113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0187 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0187  peptidase M28  100 
 
 
356 aa  744    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0052  peptidase M28  37.97 
 
 
308 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000295021 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0054  peptidase M28  36.08 
 
 
335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1976  peptidase M28  36.24 
 
 
347 aa  194  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.242432  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3011  peptidase M28  31.64 
 
 
325 aa  150  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844179  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3053  peptidase M28  31.64 
 
 
325 aa  150  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.387481 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1386  peptidase M28  35.08 
 
 
323 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.492148  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2420  M28A family peptidase  35.08 
 
 
323 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.564351  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2428  M28 family peptidase  35.56 
 
 
273 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1307  peptidase M28  31.6 
 
 
299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0681394  normal  0.0392161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3437  peptidase M28  32.17 
 
 
453 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160047 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3438  peptidase M28  32.05 
 
 
321 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.346638  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0019  hypothetical protein  33.96 
 
 
319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0754  peptidase M28  27.52 
 
 
339 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.050482 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1467  peptidase M28  25.91 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3219  peptidase M28  28.03 
 
 
306 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.115329  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1044  peptidase M28  29.11 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0202745 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  25.98 
 
 
333 aa  69.3  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0920  peptidases M20 and M28  27.13 
 
 
282 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0660  hypothetical protein  25.2 
 
 
568 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61826 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  36.88 
 
 
309 aa  61.6  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  27.23 
 
 
775 aa  60.8  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  23.58 
 
 
1247 aa  60.1  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2164  peptidase M28  36.67 
 
 
512 aa  59.7  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.502107  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  32.77 
 
 
466 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  32.77 
 
 
466 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3374  hypothetical protein  22.88 
 
 
476 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0508877  normal  0.0110235 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3155  peptidase M28  34.48 
 
 
436 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000680764  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  32.77 
 
 
466 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  32.77 
 
 
466 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04290  hypothetical protein  30.36 
 
 
647 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00560134  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0419  hypothetical protein  30.36 
 
 
647 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  32.77 
 
 
465 aa  57.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0003  peptidase M28  25.91 
 
 
319 aa  57.4  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  32.77 
 
 
466 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0652  hypothetical protein  24.15 
 
 
591 aa  57  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  24.56 
 
 
1103 aa  57  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  32.77 
 
 
466 aa  56.6  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  32.77 
 
 
466 aa  56.6  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  22.83 
 
 
325 aa  56.2  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  23.65 
 
 
322 aa  56.6  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  26.15 
 
 
574 aa  56.2  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  32.48 
 
 
466 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  32.48 
 
 
466 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1748  peptidase M28  27.67 
 
 
430 aa  54.7  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10643  Probable aminopeptidase fused to fibronectin type 3 domain  30.4 
 
 
450 aa  54.3  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  30.25 
 
 
466 aa  52.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0637  peptidase M28  25 
 
 
352 aa  52.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  25.74 
 
 
598 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0578  peptidase M28  26.7 
 
 
373 aa  51.2  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.43286  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0815  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  26.51 
 
 
357 aa  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1065  peptidase M28  33.61 
 
 
455 aa  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.377443  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  34.27 
 
 
502 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  32.58 
 
 
424 aa  50.4  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1040  peptidase M28  23.5 
 
 
320 aa  49.7  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  22.86 
 
 
434 aa  49.3  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  25.41 
 
 
394 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0487  putative leucine aminopeptidase  28.97 
 
 
408 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2124  aminopeptidase  28.97 
 
 
408 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1852  leucine aminopeptidase, putative  28.97 
 
 
408 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0188761  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0694  putative leucine aminopeptidase  28.97 
 
 
384 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.832714  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0990  putative leucine aminopeptidase  28.97 
 
 
384 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0845  peptidase family protein  28.97 
 
 
384 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.292004  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1962  putative leucine aminopeptidase  28.97 
 
 
384 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  25.1 
 
 
342 aa  48.1  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4028  peptidase M28  27.24 
 
 
353 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03479  probable aminopeptidase fused to fibronectin type 3 domain  32.43 
 
 
468 aa  48.5  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0809  peptidase M28  23.26 
 
 
625 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0757  peptidase family protein  28.04 
 
 
408 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  22.8 
 
 
420 aa  47  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4339  peptidase M28  33.33 
 
 
815 aa  47  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  22.26 
 
 
319 aa  47  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  34.09 
 
 
391 aa  46.6  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3224  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  29.23 
 
 
347 aa  46.6  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5560  peptidase M28  29.01 
 
 
437 aa  46.2  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3608  peptidase M28  32.56 
 
 
472 aa  45.8  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3859  peptidase M28  31.4 
 
 
478 aa  45.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1875  peptidase M28  32.95 
 
 
509 aa  45.8  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5675  peptidase M28  35.71 
 
 
457 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00555231 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  25.48 
 
 
491 aa  45.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3786  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  37.5 
 
 
1131 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550121  normal  0.857915 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  29.8 
 
 
319 aa  44.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5001  leucyl aminopeptidase  26.27 
 
 
417 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.341623  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  25.38 
 
 
525 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  25.74 
 
 
398 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  40.58 
 
 
555 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4476  leucyl aminopeptidase  26.27 
 
 
417 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3756  peptidase M28  25.74 
 
 
386 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0553  peptidase M28  25.74 
 
 
384 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0134  peptidase M28  29.9 
 
 
314 aa  44.7  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  28.91 
 
 
512 aa  43.9  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0596  aminopeptidase Ap1  27.97 
 
 
417 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7813  allantoate amidohydrolase  29.9 
 
 
415 aa  43.9  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0935  peptidase M28  30.14 
 
 
345 aa  43.5  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1949  peptidase M28  33.33 
 
 
439 aa  43.5  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  27.97 
 
 
417 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  27.97 
 
 
417 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  27.97 
 
 
417 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2891  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  30.14 
 
 
345 aa  43.5  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3054  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  30.14 
 
 
345 aa  43.5  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.957011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>