146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0846 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0846  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 421 aa  846    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  hitchhiker  0.00594876 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  60.58 
 
 		 423 aa  538  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2685  polysaccharide biosynthesis protein  45.74 
 
 		 424 aa  360  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.698647 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1426  polysaccharide biosynthesis protein  33.17 
 
 		 455 aa  241  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2949  polysaccharide biosynthesis protein  32.94 
 
 		 455 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.484076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1696  polysaccharide biosynthesis protein  32.04 
 
 		 454 aa  229  7e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.235327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2007  polysaccharide biosynthesis protein  31.92 
 
 		 442 aa  219  7e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0855349 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3801  polysaccharide biosynthesis export protein-like  28.37 
 
 		 420 aa  168  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3244  polysaccharide biosynthesis protein  28.99 
 
 		 421 aa  150  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0109073  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  26.36 
 
 		 488 aa  124  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  24.31 
 
 		 479 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  26.85 
 
 		 483 aa  120  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 486 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  25.34 
 
 		 507 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  28.1 
 
 		 490 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  27.1 
 
 		 493 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  22.9 
 
 		 487 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  24.06 
 
 		 489 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  25.27 
 
 		 503 aa  110  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1128  polysaccharide biosynthesis protein  25.92 
 
 		 508 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  26.39 
 
 		 487 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  24.18 
 
 		 476 aa  105  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  25.12 
 
 		 510 aa  103  7e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  25.12 
 
 		 510 aa  102  9e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01400  exopolysaccharide xanthan biosynthesis protein GumJ  26.35 
 
 		 497 aa  101  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  21.77 
 
 		 501 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 484 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6454  polysaccharide biosynthesis protein  24.61 
 
 		 508 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.24308 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  21.76 
 
 		 501 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  23.71 
 
 		 509 aa  94.4  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  22.74 
 
 		 475 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  22.74 
 
 		 474 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  26.75 
 
 		 509 aa  92.8  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  24.86 
 
 		 492 aa  92  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  24.86 
 
 		 492 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  24.86 
 
 		 492 aa  92  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  24.86 
 
 		 492 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  24.86 
 
 		 492 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  25.26 
 
 		 497 aa  90.9  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  24.86 
 
 		 492 aa  90.9  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  24.8 
 
 		 503 aa  90.5  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  24.8 
 
 		 510 aa  90.1  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  24.8 
 
 		 510 aa  90.1  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  24.8 
 
 		 510 aa  90.1  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  24.8 
 
 		 510 aa  90.5  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  24.59 
 
 		 492 aa  89  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  24.59 
 
 		 492 aa  89  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5180  polysaccharide biosynthesis protein  23.5 
 
 		 467 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3453  polysaccharide biosynthesis protein  20.15 
 
 		 504 aa  87.8  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231581  normal  0.276623 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4050  polysaccharide biosynthesis protein  21.67 
 
 		 501 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0232705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  23.01 
 
 		 503 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3719  capsular polysaccharide synthesis protein  20.27 
 
 		 504 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.660756  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  22.85 
 
 		 492 aa  83.6  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0649  polysaccharide biosynthesis protein  23.79 
 
 		 498 aa  83.2  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0777  polysaccharide biosynthesis protein  22.66 
 
 		 504 aa  83.2  0.000000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3039  polysaccharide biosynthesis protein  23.26 
 
 		 482 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3104  polysaccharide biosynthesis protein  24.62 
 
 		 502 aa  81.6  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2706  polysaccharide biosynthesis protein  22.83 
 
 		 510 aa  82  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.513472 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3680  polysaccharide biosynthesis protein  22.52 
 
 		 515 aa  82  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1408  polysaccharide biosynthesis protein  24.07 
 
 		 482 aa  82  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  21.65 
 
 		 502 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 		 514 aa  80.9  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  23.01 
 
 		 483 aa  79.7  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 		 483 aa  79  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0847  polysaccharide biosynthesis protein  30.61 
 
 		 457 aa  78.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.875823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  22.48 
 
 		 475 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  21.01 
 
 		 479 aa  77.4  0.0000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2888  polysaccharide biosynthesis protein  22.89 
 
 		 494 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0315028 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3247  hypothetical protein  20.83 
 
 		 504 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4254  polysaccharide biosynthesis protein  24.36 
 
 		 465 aa  76.3  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.16434 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  22.88 
 
 		 483 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  21.89 
 
 		 494 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02464  probable polysaccharide transport protein  23.67 
 
 		 488 aa  73.9  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  26.64 
 
 		 482 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  22.8 
 
 		 502 aa  72.8  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  22.56 
 
 		 488 aa  72  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3528  polysaccharide biosynthesis protein  24.15 
 
 		 481 aa  72.4  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000418203  normal  0.0383935 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  23.56 
 
 		 477 aa  71.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0292  polysaccharide biosynthesis protein  20.98 
 
 		 499 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.53568  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  21.68 
 
 		 503 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4554  polysaccharide biosynthesis protein  22.06 
 
 		 471 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1004  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 		 514 aa  69.7  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0175607 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3684  polysaccharide biosynthesis protein  24.68 
 
 		 490 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0592169  normal  0.904888 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  26.18 
 
 		 448 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1942  polysaccharide biosynthesis protein  24.1 
 
 		 491 aa  68.2  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2408  polysaccharide biosynthesis protein  22.84 
 
 		 471 aa  67.8  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  21.86 
 
 		 480 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  23.1 
 
 		 492 aa  66.6  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0730  putative polysaccharide transport protein  21.99 
 
 		 505 aa  65.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  18.4 
 
 		 487 aa  65.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1187  polysaccharide biosynthesis protein  20.65 
 
 		 488 aa  65.1  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1209  polysaccharide biosynthesis protein  20.11 
 
 		 492 aa  65.1  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0248  hypothetical protein  20.44 
 
 		 487 aa  63.9  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3770  polysaccharide biosynthesis protein  22.44 
 
 		 497 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  23.03 
 
 		 484 aa  63.5  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0032  polysaccharide biosynthesis protein  23.04 
 
 		 487 aa  63.2  0.000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.166793 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1190  polysaccharide biosynthesis protein  26.29 
 
 		 490 aa  61.6  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3381  polysaccharide biosynthesis protein  24.05 
 
 		 494 aa  61.2  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0051743  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3346  polysaccharide biosynthesis protein  24.24 
 
 		 472 aa  60.8  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176331  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1083  polysaccharide biosynthesis protein  21.43 
 
 		 484 aa  60.8  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.945146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>