292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0003 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0003  DNA replication and repair protein RecF  100 
 
 
369 aa  716    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.979634 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0003  DNA replication and repair protein RecF  81.72 
 
 
372 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0003  DNA replication and repair protein RecF  80.38 
 
 
372 aa  570  1e-161  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0003  DNA replication and repair protein RecF  81.18 
 
 
372 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  39.29 
 
 
364 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0002  recombination protein F  41.42 
 
 
365 aa  251  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  38.19 
 
 
364 aa  246  4e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  36.66 
 
 
364 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0003  DNA replication and repair protein RecF  41.47 
 
 
382 aa  240  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  38.52 
 
 
370 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0003  recombination protein F  40.97 
 
 
365 aa  233  5e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0003  recombination protein F  33.97 
 
 
368 aa  211  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00792918  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  33.16 
 
 
375 aa  202  7e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  32.89 
 
 
375 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  32.89 
 
 
375 aa  200  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  32.89 
 
 
375 aa  200  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  32.89 
 
 
375 aa  200  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  33.16 
 
 
375 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  32.35 
 
 
371 aa  199  6e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  32.89 
 
 
375 aa  199  6e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  32.62 
 
 
375 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  32.62 
 
 
375 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  32.62 
 
 
375 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  31.35 
 
 
370 aa  197  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  31.35 
 
 
370 aa  197  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.6 
 
 
372 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.89 
 
 
373 aa  196  5.000000000000001e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  32.26 
 
 
373 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  31.81 
 
 
374 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.32 
 
 
365 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.92 
 
 
386 aa  189  5e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  34.23 
 
 
372 aa  189  9e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  31.56 
 
 
369 aa  188  1e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  27.51 
 
 
362 aa  187  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000115018  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  35.41 
 
 
371 aa  183  4.0000000000000006e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  32 
 
 
374 aa  182  7e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  32.75 
 
 
366 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0003  DNA replication and repair protein  34.69 
 
 
363 aa  179  8e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0241212  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  32.01 
 
 
374 aa  178  2e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0004  DNA replication and repair protein RecF  37.21 
 
 
381 aa  176  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321306  normal  0.933031 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00030  recF protein  34.46 
 
 
376 aa  176  9e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000612951  decreased coverage  0.0000132668 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0004  DNA replication and repair protein RecF  37.61 
 
 
377 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.780515  decreased coverage  0.00205006 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  28.73 
 
 
362 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00040  recombination protein F  37.1 
 
 
390 aa  172  5.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000332989  normal  0.373412 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0003  DNA replication and repair protein RecF  36.08 
 
 
358 aa  172  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  33.04 
 
 
374 aa  170  3e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00040  DNA replication and repair protein RecF  30.65 
 
 
375 aa  170  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0003  DNA repair and genetic recombination protein  30.24 
 
 
365 aa  170  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  32.92 
 
 
359 aa  170  4e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0004  DNA replication and repair protein RecF  38.63 
 
 
374 aa  170  5e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00040  DNA replication and repair protein RecF  37.47 
 
 
390 aa  169  8e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  36.22 
 
 
387 aa  168  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0004  recombination protein F  37.25 
 
 
386 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.187663 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1225  DNA replication and repair protein RecF  36.91 
 
 
349 aa  168  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.193168  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0004  DNA replication and repair protein RecF  36.56 
 
 
397 aa  166  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  27.37 
 
 
369 aa  166  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0824  recombination protein F  36.67 
 
 
389 aa  166  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.81 
 
 
360 aa  166  8e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.447101  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  36.21 
 
 
370 aa  166  8e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000369508  hitchhiker  0.000000145417 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.25 
 
 
370 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0005  DNA replication and repair protein RecF  35.97 
 
 
401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1772  DNA replication and repair protein RecF  34.75 
 
 
371 aa  164  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  25.66 
 
 
376 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0004  recombination protein F  36.54 
 
 
380 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0716162 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0004  recombination protein F  36.54 
 
 
380 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0012  recombination protein F  36.54 
 
 
380 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.121144 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  28.78 
 
 
361 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  28.78 
 
 
361 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1183  DNA replication and repair protein RecF  31.52 
 
 
373 aa  160  3e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00164356  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00030  DNA replication and repair protein RecF  33.68 
 
 
414 aa  160  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0596  DNA replication and repair protein RecF  34.24 
 
 
351 aa  159  5e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0346  recombination protein F  28.38 
 
 
365 aa  159  1e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0004  DNA replication and repair protein RecF  36.62 
 
 
399 aa  159  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.09 
 
 
360 aa  159  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0004  recombination protein F  34.09 
 
 
420 aa  158  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0053  DNA replication and repair protein RecF  36.31 
 
 
347 aa  156  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0042  DNA replication and repair protein RecF  26.57 
 
 
358 aa  156  6e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2250  recombination protein F  36.76 
 
 
387 aa  155  7e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.122677 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  27.15 
 
 
371 aa  156  7e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0004  DNA replication and repair protein RecF  34.86 
 
 
420 aa  155  9e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000011529  hitchhiker  0.000000444236 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0003  recombination protein F  37.5 
 
 
371 aa  155  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1094  recombination protein F  34.2 
 
 
380 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1123  recombination protein F  34.2 
 
 
380 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.633638 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0018  RecF protein  28.49 
 
 
363 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1725  recombination protein F  32.91 
 
 
390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.09 
 
 
397 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00030  DNA replication and repair protein RecF  38.58 
 
 
404 aa  152  5.9999999999999996e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0004  DNA replication and repair protein RecF  36.98 
 
 
379 aa  151  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0005  recombination protein F  37.85 
 
 
377 aa  152  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000288317  hitchhiker  0.00404548 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.24 
 
 
360 aa  151  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0698954  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10003  recombination protein F  36.69 
 
 
385 aa  150  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2998  DNA replication and repair protein RecF  36.2 
 
 
357 aa  150  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0957887  normal  0.356139 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0003  recombination protein F  31.06 
 
 
361 aa  150  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279219  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0005  recombination protein F  31.82 
 
 
367 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0004  recombination protein F  33.16 
 
 
402 aa  150  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000215476 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5273  recombination protein F  30.93 
 
 
384 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0402761 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0003  recombination protein F  31.82 
 
 
367 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113705  normal  0.121048 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0012  recombination protein F  31.82 
 
 
367 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000250595 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0004  recombination protein F  32.98 
 
 
401 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.582462  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00040  DNA replication and repair protein RecF  33.33 
 
 
414 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>