105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1061 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1061  HNH endonuclease  100 
 
 
118 aa  240  5e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.255023  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1015  HNH endonuclease  75 
 
 
191 aa  142  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4428  hypothetical protein  54.13 
 
 
160 aa  115  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.580751 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2745  HNH endonuclease  45.45 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00704731  normal  0.0103404 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3731  HNH endonuclease  41.76 
 
 
178 aa  63.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0313  HNH endonuclease  37.88 
 
 
354 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  41.51 
 
 
146 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  35.63 
 
 
162 aa  47.8  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0063  hypothetical protein  33.33 
 
 
363 aa  46.6  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  34.44 
 
 
169 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  33.72 
 
 
166 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  39.19 
 
 
199 aa  46.2  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  49.02 
 
 
185 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1274  HNH endonuclease  42.86 
 
 
479 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3535  HNH endonuclease  39.19 
 
 
177 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1131  putative HNH endonuclease  47.06 
 
 
185 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3910  HNH endonuclease  39.19 
 
 
177 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.937815 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  47.62 
 
 
166 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  40 
 
 
197 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  47.06 
 
 
189 aa  45.1  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4063  HNH endonuclease  38.03 
 
 
221 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.501923 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  57.58 
 
 
171 aa  44.7  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1807  HNH endonuclease  36.62 
 
 
148 aa  44.7  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.236677  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  47.06 
 
 
185 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  29.27 
 
 
168 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  39.06 
 
 
177 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  29.27 
 
 
168 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  47.37 
 
 
424 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  44.26 
 
 
174 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  38.46 
 
 
204 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  45.1 
 
 
185 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2411  HNH endonuclease  48.48 
 
 
315 aa  43.5  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0868  HNH endonuclease  48.78 
 
 
165 aa  43.5  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0479287  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0745  HNH endonuclease  47.06 
 
 
191 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2129  HNH endonuclease  61.29 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.830228 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2524  HNH endonuclease  41.51 
 
 
216 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.434338 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5382  HNH endonuclease  46 
 
 
202 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.631878 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  57.58 
 
 
189 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  38.46 
 
 
198 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  39.34 
 
 
177 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4527  HNH endonuclease  46.94 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000580213  normal  0.505709 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  38.46 
 
 
198 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  44 
 
 
185 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3187  HNH nuclease  47.37 
 
 
404 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  45.1 
 
 
185 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3024  HNH endonuclease  33.72 
 
 
185 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  54.55 
 
 
196 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  41.18 
 
 
168 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  36 
 
 
172 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  39.58 
 
 
168 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  41.3 
 
 
174 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  35.29 
 
 
181 aa  41.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2729  restriction endonuclease  58.06 
 
 
194 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0771488  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  47.06 
 
 
213 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1387  HNH endonuclease  58.06 
 
 
194 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.322582  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  51.52 
 
 
197 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  51.52 
 
 
168 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3241  HNH endonuclease  54.55 
 
 
186 aa  41.6  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118071  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3553  HNH endonuclease  41.18 
 
 
185 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367592  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3846  HNH endonuclease  41.18 
 
 
185 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3897  HNH endonuclease  37.93 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1114  HNH endonuclease  33.67 
 
 
92 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  45.65 
 
 
183 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  47.37 
 
 
403 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  43.75 
 
 
165 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7339  HNH endonuclease  37.04 
 
 
180 aa  41.2  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539168  hitchhiker  0.000174655 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  38.03 
 
 
481 aa  41.2  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  47.37 
 
 
405 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  31.4 
 
 
170 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0033  hypothetical protein  38.6 
 
 
220 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000766815 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2573  HNH endonuclease  33.8 
 
 
220 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  47.37 
 
 
404 aa  41.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2211  HNH nuclease  50 
 
 
184 aa  40.8  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2776  HNH endonuclease  51.52 
 
 
179 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.228269  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10581  HNH endonuclease:HNH nuclease  48.65 
 
 
113 aa  41.2  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10581  HNH endonuclease:HNH nuclease  48.65 
 
 
113 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.307886  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2650  HNH endonuclease  41.46 
 
 
236 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.479892 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01172  HNH endonuclease family protein  40.91 
 
 
220 aa  40.8  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.572297  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1158  HNH endonuclease  30.56 
 
 
360 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.161614  normal  0.0199852 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  48.48 
 
 
459 aa  40.8  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  47.37 
 
 
405 aa  41.2  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1202  HNH endonuclease  34.78 
 
 
205 aa  40.8  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3386  hypothetical protein  57.58 
 
 
126 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  43.48 
 
 
182 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  35.44 
 
 
166 aa  40.8  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4633  HNH endonuclease  37.68 
 
 
177 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.57722  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1966  HNH endonuclease  39.34 
 
 
198 aa  40.4  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00730089  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  40.98 
 
 
186 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  36.51 
 
 
170 aa  40.4  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3127  HNH nuclease  41.67 
 
 
474 aa  40.4  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0215087 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0327  CRISPR-associated Cas5e family protein  33.33 
 
 
1395 aa  40.4  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  48.78 
 
 
165 aa  40.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0037  HNH nuclease  48.48 
 
 
131 aa  40.4  0.009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3341  HNH nuclease  47.37 
 
 
408 aa  40.4  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0650205  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12494  hypothetical protein  50 
 
 
222 aa  40.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.255519 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3705  HNH endonuclease  32.81 
 
 
205 aa  40.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.189968  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  34.38 
 
 
165 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  43.48 
 
 
183 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  34.38 
 
 
165 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0987  HNH nuclease  45.95 
 
 
113 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.565231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>