More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1961 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  100 
 
 		 399 aa  789    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  60.9 
 
 		 399 aa  461  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  59.41 
 
 		 406 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  59.41 
 
 		 406 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  59.41 
 
 		 406 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  56.4 
 
 		 406 aa  444  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  57.25 
 
 		 406 aa  425  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  51.13 
 
 		 399 aa  362  8e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  48.97 
 
 		 401 aa  357  1.9999999999999998e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  48.09 
 
 		 430 aa  331  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  46.63 
 
 		 408 aa  329  6e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  45.45 
 
 		 408 aa  326  5e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  47.68 
 
 		 395 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  46.59 
 
 		 423 aa  315  9.999999999999999e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  49.13 
 
 		 394 aa  311  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  44.25 
 
 		 405 aa  308  9e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  45.91 
 
 		 401 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  47.72 
 
 		 400 aa  307  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  46.07 
 
 		 400 aa  300  4e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  44.39 
 
 		 400 aa  298  8e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5801  cytochrome P450  47.34 
 
 		 395 aa  298  9e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0291832  normal  0.365285 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1407  cytochrome P450  44.16 
 
 		 388 aa  296  5e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  44.16 
 
 		 409 aa  294  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  45.07 
 
 		 410 aa  293  5e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  44.58 
 
 		 414 aa  293  5e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  44.65 
 
 		 399 aa  292  6e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2535  cytochrome P450  42.97 
 
 		 423 aa  291  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369164  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  43.12 
 
 		 421 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  42.71 
 
 		 408 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  40.74 
 
 		 403 aa  283  4.0000000000000003e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  45.43 
 
 		 436 aa  282  7.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  46.93 
 
 		 357 aa  277  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  42.64 
 
 		 400 aa  275  7e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  40.73 
 
 		 400 aa  273  5.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  42.05 
 
 		 407 aa  271  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  41.31 
 
 		 416 aa  269  5.9999999999999995e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  45.91 
 
 		 345 aa  269  7e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3276  cytochrome P450  39.36 
 
 		 407 aa  269  7e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.684608  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  41.04 
 
 		 405 aa  269  8e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  42.04 
 
 		 400 aa  268  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  39.34 
 
 		 407 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  39.34 
 
 		 407 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  39.23 
 
 		 407 aa  261  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  39.76 
 
 		 408 aa  261  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  42.11 
 
 		 400 aa  259  5.0000000000000005e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  41.51 
 
 		 394 aa  258  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  39.03 
 
 		 405 aa  256  4e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  41.12 
 
 		 424 aa  256  6e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2524  cytochrome P450  43.61 
 
 		 405 aa  256  6e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  39.14 
 
 		 404 aa  253  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  40.51 
 
 		 412 aa  250  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  39.75 
 
 		 398 aa  251  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  41.4 
 
 		 409 aa  251  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  40.93 
 
 		 402 aa  250  4e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  37.44 
 
 		 411 aa  249  5e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  39.29 
 
 		 397 aa  249  9e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  36.39 
 
 		 411 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  39.64 
 
 		 398 aa  243  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  35.92 
 
 		 409 aa  241  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  38.78 
 
 		 401 aa  241  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  39.7 
 
 		 411 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  39.95 
 
 		 408 aa  239  5e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  40.3 
 
 		 391 aa  239  9e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  35.44 
 
 		 409 aa  238  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  36.82 
 
 		 415 aa  237  3e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  37.66 
 
 		 407 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  39.53 
 
 		 395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  39.23 
 
 		 400 aa  234  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  38.81 
 
 		 417 aa  233  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  39.78 
 
 		 398 aa  233  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3692  cytochrome P450  37.53 
 
 		 397 aa  233  5e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  37.25 
 
 		 402 aa  233  6e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  37.06 
 
 		 410 aa  232  9e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  39.49 
 
 		 429 aa  230  4e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  37.89 
 
 		 405 aa  229  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  35.71 
 
 		 412 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  35.71 
 
 		 412 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4201  cytochrome P450  37.02 
 
 		 421 aa  229  6e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4267  cytochrome P450  37.02 
 
 		 421 aa  229  6e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.476691  normal  0.954738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4428  cytochrome P450  37.02 
 
 		 421 aa  229  6e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392257  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  37.08 
 
 		 412 aa  229  9e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  35.45 
 
 		 412 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  36.76 
 
 		 395 aa  226  5.0000000000000005e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4429  cytochrome P450  35.86 
 
 		 413 aa  226  5.0000000000000005e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2105  cytochrome P450  35.87 
 
 		 407 aa  223  4e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34341  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  36.36 
 
 		 409 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  37.89 
 
 		 400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0945  putative cytochrome P450  37.53 
 
 		 410 aa  220  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  39.8 
 
 		 423 aa  220  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  34.24 
 
 		 411 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  36.78 
 
 		 426 aa  219  7e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  34.51 
 
 		 411 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  34.57 
 
 		 411 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  33.79 
 
 		 411 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3241  cytochrome P450  36.93 
 
 		 415 aa  218  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  35.62 
 
 		 411 aa  216  4e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  38.48 
 
 		 410 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  38.62 
 
 		 402 aa  216  7e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  34.31 
 
 		 411 aa  216  8e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  34.31 
 
 		 411 aa  216  8e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>