More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5881 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 304 aa  578  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  59.27 
 
 		 324 aa  312  4.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  56.31 
 
 		 316 aa  289  3e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  57.34 
 
 		 300 aa  275  9e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  53.24 
 
 		 301 aa  253  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  50 
 
 		 301 aa  249  3e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0807  transcriptional regulator, LysR family  44.93 
 
 		 304 aa  219  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  47.49 
 
 		 308 aa  219  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  40.6 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  34.84 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 301 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  40.41 
 
 		 287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  36.75 
 
 		 291 aa  162  9e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 300 aa  155  9e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  37.76 
 
 		 298 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2822  transcriptional regulator, LysR family  37.99 
 
 		 310 aa  149  5e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.438739  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 300 aa  149  8e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  37.41 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  43.32 
 
 		 350 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  40.86 
 
 		 300 aa  143  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 302 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 306 aa  142  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 296 aa  142  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  36.76 
 
 		 328 aa  142  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 308 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  36.59 
 
 		 311 aa  139  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  35.67 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  35.02 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  40.8 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  39.84 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  34.45 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  37.77 
 
 		 308 aa  135  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 305 aa  135  8e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  35.87 
 
 		 301 aa  135  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22480  transcriptional regulator  39.04 
 
 		 308 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.542371 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 288 aa  134  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  36.95 
 
 		 309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  36.49 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  38.51 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3675  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2872  transcriptional regulator, LysR family  34.65 
 
 		 302 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 313 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0582  transcriptional regulator, LysR family  36.42 
 
 		 312 aa  129  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  34.31 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  36.15 
 
 		 331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  34.12 
 
 		 303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  33.67 
 
 		 314 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  34.98 
 
 		 333 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  36.86 
 
 		 294 aa  126  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3886  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 311 aa  125  9e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3856  transcriptional regulator, LysR family  37.68 
 
 		 313 aa  124  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0129  transcriptional regulator, LysR family  36.1 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00685914  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  40.8 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 304 aa  123  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4403  LysR substrate-binding protein  35.07 
 
 		 303 aa  122  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.900242  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 292 aa  122  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  33.79 
 
 		 310 aa  122  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  33.9 
 
 		 316 aa  122  9e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6871  LysR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 283 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0838  LysR family transcriptional regulator  22.71 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00258172  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  34.59 
 
 		 301 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3713  LysR family transcriptional regulator  36.01 
 
 		 334 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  37.12 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0208  transcriptional regulator, LysR family  35.55 
 
 		 301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  30.41 
 
 		 312 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9290  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 311 aa  116  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  34.9 
 
 		 288 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  36.07 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  34.69 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17190  transcriptional regulator  33.11 
 
 		 308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00132066  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  37.07 
 
 		 308 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  36.14 
 
 		 295 aa  112  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5567  tartrate utilization transcriptional regulator  33.58 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.879392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  36.03 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3090  transcriptional regulator, LysR family  36.73 
 
 		 283 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1309  LysR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120853  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2639  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1779  hydrogen peroxide-inducible genes activator  28.23 
 
 		 296 aa  108  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3999  transcriptional regulator, LysR family  34.34 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03200  transcriptional regulator  31.99 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4100  transcriptional regulator, LysR family  32.58 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2616  transcriptional regulator, LysR family  36.08 
 
 		 306 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000734486  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1352  transcriptional regulator, LysR family  30.39 
 
 		 303 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000043904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1778  hydrogen peroxide-inducible genes activator  28.23 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1897  transcriptional regulator, LysR family  34.05 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0474391 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3401  LysR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185395  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34330  transcriptional regulator  34.11 
 
 		 308 aa  106  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0637  transcriptional regulator, LysR family  28 
 
 		 312 aa  105  9e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000713061  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1027  transcriptional regulator, LysR family  30.39 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  29.24 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>