More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_0127 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3991  ATP-dependent helicase HrpB  63.85 
 
 
821 aa  973  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4319  ATP-dependent helicase HrpB  63.48 
 
 
821 aa  966  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0302  ATP-dependent helicase HrpB  57.8 
 
 
825 aa  872  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.204863 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0067  DEAD box-like helicase  62.67 
 
 
820 aa  953  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0419076  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1148  ATP-dependent helicase HrpB  48.68 
 
 
838 aa  648  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.658712  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7107  ATP-dependent helicase HrpB  60.22 
 
 
850 aa  842  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4320  ATP-dependent helicase HrpB  46.93 
 
 
844 aa  636  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.043486  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0536  ATP-dependent helicase HrpB  56.93 
 
 
825 aa  829  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4854  ATP-dependent helicase HrpB  54.9 
 
 
877 aa  837  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.951101 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4651  ATP-dependent helicase HrpB  57.73 
 
 
833 aa  841  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262977  normal  0.748056 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7352  ATP-dependent helicase  57.25 
 
 
824 aa  860  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0359  ATP-dependent helicase HrpB  56.75 
 
 
872 aa  852  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.508853 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0505  ATP-dependent helicase HrpB  54.57 
 
 
870 aa  835  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.967773 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3081  ATP-dependent helicase HrpB  46.42 
 
 
827 aa  643  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.895104  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0147  ATP-dependent helicase HrpB  89.24 
 
 
818 aa  1422  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.210088  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0127  ATP-dependent helicase HrpB  100 
 
 
832 aa  1627  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00299316  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3275  ATP-dependent helicase HrpB  62.15 
 
 
821 aa  958  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4801  ATP-dependent helicase HrpB  59.59 
 
 
826 aa  846  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.510158 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0455  ATP-dependent helicase HrpB  57.44 
 
 
829 aa  859  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4284  ATP-dependent helicase HrpB  57.28 
 
 
854 aa  815  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1590  ATP-dependent helicase HrpB  55.57 
 
 
825 aa  792  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357448  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3449  ATP-dependent helicase HrpB  53.69 
 
 
814 aa  715  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.206852 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0595  ATP-dependent helicase HrpB  58.24 
 
 
821 aa  756  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.420753  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6547  ATP-dependent helicase HrpB  60.9 
 
 
823 aa  794  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.10181  normal  0.639209 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0688  ATP-dependent RNA helicase HrpB  46.87 
 
 
809 aa  645  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0972793  normal  0.531464 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0516  ATP-dependent helicase HrpB  47.39 
 
 
822 aa  664  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.355693 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2129  ATP-dependent helicase HrpB  57.13 
 
 
837 aa  782  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1261  ATP-dependent helicase HrpB  54.93 
 
 
825 aa  824  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0343419 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4043  ATP-dependent helicase HrpB  67.4 
 
 
821 aa  984  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0073  ATP-dependent helicase HrpB  46.71 
 
 
824 aa  633  1e-180  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3454  ATP-dependent helicase HrpB  46.32 
 
 
824 aa  631  1e-179  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.629145  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0157  ATP-dependent RNA helicase HrpB  46.38 
 
 
824 aa  630  1e-179  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4648  ATP-dependent helicase HrpB  47.16 
 
 
842 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.052727  normal  0.20008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4808  ATP-dependent helicase HrpB  46.04 
 
 
844 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0152  ATP-dependent RNA helicase HrpB  46.15 
 
 
809 aa  627  1e-178  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00171749  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3511  ATP-dependent RNA helicase HrpB  45.84 
 
 
824 aa  625  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.661022  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0159  ATP-dependent RNA helicase HrpB  45.96 
 
 
824 aa  625  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.805468  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0151  ATP-dependent RNA helicase HrpB  46.58 
 
 
809 aa  625  1e-178  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.98462e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0648  ATP-dependent helicase HrpB  46.8 
 
 
842 aa  626  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242487  normal  0.649022 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00146  hypothetical protein  46.15 
 
 
809 aa  627  1e-178  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0519083  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1180  ATP-dependent helicase HrpB  45.96 
 
 
828 aa  626  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9477e-16 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00147  predicted ATP-dependent helicase  46.15 
 
 
809 aa  627  1e-178  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0534884  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4935  ATP-dependent helicase HrpB  46.18 
 
 
839 aa  627  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.557516 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3982  ATP-dependent RNA helicase HrpB  45.54 
 
 
812 aa  622  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0579093  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0139  ATP-dependent RNA helicase HrpB  46.03 
 
 
809 aa  624  1e-177  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4735  ATP-dependent helicase HrpB  44.58 
 
 
840 aa  622  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.784057  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09990  DEAH-box ATP-dependent helicase HrpB  47.97 
 
 
838 aa  622  1e-176  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.371307  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2232  ATP-dependent helicase HrpB  44.86 
 
 
842 aa  622  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0479151  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4772  ATP-dependent helicase HrpB  47.04 
 
 
842 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0178797 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3739  ATP-dependent helicase HrpB  47.86 
 
 
844 aa  614  1e-174  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0206  ATP-dependent RNA helicase HrpB  46.31 
 
 
824 aa  615  1e-174  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.776045  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0205  ATP-dependent RNA helicase HrpB  46.07 
 
 
824 aa  612  1e-174  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.879127  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0221  ATP-dependent RNA helicase HrpB  46.19 
 
 
824 aa  613  1e-174  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0217  ATP-dependent RNA helicase HrpB  46.19 
 
 
824 aa  613  1e-174  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.976044  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0223  ATP-dependent RNA helicase HrpB  45.95 
 
 
824 aa  608  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1355  ATP-dependent helicase HrpB  48.65 
 
 
817 aa  610  1e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.166416  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1838  ATP-dependent helicase HrpB  46.07 
 
 
846 aa  607  1e-172  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458406  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1588  ATP-dependent helicase HrpB  46.56 
 
 
847 aa  607  1e-172  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.41464  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3464  ATP-dependent RNA helicase HrpB  45.9 
 
 
829 aa  607  1e-172  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1001  ATP-dependent RNA helicase HrpB  45.9 
 
 
853 aa  608  1e-172  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3335  ATP-dependent RNA helicase HrpB  45.9 
 
 
834 aa  605  1e-171  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.825067  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2365  ATP-dependent helicase HrpB  48.02 
 
 
860 aa  604  1e-171  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.701913  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2348  ATP-dependent helicase HrpB  45.73 
 
 
842 aa  603  1e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0559  ATP-dependent helicase HrpB  45.8 
 
 
822 aa  600  1e-170  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12630  putative ATP-dependent helicase  47.31 
 
 
830 aa  599  1e-170  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1349  ATP-dependent helicase HrpB  46.44 
 
 
842 aa  599  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.228837  hitchhiker  3.48515e-09 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3111  ATP-dependent RNA helicase HrpB  44.93 
 
 
820 aa  601  1e-170  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2816  ATP-dependent RNA helicase HrpB  46 
 
 
812 aa  602  1e-170  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0665  ATP-dependent helicase protein, putative  47.34 
 
 
832 aa  596  1e-169  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2603  ATP-dependent RNA helicase HrpB  40.46 
 
 
821 aa  595  1e-169  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.587865  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1167  ATP-dependent RNA helicase HrpB  44.9 
 
 
814 aa  595  1e-169  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1573  thiolase  43.61 
 
 
864 aa  597  1e-169  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142066  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0130  ATP-dependent RNA helicase HrpB  43.86 
 
 
820 aa  598  1e-169  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0976  ATP-dependent helicase HrpB  46.48 
 
 
848 aa  592  1e-168  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0156609  normal  0.918373 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0192  ATP-dependent helicase HrpB  47.03 
 
 
917 aa  595  1e-168  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0135151 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3110  ATP-dependent helicase  40.02 
 
 
826 aa  589  1e-167  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.924657  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1083  ATP-dependent helicase HrpB  45.66 
 
 
829 aa  590  1e-167  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.220902 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1035  ATP-dependent RNA helicase HrpB  45.45 
 
 
825 aa  589  1e-167  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03444  ATP-dependent RNA helicase HrpB  40.88 
 
 
833 aa  588  1e-166  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2580  ATP-dependent RNA helicase  46.33 
 
 
834 aa  578  1e-163  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.262395  hitchhiker  5.13711e-05 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002567  ATP-dependent helicase HrpB  40.51 
 
 
822 aa  577  1e-163  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3407  ATP-dependent helicase HrpB  42.24 
 
 
835 aa  576  1e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.982669  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3458  ATP-dependent helicase HrpB  46.14 
 
 
798 aa  578  1e-163  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0622  ATP-dependent helicase HrpB  42.24 
 
 
835 aa  572  1e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.53674 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0623  ATP-dependent helicase HrpB  42.24 
 
 
835 aa  573  1e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2844  ATP-dependent helicase HrpB  44.07 
 
 
830 aa  570  1e-161  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.454612  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0098  ATP-dependent helicase HrpB  45.36 
 
 
826 aa  572  1e-161  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.310548 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2013  DEAD/DEAH box helicase  45.76 
 
 
808 aa  567  1e-160  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.211525  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0585  ATP-dependent helicase HrpB  38.86 
 
 
835 aa  566  1e-160  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3111  ATP-dependent helicase HrpB  45.71 
 
 
808 aa  563  1e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.577878  normal  0.0241826 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0723  ATP-dependent helicase HrpB  45.64 
 
 
808 aa  563  1e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336305  normal  0.341531 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0669  ATP-dependent helicase HrpB  44.41 
 
 
841 aa  563  1e-159  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1306  ATP-dependent helicase HrpB  43 
 
 
900 aa  560  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.493804  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0632  ATP-dependent helicase HrpB  40.74 
 
 
835 aa  560  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3869  ATP-dependent helicase HrpB  40.38 
 
 
849 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0655  ATP-dependent helicase HrpB  40.17 
 
 
846 aa  557  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2061  ATP-dependent helicase HrpB  43.76 
 
 
837 aa  556  1e-157  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0816695  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0582  ATP-dependent helicase HrpB  40.17 
 
 
854 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0640  ATP-dependent helicase HrpB  46.75 
 
 
802 aa  550  1e-155  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.163213  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3686  ATP-dependent helicase HrpB  39.79 
 
 
856 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>