217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0116 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0116  Bile acid:sodium symporter  100 
 
 
310 aa  609  1e-173  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0951  bile acid:sodium symporter  49.49 
 
 
321 aa  287  2e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0236  bile acid:sodium symporter  49.49 
 
 
321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1678  bile acid:sodium symporter  47.08 
 
 
321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2660  Bile acid:sodium symporter  47.08 
 
 
319 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21780  putative transporter  45.95 
 
 
311 aa  278  9e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.919713  normal  0.169757 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1506  Bile acid:sodium symporter  46.43 
 
 
319 aa  277  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.221367  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3145  bile acid:sodium symporter  46.25 
 
 
315 aa  276  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142756  normal  0.0139778 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1227  bile acid:sodium symporter  44.66 
 
 
318 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1857  putative transporter  45.93 
 
 
311 aa  272  7e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0160681  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1540  bile acid:sodium symporter  49.83 
 
 
321 aa  270  2e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  45.13 
 
 
325 aa  268  8e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0050  Bile acid:sodium symporter  48.52 
 
 
312 aa  263  2e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00660635  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2388  bile acid:sodium symporter  45.61 
 
 
305 aa  261  8e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0056492  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2345  bile acid:sodium symporter  45.61 
 
 
305 aa  261  8e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000297919  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3529  bile acid transporter family protein  45.45 
 
 
322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.347083  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3314  bile acid transporter family protein  45.78 
 
 
322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0675599  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3535  bile acid transporter family protein  45.45 
 
 
322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3574  bile acid transporter family protein  45.78 
 
 
322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0718413  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3529  bile acid transporter family protein  45.45 
 
 
322 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000674215 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3277  bile acid transporter family protein  45.13 
 
 
322 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1688  sodium/bile acid transporter family protein  44.34 
 
 
318 aa  250  2e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37024  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3229  bile acid transporter family protein  44.48 
 
 
322 aa  248  8e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1632  sodium/bile acid transporter family protein  42.39 
 
 
299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1736  bile acid transporter family protein  44.48 
 
 
325 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.764529  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1667  bile acid:sodium symporter  42.35 
 
 
321 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0104917  hitchhiker  0.00786387 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2042  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  40.82 
 
 
320 aa  231  9e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2835  sodium-dependent transporter  46.69 
 
 
326 aa  231  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0364013  normal  0.341096 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4097  bile acid:sodium symporter  40.86 
 
 
315 aa  231  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64867  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3898  sodium/bile acid symporter family protein  41.37 
 
 
315 aa  229  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0624185  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2354  Bile acid:sodium symporter  41.07 
 
 
300 aa  228  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1587  bile acid:sodium symporter  40.72 
 
 
315 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1409  Bile acid:sodium symporter  41.64 
 
 
336 aa  224  2e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3274  Bile acid:sodium symporter  40.91 
 
 
329 aa  223  4e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0228  bile acid:sodium symporter  39.02 
 
 
314 aa  221  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0797495  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0445  Bile acid:sodium symporter  42.03 
 
 
334 aa  220  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4480  bile acid:sodium symporter  40.27 
 
 
305 aa  219  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1299  bile acid:sodium symporter  41.37 
 
 
324 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0102  bile acid:sodium symporter  41.45 
 
 
351 aa  220  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3652  bile acid:sodium symporter  42.96 
 
 
309 aa  220  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1365  solute/sodium symporter  39.8 
 
 
344 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1996  Bile acid:sodium symporter  39.41 
 
 
325 aa  216  5e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0066  Bile acid:sodium symporter  42.66 
 
 
309 aa  215  8e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0354306 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2891  bile acid:sodium symporter  37.17 
 
 
316 aa  215  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2588  Bile acid:sodium symporter  41.64 
 
 
322 aa  215  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20150  predicted Na+-dependent transporter  41.58 
 
 
323 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.226359  normal  0.0276347 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0890  Bile acid:sodium symporter  40.75 
 
 
303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5701  Bile acid:sodium symporter  43.98 
 
 
319 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0921  Bile acid:sodium symporter  39.4 
 
 
316 aa  212  7e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215588  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1136  Bile acid:sodium symporter  38.38 
 
 
356 aa  209  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0287814  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0220  bile acid:sodium symporter  39.51 
 
 
303 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3507  bile acid:sodium symporter  39.78 
 
 
308 aa  208  9e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0222  Bile acid:sodium symporter  39.16 
 
 
303 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0522725 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4238  bile acid:sodium symporter  39.16 
 
 
300 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00038302 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03710  predicted Na+-dependent transporter  39.66 
 
 
335 aa  206  4e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4117  bile acid:sodium symporter  37.88 
 
 
303 aa  205  8e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1040  BASS family Na(+)/bile acid symporter  39.59 
 
 
319 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2945  Bile acid:sodium symporter  39.59 
 
 
319 aa  203  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3800  bile acid:sodium symporter  40.79 
 
 
309 aa  202  4e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3925  bile acid:sodium symporter  39.93 
 
 
309 aa  202  6e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1763  sodium-dependent transporter  40.78 
 
 
301 aa  202  7e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00850832  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0353  Na+-dependent transporter-like  39.8 
 
 
320 aa  201  9.999999999999999e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4519  sodium-dependent transporter  39.64 
 
 
308 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0574  bile acid:sodium symporter  38.56 
 
 
321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1633  bile acid:sodium symporter  37.13 
 
 
340 aa  192  5e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4530  bile acid:sodium symporter  40.41 
 
 
313 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.212547 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4446  bile acid:sodium symporter  40.07 
 
 
313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1875  bile acid transporter family protein  39.52 
 
 
334 aa  189  4e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3729  bile acid:sodium symporter  39.93 
 
 
309 aa  189  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.51289 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21970  bile acid transporter  40.27 
 
 
336 aa  189  7e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4131  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  39.21 
 
 
292 aa  188  8e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275751  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2744  Bile acid:sodium symporter  44.6 
 
 
328 aa  188  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0647  sodium-dependent transporter  34.17 
 
 
333 aa  186  5e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00310924  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0093  Bile acid:sodium symporter  38.72 
 
 
334 aa  176  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6460  Bile acid:sodium symporter  34.74 
 
 
350 aa  176  7e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1312  Bile acid:sodium symporter  41.75 
 
 
320 aa  175  8e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0625  sodium/bile acid cotransporter family protein  37.46 
 
 
311 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.667593  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1219  bile acid:sodium symporter  37.33 
 
 
303 aa  172  6.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2047  sodium/bile acid cotransporter family protein  37.97 
 
 
310 aa  171  1e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0419  Bile acid:sodium symporter  38.39 
 
 
350 aa  171  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2456  Bile acid:sodium symporter  36.08 
 
 
368 aa  162  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_4286  predicted protein  36.22 
 
 
319 aa  155  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.717373  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2744  Bile acid:sodium symporter  30.4 
 
 
435 aa  144  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_3046  predicted protein  32.03 
 
 
314 aa  138  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2140  Bile acid:sodium symporter  27.05 
 
 
438 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0367  Na+-dependent transporter-like  30.43 
 
 
307 aa  129  7.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0010  Bile acid:sodium symporter  29.69 
 
 
291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3419  bile acid:sodium symporter  29.66 
 
 
330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1420  sodium symporter  30 
 
 
298 aa  125  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3303  bile acid:sodium symporter  31.41 
 
 
316 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0688105  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0371  bile acid:sodium symporter  31.18 
 
 
335 aa  122  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0981019  normal  0.637314 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5573  Bile acid:sodium symporter  28.74 
 
 
294 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0856  putative Na+-dependent transporter/bile acid symporter  39.52 
 
 
207 aa  115  7.999999999999999e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12281  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  33.59 
 
 
266 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0407  bile acid:sodium symporter  31.02 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.208758  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2861  P3 protein  30.34 
 
 
297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.934917 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3247  bile acid/Na+ symporter family protein  30.57 
 
 
297 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2664  bile acid:sodium symporter  28.52 
 
 
299 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2515  bile acid:sodium symporter  30.57 
 
 
297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.930351  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2679  bile acid:sodium symporter  30.36 
 
 
297 aa  112  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401934  normal  0.860091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>