 
 
422 aa  86.7  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0713794  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0294  Outer membrane efflux protein  27.7 
 
 
420 aa  86.7  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2262  outer membrane heavy metal efflux protein  26.56 
 
 
426 aa  85.9  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  23.63 
 
 
426 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3507  Outer membrane efflux protein  25.12 
 
 
435 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2321  outer membrane efflux protein  31.01 
 
 
428 aa  85.1  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.760032  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0385  outer membrane efflux protein  27.86 
 
 
474 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  26.05 
 
 
479 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08520  Outer membrane efflux protein  28.39 
 
 
424 aa  84.3  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>