More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0098 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0098  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
121 aa  239  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2464  transcriptional regulator, ArsR family  48.45 
 
 
129 aa  95.9  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0703378  decreased coverage  0.00378407 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  51.65 
 
 
114 aa  91.7  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1120  regulatory protein, ArsR  47.57 
 
 
125 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4471  ArsR family transcriptional regulator  50.56 
 
 
110 aa  89  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 
110 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3907  regulatory protein ArsR  46.39 
 
 
123 aa  85.1  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4383  ArsR family transcriptional regulator  47.31 
 
 
113 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 
125 aa  83.2  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.76 
 
 
109 aa  83.6  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5692  regulatory protein, ArsR  41.03 
 
 
125 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.073008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4227  transcriptional regulator, ArsR family  46.24 
 
 
111 aa  82  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3554  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.05 
 
 
113 aa  80.5  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00159574  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4701  transcriptional regulator, ArsR family  44.09 
 
 
113 aa  80.1  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4696  ArsR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
122 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4316  ArsR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
122 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3028  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
125 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4402  ArsR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
122 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  47.13 
 
 
115 aa  78.6  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10082  transcriptional regulator  44.57 
 
 
114 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0459233  normal  0.101509 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02300  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
122 aa  77.4  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6231  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
114 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0426  ArsR family transcriptional regulator  45.98 
 
 
115 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.850787  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19490  transcriptional regulator, ArsR family  43.96 
 
 
115 aa  74.3  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229335  normal  0.0268892 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
100 aa  72.4  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  36.84 
 
 
118 aa  68.2  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  34.29 
 
 
117 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  38.3 
 
 
112 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  38.3 
 
 
112 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  38.1 
 
 
108 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3618  ArsR family transcriptional regulator  39.33 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0439  transcriptional regulator  34.04 
 
 
117 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000113831  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  40.54 
 
 
114 aa  64.3  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  42.35 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000101  transcriptional regulator ArsR family  40.24 
 
 
102 aa  63.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344497  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3631  transcriptional regulator of ArsR family protein  46.15 
 
 
103 aa  63.5  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5186  transcriptional regulator, ArsR family  34.88 
 
 
117 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251574  normal  0.286102 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  35.23 
 
 
102 aa  60.5  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  33.68 
 
 
111 aa  60.5  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2970  ArsR family transcriptional regulator  39.33 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  29.03 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1709  regulatory protein, ArsR  35.29 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.641159  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  41.76 
 
 
117 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 
102 aa  57.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
102 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  43.02 
 
 
136 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  35.82 
 
 
93 aa  57  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  32.89 
 
 
114 aa  56.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  28.05 
 
 
98 aa  56.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  29.76 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  32.94 
 
 
105 aa  55.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  32.89 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  38.38 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 
125 aa  55.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
221 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0444  ArsR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
126 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.450624  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  33.77 
 
 
115 aa  54.3  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  36.07 
 
 
111 aa  54.7  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25780  transcriptional regulator, ArsR family  41.11 
 
 
119 aa  54.3  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  36 
 
 
87 aa  54.3  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
116 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  41.79 
 
 
231 aa  53.9  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3430  transcriptional regulator, ArsR family  34.21 
 
 
91 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1937  ArsR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
107 aa  53.9  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3138  regulatory protein ArsR  38.96 
 
 
127 aa  53.9  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3120  ArsR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
88 aa  53.5  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0127966  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.06 
 
 
106 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2025  regulatory protein ArsR  32.56 
 
 
184 aa  53.5  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.650205  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
98 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  35.42 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2827  transcriptional regulator, ArsR family  41.89 
 
 
105 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313122  normal  0.191386 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1816  transcriptional regulator, ArsR family  34.21 
 
 
91 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.98028  normal  0.175921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  37 
 
 
120 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0432  ArsR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
111 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.714368 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0020  regulatory protein, ArsR  30.43 
 
 
101 aa  52.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  45.31 
 
 
221 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
105 aa  52  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2209  ArsR family transcriptional regulator  41.76 
 
 
130 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3096  transcriptional regulator, ArsR family  41.89 
 
 
105 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.556468  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3457  transcriptional regulator, ArsR family  32.89 
 
 
91 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3227  ArsR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
91 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3201  ArsR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
91 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00511684  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3134  ArsR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
91 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.339641  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
109 aa  52  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
109 aa  52  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3479  ArsR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
91 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
235 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
235 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  33.8 
 
 
111 aa  51.6  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4017  transcriptional regulator, ArsR family  35.53 
 
 
111 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.980499  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36710  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 
144 aa  51.6  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.944272 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
101 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  36.99 
 
 
103 aa  52  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
235 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3442  transcriptional regulator, ArsR family  32.89 
 
 
91 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
117 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3439  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
88 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  33.68 
 
 
127 aa  51.2  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0210  transcriptional activator HlyU  38.36 
 
 
85 aa  51.6  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000976206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>