35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0019 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0019  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  662    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0187  peptidase M28  33.96 
 
 
356 aa  110  3e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1976  peptidase M28  38.46 
 
 
347 aa  87  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.242432  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0054  peptidase M28  29.83 
 
 
335 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0052  peptidase M28  29.61 
 
 
308 aa  72  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000295021 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3053  peptidase M28  29.17 
 
 
325 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.387481 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3011  peptidase M28  29.17 
 
 
325 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844179  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  27.92 
 
 
1247 aa  60.8  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2420  M28A family peptidase  28.43 
 
 
323 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.564351  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1386  peptidase M28  28.43 
 
 
323 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.492148  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3437  peptidase M28  28.74 
 
 
453 aa  55.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160047 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2428  M28 family peptidase  31.13 
 
 
273 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1307  peptidase M28  27.88 
 
 
299 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0681394  normal  0.0392161 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2164  peptidase M28  29.1 
 
 
512 aa  48.9  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.502107  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3219  peptidase M28  29.85 
 
 
306 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.115329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2848  aminopeptidase  37.23 
 
 
457 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000136315 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16010  predicted aminopeptidase  27.85 
 
 
335 aa  47.4  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.964199  hitchhiker  0.000000285922 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1467  peptidase M28  31.4 
 
 
305 aa  47.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  36.92 
 
 
450 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1748  peptidase M28  27.62 
 
 
430 aa  45.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  38.98 
 
 
466 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  38.98 
 
 
466 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  38.98 
 
 
466 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0754  peptidase M28  32.14 
 
 
339 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.050482 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  38.98 
 
 
466 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  38.98 
 
 
466 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  38.98 
 
 
466 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1155  peptidase M28  40.91 
 
 
462 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.447711  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  38.98 
 
 
466 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5675  peptidase M28  40.24 
 
 
457 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00555231 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  37.29 
 
 
465 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3438  peptidase M28  26.88 
 
 
321 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.346638  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1044  peptidase M28  28.93 
 
 
306 aa  43.5  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0202745 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  35.59 
 
 
466 aa  43.1  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  26.4 
 
 
1103 aa  42.7  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>